19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1875 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1875  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  415  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0451  hypothetical protein  61.93 
 
 		 198 aa  275  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05440  hypothetical protein  60.1 
 
 		 199 aa  248  4e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3826  hypothetical protein  40 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.591027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6604  hypothetical protein  36.36 
 
 		 206 aa  138  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5948  hypothetical protein  34.65 
 
 		 204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3070  hypothetical protein  36.9 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.978048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4245  hypothetical protein  34.85 
 
 		 253 aa  112  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33250  hypothetical protein  44.44 
 
 		 164 aa  45.1  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.115665  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2368  protein of unknown function DUF335, SprT  60 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0781299  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0602  protein of unknown function DUF335 SprT  48.78 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0501  hypothetical protein  37.5 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00000572187  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3346  hypothetical protein  46.88 
 
 		 187 aa  42.4  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0842  hypothetical protein  46.88 
 
 		 187 aa  42.4  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000365146  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0840  hypothetical protein  41.86 
 
 		 170 aa  42.4  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4023  hypothetical protein  46.88 
 
 		 170 aa  41.6  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000235855  decreased coverage  0.000372984 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2229  protein of unknown function DUF335 SprT  48.57 
 
 		 174 aa  41.6  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.354031  normal  0.796923 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3228  protein of unknown function DUF335, SprT  50 
 
 		 162 aa  41.2  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1624  hypothetical protein  43.75 
 
 		 169 aa  41.2  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>