64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0393 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_0393  secretory lipase  100 
 
 
386 aa  793  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0474  secretory lipase  76.6 
 
 
376 aa  591  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3995  secretory lipase  43.58 
 
 
427 aa  270  3e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0441069 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3524  secretory lipase  42.74 
 
 
427 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3330  secretory lipase  43.73 
 
 
407 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2614  secretory lipase  43.02 
 
 
427 aa  244  2e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2321  secretory lipase family protein  39.49 
 
 
410 aa  232  8e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65291  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1013  putative secretory lipase  39.2 
 
 
410 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1100  putative secretory lipase  39.2 
 
 
410 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0329  secretory lipase  37.61 
 
 
417 aa  226  5e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282596 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0585  secretory lipase family protein  38.18 
 
 
426 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566733  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0883  secretory lipase family protein  38.18 
 
 
377 aa  206  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.644932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1850  secretory lipase family protein  38.18 
 
 
377 aa  206  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1352  hypothetical protein  37.97 
 
 
388 aa  184  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0264  secretory lipase  34.85 
 
 
395 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0733  putative exported lipase  33.78 
 
 
397 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1963  secretory lipase  35.31 
 
 
399 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1917  secretory lipase  35.31 
 
 
399 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146897  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2478  secretory lipase  34.72 
 
 
379 aa  167  3e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1897  secretory lipase  34.46 
 
 
382 aa  165  1e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3922  secretory lipase  33.15 
 
 
366 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0253176  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2256  secretory lipase  31.49 
 
 
397 aa  139  9e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454748  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2000  secretory lipase  31.18 
 
 
385 aa  130  5e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.524449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0910  secretory lipase  30.84 
 
 
346 aa  122  1e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.307152 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3161  hypothetical protein  31.18 
 
 
400 aa  121  2e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1520  secretory lipase  29.46 
 
 
376 aa  116  8e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0584  secretory lipase  26.87 
 
 
413 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3563  secretory lipase  37.5 
 
 
383 aa  103  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.668389  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0972  secretory lipase  28.21 
 
 
375 aa  96.7  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441802  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  28.99 
 
 
417 aa  94.4  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3821  secretory lipase  37.5 
 
 
420 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583502  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2597  secretory lipase  42.37 
 
 
405 aa  90.9  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1435  secretory lipase  28.27 
 
 
433 aa  79.7  9e-14  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.765919  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0030  secretory lipase  25.36 
 
 
442 aa  77.8  3e-13  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1063  secretory lipase  32.05 
 
 
409 aa  75.9  1e-12  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.108571  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38210  acetyl esterase (deacetylase)  34.13 
 
 
415 aa  71.2  3e-11  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0321  Triacylglycerol lipase  25.34 
 
 
444 aa  69.7  8e-11  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3126  secretory lipase  27.99 
 
 
406 aa  68.2  2e-10  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0242733  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02050  Secretory lipase  37.7 
 
 
451 aa  67.8  3e-10  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4826  Triacylglycerol lipase  26.63 
 
 
392 aa  63.5  5e-09  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02951  hypothetical protein  29.09 
 
 
426 aa  63.5  6e-09  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1203  secretory lipase  25.15 
 
 
434 aa  62  2e-08  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0550  secretory lipase  27.22 
 
 
432 aa  59.7  7e-08  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.70438  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1828  hypothetical protein  35.37 
 
 
538 aa  59.3  1e-07  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.637727 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1869  hypothetical protein  36.09 
 
 
422 aa  58.9  1e-07  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.931797  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1796  putative secreted lipase  31.82 
 
 
422 aa  58.5  2e-07  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1338  triacylglycerol lipase  35.54 
 
 
433 aa  57  5e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1356  triacylglycerol lipase  35.54 
 
 
433 aa  57  5e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1795  putative secreted lipase  35.82 
 
 
420 aa  57.4  5e-07  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325361  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1374  triacylglycerol lipase  35.54 
 
 
433 aa  57  6e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141016  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1355  hypothetical protein  29 
 
 
424 aa  55.1  2e-06  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.158226  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1291  putative secreted lipase  28.35 
 
 
424 aa  53.1  7e-06  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0388  Triacylglycerol lipase  29.45 
 
 
422 aa  52.8  1e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3188  Triacylglycerol lipase  29.75 
 
 
464 aa  49.7  9e-05  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0920741  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2422  putative exported lipase  31.54 
 
 
201 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5090  hypothetical protein  29.45 
 
 
527 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0016  secretory lipase  23.99 
 
 
367 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4975  hypothetical protein  25.94 
 
 
401 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52355  hitchhiker  6.64128e-08 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6867  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  31.03 
 
 
304 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0759  secretory lipase  24.73 
 
 
470 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5769  esterase  27.27 
 
 
527 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0465  secretory lipase  27.15 
 
 
439 aa  43.9  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4125  hypothetical protein  28.1 
 
 
528 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01799  secretory lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00110)  28 
 
 
450 aa  43.1  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0803381  normal  0.696532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>