More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_06791 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  64.08 
 
 
492 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05291  glutamyl-tRNA synthetase  63.03 
 
 
492 aa  645    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0717874 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1806  glutamyl-tRNA synthetase  63.24 
 
 
476 aa  650    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1719  glutamyl-tRNA synthetase  73.05 
 
 
477 aa  717    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0641  glutamyl-tRNA synthetase  76.42 
 
 
477 aa  758    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06791  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
476 aa  975    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  63.88 
 
 
481 aa  616  1e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  61.04 
 
 
481 aa  596  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  59.25 
 
 
881 aa  586  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  60.21 
 
 
481 aa  580  1e-164  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  60.83 
 
 
482 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  58.92 
 
 
481 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 
483 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04981  glutamyl-tRNA synthetase  52.52 
 
 
476 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.475242  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 
483 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05281  glutamyl-tRNA synthetase  52.31 
 
 
476 aa  541  1e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0473  glutamyl-tRNA synthetase  51.89 
 
 
479 aa  541  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.138189  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05371  glutamyl-tRNA synthetase  51.78 
 
 
493 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
485 aa  338  9e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
482 aa  333  5e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 
477 aa  333  6e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 
464 aa  331  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 
480 aa  328  9e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
494 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 
485 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 
491 aa  326  6e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 
488 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 
471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 
471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 
485 aa  320  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 
471 aa  320  5e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 
464 aa  319  6e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 
471 aa  318  9e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 
471 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 
471 aa  318  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 
471 aa  318  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  37.94 
 
 
471 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 
471 aa  318  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 
471 aa  318  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
471 aa  318  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 
471 aa  318  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 
479 aa  317  3e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 
471 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 
471 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 
471 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 
471 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
471 aa  316  6e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 
484 aa  315  8e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 
466 aa  315  9e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 
466 aa  315  9e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 
488 aa  315  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 
471 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 
483 aa  315  9.999999999999999e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2779  glutamyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 
471 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00021769  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
484 aa  314  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 
469 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 
469 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 
490 aa  314  2.9999999999999996e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3417  glutamyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 
469 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634908  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
471 aa  311  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
490 aa  311  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 
475 aa  310  4e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 
467 aa  310  4e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 
464 aa  309  5e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
472 aa  309  6.999999999999999e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 
486 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 
501 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
472 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 
475 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0113  glutamyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 
484 aa  307  3e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 
491 aa  307  3e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 
463 aa  307  3e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2931  glutamyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
471 aa  307  3e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000400457  normal  0.117314 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 
466 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 
470 aa  306  7e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
490 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
484 aa  304  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 
467 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
490 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
484 aa  304  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 
485 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
466 aa  301  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
465 aa  302  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
467 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 
470 aa  300  3e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 
468 aa  300  4e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 
488 aa  299  7e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 
472 aa  299  8e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2350  glutamyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 
474 aa  298  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 
491 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 
471 aa  298  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
469 aa  298  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
485 aa  298  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 
467 aa  297  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
471 aa  296  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  36.6 
 
 
509 aa  296  5e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 
485 aa  296  6e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 
485 aa  296  6e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 
485 aa  296  6e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>