229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1971 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1971  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2267  hypothetical protein  96.72 
 
 		 183 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1967  hypothetical protein  77.6 
 
 		 183 aa  305  3e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2209  hypothetical protein  75.96 
 
 		 183 aa  301  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2090  hypothetical protein  74.86 
 
 		 183 aa  298  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.363519  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2721  hypothetical protein  76.5 
 
 		 183 aa  297  6e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6916  hitchhiker  0.00284611 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2345  hypothetical protein  74.32 
 
 		 183 aa  297  7e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000126395  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1981  hypothetical protein  74.32 
 
 		 183 aa  297  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959579  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1407  hypothetical protein  70.49 
 
 		 183 aa  275  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1423  hypothetical protein  70.49 
 
 		 183 aa  275  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.566409 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2050  hypothetical protein  70.49 
 
 		 183 aa  274  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.658191  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1879  hypothetical protein  69.95 
 
 		 183 aa  273  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000572902  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1390  hypothetical protein  70.49 
 
 		 183 aa  273  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  71.04 
 
 		 183 aa  271  3e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01734  predicted oxidoreductase  71.04 
 
 		 183 aa  271  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00353733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1877  nitroreductase  71.04 
 
 		 183 aa  271  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380394  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1867  hypothetical protein  71.04 
 
 		 183 aa  271  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0147803  decreased coverage  0.00000404862 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1849  hypothetical protein  71.04 
 
 		 183 aa  271  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000672951  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01722  hypothetical protein  71.04 
 
 		 183 aa  271  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00796019  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2485  hypothetical protein  71.04 
 
 		 183 aa  271  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.297695 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1988  hypothetical protein  71.04 
 
 		 183 aa  271  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00470911  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1426  hypothetical protein  70.49 
 
 		 183 aa  270  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00297236  normal  0.808801 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1682  hypothetical protein  65.03 
 
 		 183 aa  251  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.5074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002916  protein ydjA  55.19 
 
 		 182 aa  210  7e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0566  hypothetical protein  54.1 
 
 		 182 aa  211  7e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1617  nitroreductase  53.85 
 
 		 183 aa  193  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1833  nitroreductase  50.82 
 
 		 182 aa  184  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0967243  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01646  putative nitroreductase  49.16 
 
 		 183 aa  181  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00644737  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1740  nitroreductase  48.09 
 
 		 182 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1665  nitroreductase  49.1 
 
 		 182 aa  175  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03042  hypothetical protein  52.75 
 
 		 182 aa  173  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2304  nitroreductase  49.1 
 
 		 182 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0131618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2494  nitroreductase  48.5 
 
 		 182 aa  170  9e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.838709  hitchhiker  0.00693244 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2374  nitroreductase  48.5 
 
 		 182 aa  170  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.611093  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1800  nitroreductase  44.26 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.493936  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1808  nitroreductase  44.26 
 
 		 182 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2478  nitroreductase  44.26 
 
 		 182 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1457  nitroreductase family protein  50.9 
 
 		 182 aa  167  8e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2708  nitroreductase family protein  44.81 
 
 		 182 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2747  nitroreductase  44.81 
 
 		 182 aa  166  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.501163 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1847  nitroreductase  44.26 
 
 		 182 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2315  nitroreductase  47.9 
 
 		 182 aa  167  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0909  nitroreductase family protein  42.47 
 
 		 184 aa  166  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.968398  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1532  nitroreductase  44.91 
 
 		 182 aa  164  9e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1891  nitroreductase  46.11 
 
 		 182 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1354  nitroreductase  46.95 
 
 		 186 aa  154  8e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000836569  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  43.65 
 
 		 185 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  43.65 
 
 		 185 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3795  nitroreductase  42.54 
 
 		 185 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000177685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  43.09 
 
 		 185 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2590  nitroreductase family protein  42.13 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1480  nitroreductase  41.76 
 
 		 188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0228393  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  40.11 
 
 		 186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  39.56 
 
 		 186 aa  144  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1802  nitroreductase family protein  39.56 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649607  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3592  nitroreductase  39.01 
 
 		 186 aa  141  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0449801  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02400  nitroreductase  43.45 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305369  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  40.36 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15580  Nitroreductase  42.77 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.978849  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4233  nitroreductase  37.43 
 
 		 209 aa  118  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.064349  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0930  nitroreductase  36.81 
 
 		 235 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0077  nitroreductase  38.89 
 
 		 196 aa  114  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2674  nitroreductase  36.36 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1095  nitroreductase  34.07 
 
 		 219 aa  111  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1101  nitroreductase  33.71 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  35.26 
 
 		 221 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1818  nitroreductase  37.2 
 
 		 208 aa  108  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5206  hypothetical protein  31.02 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2199  nitroreductase  33.52 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1287  aldehyde dehydrogenase  31.87 
 
 		 219 aa  104  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1668  nitroreductase  28.65 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145589  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1495  hypothetical protein  35.87 
 
 		 187 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0669321 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0671  nitroreductase family protein  36.05 
 
 		 207 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2050  nitroreductase family protein  36.05 
 
 		 207 aa  101  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1923  nitroreductase family protein  36.93 
 
 		 207 aa  101  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1061  nitroreductase  34.97 
 
 		 208 aa  101  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.425769  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1783  nitroreductase family protein  36.05 
 
 		 207 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0775  nitroreductase family protein  36.05 
 
 		 207 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1068  nitroreductase family protein  36.05 
 
 		 207 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2043  nitroreductase family protein  36.05 
 
 		 207 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.144976  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2036  nitroreductase  29.41 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378927  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0850  nitroreductase  32.42 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.811499  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0953  nitroreductase  36.81 
 
 		 193 aa  99.8  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0968  hypothetical protein  31.87 
 
 		 191 aa  99.4  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3888  nitroreductase  34.44 
 
 		 169 aa  97.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3262  nitroreductase  31.55 
 
 		 191 aa  97.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.0279896 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1618  nitroreductase  33.73 
 
 		 195 aa  97.1  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0762  nitroreductase family protein  34.88 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1004  nitroreductase  32.53 
 
 		 191 aa  96.3  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.97914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3123  nitroreductase  31.82 
 
 		 187 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6294  nitroreductase  34.55 
 
 		 187 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167962  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0173  nitroreductase  35.84 
 
 		 191 aa  94.7  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000256246 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0450  nitroreductase  29.35 
 
 		 187 aa  94.4  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2163  nitroreductase  32.89 
 
 		 169 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0519328 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1011  nitroreductase  33.95 
 
 		 212 aa  93.2  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2627  hypothetical protein  35.37 
 
 		 216 aa  93.2  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.632412  normal  0.0266361 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3637  nitroreductase  32.34 
 
 		 192 aa  92.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1069  nitroreductase family protein  32.73 
 
 		 194 aa  92  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600572  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3161  nitroreductase  31.9 
 
 		 195 aa  92  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.497099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4587  nitroreductase  33.53 
 
 		 228 aa  91.7  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>