66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1241 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1241  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  340  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000128773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1201  hypothetical protein  95.12 
 
 		 164 aa  324  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4078  hypothetical protein  93.9 
 
 		 164 aa  319  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1639  hypothetical protein  93.29 
 
 		 164 aa  318  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3706  hypothetical protein  80.49 
 
 		 164 aa  280  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4234  hypothetical protein  79.88 
 
 		 164 aa  278  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1683  peptidase, SprT family  79.88 
 
 		 164 aa  274  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.781786  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2966  hypothetical protein  74.39 
 
 		 164 aa  257  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0041354  normal  0.102756 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4190  hypothetical protein  73.46 
 
 		 165 aa  249  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49060  hypothetical protein  72.84 
 
 		 165 aa  247  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203632  hitchhiker  0.000000135384 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33250  hypothetical protein  68.29 
 
 		 164 aa  238  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.115665  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3330  hypothetical protein  48.03 
 
 		 201 aa  147  8e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0277435  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0834  hypothetical protein  48.37 
 
 		 206 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0692  hypothetical protein  48.03 
 
 		 201 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000345273  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3442  hypothetical protein  48.34 
 
 		 201 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000887757  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3159  protein of unknown function DUF335, SprT  47.68 
 
 		 219 aa  142  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000619203  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0836  protein of unknown function DUF335 SprT  47.02 
 
 		 219 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00977603  hitchhiker  0.0000107184 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3524  hypothetical protein  46.36 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204925  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0811  protein of unknown function DUF335 SprT  46.36 
 
 		 219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000376161  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3222  protein of unknown function DUF335, SprT  47.4 
 
 		 203 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00097264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0843  protein of unknown function DUF335 SprT  45.03 
 
 		 218 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0209179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4132  protein of unknown function DUF335 SprT  45.33 
 
 		 212 aa  133  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.047618 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2229  protein of unknown function DUF335 SprT  40 
 
 		 174 aa  132  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.354031  normal  0.796923 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01642  hypothetical protein  38.82 
 
 		 151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03570  hypothetical protein  38.06 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2972  hypothetical protein  45.33 
 
 		 219 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.609934  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3970  protein of unknown function DUF335, SprT  41.61 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002465  protein SprT  39.35 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1624  hypothetical protein  37.66 
 
 		 169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0545  protein of unknown function DUF335, SprT  40.67 
 
 		 203 aa  117  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.510358  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3228  protein of unknown function DUF335, SprT  36.77 
 
 		 162 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0602  protein of unknown function DUF335 SprT  40.79 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0577  sprT protein, putative  41.73 
 
 		 184 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00218492  normal  0.10682 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0551  hypothetical protein  38.93 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2368  protein of unknown function DUF335, SprT  36.94 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0781299  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0023  hypothetical protein  35.48 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0864  hypothetical protein  40 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0548  hypothetical protein  35.62 
 
 		 170 aa  95.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000220186  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0505  hypothetical protein  32.93 
 
 		 170 aa  90.5  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000160029  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3708  hypothetical protein  33.77 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000576402  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3348  hypothetical protein  34.16 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000288279  decreased coverage  0.00213814 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3906  hypothetical protein  32.45 
 
 		 170 aa  89  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000939538  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3376  hypothetical protein  36.36 
 
 		 165 aa  88.2  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3346  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  88.6  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4023  hypothetical protein  33.73 
 
 		 170 aa  88.2  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000235855  decreased coverage  0.000372984 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3287  hypothetical protein  36.36 
 
 		 165 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.717112  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0751  protein of unknown function DUF335 SprT  36.36 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.067857  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02737  hypothetical protein  36.36 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208868  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0842  hypothetical protein  32.69 
 
 		 187 aa  88.2  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000365146  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3102  hypothetical protein  36.36 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0840  hypothetical protein  32.69 
 
 		 170 aa  88.2  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02774  hypothetical protein  36.36 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.110605  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3086  hypothetical protein  35.66 
 
 		 165 aa  87.8  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0374593  hitchhiker  0.00021739 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0770  hypothetical protein  36.36 
 
 		 151 aa  87.8  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000227359  hitchhiker  0.0000931266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4247  hypothetical protein  35.66 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.397141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3331  hypothetical protein  34.27 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10575  normal  0.425008 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3266  hypothetical protein  34.27 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.005885  normal  0.0446452 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3255  hypothetical protein  34.27 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000006136  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3435  hypothetical protein  34.27 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0526499  hitchhiker  0.00365775 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3339  hypothetical protein  34.27 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00105383  normal  0.150558 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1552  protein of unknown function DUF335, SprT  38.73 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0472621  normal  0.956048 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0324  protein of unknown function DUF335 SprT  35.06 
 
 		 196 aa  74.3  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0077532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1712  protein of unknown function DUF335, SprT  31.52 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0501  hypothetical protein  30.86 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00000572187  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1439  protein of unknown function SprT  26.79 
 
 		 193 aa  44.3  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676682 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0451  hypothetical protein  38.18 
 
 		 198 aa  40.4  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>