More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_05541 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  100 
 
 		 357 aa  723    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  83.43 
 
 		 362 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  83.43 
 
 		 362 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  55.83 
 
 		 379 aa  422  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  55.56 
 
 		 372 aa  420  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  57.98 
 
 		 380 aa  406  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  60.23 
 
 		 366 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  57.56 
 
 		 349 aa  404  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  57.46 
 
 		 384 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  57.93 
 
 		 344 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  56.27 
 
 		 379 aa  383  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  59.01 
 
 		 373 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  57.23 
 
 		 378 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  57.56 
 
 		 342 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  57.23 
 
 		 378 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  57.56 
 
 		 338 aa  378  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  58.14 
 
 		 362 aa  375  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  82.57 
 
 		 383 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  48.26 
 
 		 349 aa  310  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  48.26 
 
 		 346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  48.26 
 
 		 346 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  47.67 
 
 		 353 aa  301  9e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  45.35 
 
 		 327 aa  294  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  43.39 
 
 		 341 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  63.37 
 
 		 382 aa  263  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  36.93 
 
 		 343 aa  222  6e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  35.21 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  37.64 
 
 		 355 aa  217  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  34.76 
 
 		 335 aa  215  8e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  36.44 
 
 		 353 aa  215  9e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  35.13 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  35.13 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  35.59 
 
 		 355 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  34.08 
 
 		 360 aa  212  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  37.29 
 
 		 354 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  34.28 
 
 		 350 aa  209  5e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  35.69 
 
 		 350 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  34.66 
 
 		 364 aa  209  7e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.98 
 
 		 345 aa  209  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  32.67 
 
 		 320 aa  208  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  36.54 
 
 		 349 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  35.75 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  37.84 
 
 		 369 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  34.07 
 
 		 360 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  33.24 
 
 		 323 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  36.54 
 
 		 353 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  33.89 
 
 		 361 aa  206  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  34.86 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  33.52 
 
 		 324 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  33.88 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  35.41 
 
 		 347 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  34.47 
 
 		 320 aa  203  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  34.81 
 
 		 365 aa  202  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  34.18 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.67 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  35.93 
 
 		 358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  34.18 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  33.9 
 
 		 320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  44.69 
 
 		 393 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  35.93 
 
 		 363 aa  199  9e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  33.62 
 
 		 329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  28.5 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  33.99 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  34.18 
 
 		 322 aa  194  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  44.83 
 
 		 449 aa  192  7e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  44.72 
 
 		 460 aa  192  9e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  44.72 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  36.03 
 
 		 369 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  28.85 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  28.85 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  44.83 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  43.35 
 
 		 460 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  45.23 
 
 		 449 aa  190  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  45.41 
 
 		 493 aa  190  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  44.33 
 
 		 449 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  30.94 
 
 		 408 aa  189  5.999999999999999e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  34.19 
 
 		 362 aa  189  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2730  cobalamin synthesis protein, P47K  28.54 
 
 		 420 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  34.45 
 
 		 336 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  35.71 
 
 		 404 aa  186  4e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  30.7 
 
 		 337 aa  185  9e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  31.14 
 
 		 324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  33.98 
 
 		 364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  42.86 
 
 		 457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  30.02 
 
 		 402 aa  183  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3375  predicted protein  31.28 
 
 		 388 aa  182  7e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0681  cobalamin synthesis protein P47K  28.3 
 
 		 373 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  32.6 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  30.43 
 
 		 376 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  30.32 
 
 		 408 aa  180  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  31.14 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2305  cobalamin synthesis protein, P47K  33.62 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.394905  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  28.99 
 
 		 406 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2212  cobalamin synthesis protein P47K  27.34 
 
 		 423 aa  176  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614725  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  34.64 
 
 		 350 aa  176  7e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2062  cobalamin synthesis protein P47K  31.1 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.410151  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  29.61 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  28.97 
 
 		 417 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  32.02 
 
 		 328 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>