48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_13041 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_13041  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  279  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12971  hypothetical protein  95.71 
 
 
140 aa  272  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.298883  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1225  hypothetical protein  95 
 
 
140 aa  268  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04261  hypothetical protein  54.26 
 
 
142 aa  140  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.648244  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0998  hypothetical protein  39.84 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12421  hypothetical protein  39.39 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  35.86 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  36.3 
 
 
141 aa  87.8  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13991  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0597  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.403415  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  34.62 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1204  hypothetical protein  35.14 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.259392  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  29.75 
 
 
143 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  29.75 
 
 
143 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.13 
 
 
152 aa  60.1  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16041  hypothetical protein  30.66 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.37 
 
 
142 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.89 
 
 
193 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  31.37 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000344419 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0909  hypothetical protein  37.97 
 
 
125 aa  50.4  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0993672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 
148 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1350  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  28.04 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0831  hypothetical protein  40.62 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.668197  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.04 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.7 
 
 
178 aa  47.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.1 
 
 
166 aa  47  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000442476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4443  DNA-binding protein  31.62 
 
 
181 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4493  DNA-binding protein  31.62 
 
 
181 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16011  hypothetical protein  28.95 
 
 
155 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4105  transcriptional regulator  30.77 
 
 
181 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4442  DNA-binding protein  30.77 
 
 
181 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4258  DNA-binding protein  30.77 
 
 
181 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4094  transcriptional regulator  30.77 
 
 
181 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4590  DNA-binding protein  30.77 
 
 
181 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2157  cupin 2, barrel  25.23 
 
 
147 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4481  DNA-binding protein  31.03 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0755  DNA-binding protein  31.03 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  26.89 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.18 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.38 
 
 
157 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4539  cupin 2, barrel  34.48 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3080  XRE family transcriptional regulator  31.9 
 
 
181 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.995144  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4922  cupin 2, barrel  34.48 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4626  cupin 2, barrel  34.48 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5003  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.39 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190773  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  30.17 
 
 
194 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5021  cupin region  38.89 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00533136  normal  0.0498556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>