More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_17871 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
65 aa  131  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  90.77 
 
 
65 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  89.23 
 
 
65 aa  117  6e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  89.23 
 
 
65 aa  117  6e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18511  50S ribosomal protein L35  84.62 
 
 
65 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.752965  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18701  50S ribosomal protein L35  84.62 
 
 
65 aa  114  5e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.951627  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18511  50S ribosomal protein L35  84.62 
 
 
65 aa  114  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.428259  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1753  50S ribosomal protein L35  83.08 
 
 
65 aa  113  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  80 
 
 
65 aa  107  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 
65 aa  106  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  71.88 
 
 
65 aa  98.6  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  68.75 
 
 
65 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1477  50S ribosomal protein L35  73.44 
 
 
65 aa  94.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.570064  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  61.54 
 
 
66 aa  84.7  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2607  50S ribosomal protein L35  65.15 
 
 
67 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3499  50S ribosomal protein L35  65.15 
 
 
67 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145508  normal  0.184731 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 
65 aa  80.1  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4254  50S ribosomal protein L35  62.12 
 
 
67 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  71.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  56.25 
 
 
65 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 
65 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  54.84 
 
 
64 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 
65 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  67  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  54.69 
 
 
65 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  51.56 
 
 
79 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  54.69 
 
 
65 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  53.23 
 
 
64 aa  64.7  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1556  ribosomal protein L35  54.1 
 
 
69 aa  64.3  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.637628  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  58.06 
 
 
68 aa  64.3  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 
65 aa  63.9  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 
65 aa  63.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  49.23 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  53.23 
 
 
71 aa  62.8  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1886  50S ribosomal protein L35P  49.23 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101932 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  48.39 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0982  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 
65 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0841883 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1318  ribosomal protein L35  46.15 
 
 
64 aa  61.6  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.35652  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 
65 aa  61.6  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 
64 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1268  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
64 aa  61.6  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.35125 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  51.61 
 
 
64 aa  61.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1726  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 
65 aa  61.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0353101  normal  0.481897 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  61.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  60.8  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  61.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  49.23 
 
 
66 aa  61.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  60.8  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  61.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2980  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 
65 aa  60.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2995  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138749  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3024  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.584231 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2146  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145013  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
64 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  60.5  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2051  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  60.1  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0770661  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0751  50S ribosomal protein L35  44.62 
 
 
67 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000137261  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  43.08 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  49.23 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  48.39 
 
 
63 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 
81 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1925  ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359648  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01675  hypothetical protein  50.77 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0162765  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1915  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414534  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1890  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1474  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0002542  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1838  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121921  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  40.62 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2435  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000580293  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1430  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000901433  normal  0.0165189 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1959  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000143205  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>