16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05440 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_05440  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  410  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0451  hypothetical protein  65.48 
 
 
198 aa  277  8e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1875  hypothetical protein  60.1 
 
 
199 aa  248  4e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3826  hypothetical protein  40.62 
 
 
204 aa  157  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.591027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6604  hypothetical protein  38.89 
 
 
206 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5948  hypothetical protein  33.83 
 
 
204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4245  hypothetical protein  34.98 
 
 
253 aa  122  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3070  hypothetical protein  34.76 
 
 
206 aa  114  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.978048  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33250  hypothetical protein  64.29 
 
 
164 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.115665  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2229  protein of unknown function DUF335 SprT  46.94 
 
 
174 aa  46.6  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.354031  normal  0.796923 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1624  hypothetical protein  39.44 
 
 
169 aa  42  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03570  hypothetical protein  54.29 
 
 
165 aa  42  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1439  protein of unknown function SprT  30.43 
 
 
193 aa  41.6  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000676682 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3524  hypothetical protein  46 
 
 
218 aa  41.2  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204925  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4234  hypothetical protein  59.26 
 
 
164 aa  41.2  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2972  hypothetical protein  51.43 
 
 
219 aa  41.2  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.609934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>