59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0381 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0381  phosphotransferase KptA/Tpt1  100 
 
 		 186 aa  388  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0438  phosphotransferase KptA/Tpt1  69.71 
 
 		 180 aa  259  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4931  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  60.92 
 
 		 184 aa  228  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04163  hypothetical protein  60.92 
 
 		 184 aa  228  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000225053  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3665  Phosphate acetyltransferase  60.92 
 
 		 184 aa  228  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000562336  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04200  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  60.92 
 
 		 184 aa  228  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000393415  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4774  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  61.49 
 
 		 184 aa  228  6e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4559  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  60.92 
 
 		 184 aa  227  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4875  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  59.78 
 
 		 194 aa  226  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00660  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  61.63 
 
 		 182 aa  214  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6764  phosphate acetyltransferase  55.56 
 
 		 211 aa  203  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0534993  normal  0.870017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0054  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  58.14 
 
 		 182 aa  202  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1806  phosphate acetyltransferase  56.14 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.825619  normal  0.0231057 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1795  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  53.22 
 
 		 194 aa  193  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0075  phosphotransferase KptA/Tpt1  48.89 
 
 		 180 aa  192  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4788  RNA 2'-phosphotransferase  48.04 
 
 		 187 aa  191  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0748  phosphate acetyltransferase  48.26 
 
 		 182 aa  176  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.325809  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2545  RNA 2'-phosphotransferase  48 
 
 		 195 aa  171  6.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2868  phosphate acetyltransferase  47.13 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.784433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4048  phosphotransferase KptA/Tpt1  46.78 
 
 		 182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.624394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5352  phosphotransferase KptA/Tpt1  46.37 
 
 		 182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.74919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0729  phosphotransferase KptA/Tpt1  45.61 
 
 		 192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3135  phosphotransferase KptA/Tpt1  45.03 
 
 		 180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2451  phosphotransferase KptA/Tpt1  52.94 
 
 		 176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.202879  hitchhiker  0.000000261836 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3205  phosphotransferase KptA/Tpt1  46.78 
 
 		 184 aa  158  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  hitchhiker  0.000000000338046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5513  putative RNA 2'-phosphotransferase  45.81 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0209017  normal  0.426807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5516  Phosphate acetyltransferase  43.5 
 
 		 180 aa  153  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.16983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0177  phosphotransferase KptA/Tpt1  47.06 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342477  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18720  RNA:NAD 2'-phosphotransferase  50.68 
 
 		 215 aa  150  8e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.635673  normal  0.289098 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4639  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  44.69 
 
 		 182 aa  147  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000460049  normal  0.20738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4889  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  41.9 
 
 		 182 aa  147  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04510  RNA:NAD 2'-phosphotransferase  42.46 
 
 		 180 aa  145  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350174  hitchhiker  0.00000275449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5760  phosphate acetyltransferase  48.98 
 
 		 394 aa  140  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0192173  hitchhiker  0.0000000000000462587 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0145  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  40.46 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.71719  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0143  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  39.88 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.264895  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2734  phosphotransferase KptA/Tpt1  42.46 
 
 		 180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3059  phosphotransferase KptA/Tpt1  41.81 
 
 		 182 aa  139  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1928  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  43.35 
 
 		 184 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2137  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  41.04 
 
 		 184 aa  131  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0213319  normal  0.0608547 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5718  phosphotransferase KptA/Tpt1  37.99 
 
 		 174 aa  128  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2777  RNA 2'-phosphotransferase  38.98 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000161899  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0018  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  37.13 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.840157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0931  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  35.93 
 
 		 209 aa  100  9e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1047  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  34.13 
 
 		 211 aa  95.1  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.376567  normal  0.793229 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1765  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  30.39 
 
 		 216 aa  90.5  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0962  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  27.78 
 
 		 207 aa  88.6  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1549  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  36.31 
 
 		 216 aa  88.6  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0527  phosphotransferase KptA/Tpt1  33.86 
 
 		 225 aa  86.7  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0908  phosphotransferase KptA/Tpt1  32.2 
 
 		 253 aa  85.9  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2307  phosphotransferase KptA/Tpt1  30.39 
 
 		 201 aa  85.5  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.545628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0385  RNA:NAD 2'-phosphotransferase-like protein  92.68 
 
 		 46 aa  81.3  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1409  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  26.09 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4144  RNA:NAD 2'-phosphotransferase-like  41.1 
 
 		 106 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00880983  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56016  predicted protein  27.93 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.047688 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4222  RNA:NAD 2'-phosphotransferase-like protein  43.48 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1544  phosphotransferase KptA/Tpt1  24.44 
 
 		 253 aa  52.4  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00427558  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21228  predicted protein  26.63 
 
 		 225 aa  51.2  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0839  phosphotransferase KptA/Tpt1  23.86 
 
 		 247 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10567  tRNA splicing 2' phosphotransferase 1 (AFU_orthologue; AFUA_2G02890)  39.39 
 
 		 350 aa  48.5  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0307088 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>