116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2364 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2364  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  100 
 
 
270 aa  555  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0212469  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2743  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  78.89 
 
 
269 aa  444  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3286  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  59.04 
 
 
251 aa  293  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0799688  normal  0.416162 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6152  hypothetical protein  61.62 
 
 
264 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  0.0289624 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2016  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  61.19 
 
 
253 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3373  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  59.04 
 
 
270 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  hitchhiker  0.00517308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4027  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  59.54 
 
 
260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3630  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  59.57 
 
 
211 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2795  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.12 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2919  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.12 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265535  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3023  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.12 
 
 
214 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00777053  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1237  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.38 
 
 
184 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.5 
 
 
212 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5913  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.7 
 
 
209 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0164  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.77 
 
 
219 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0082  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.77 
 
 
368 aa  143  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1842  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.18 
 
 
183 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0087761  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1788  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.87 
 
 
190 aa  123  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1444  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.21 
 
 
168 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2361  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.25 
 
 
142 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0110232 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2119  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.36 
 
 
142 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240508 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1314  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45.13 
 
 
139 aa  95.9  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0980  hypothetical protein  34.81 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.278264  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3470  hypothetical protein  32.14 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424807  hitchhiker  0.00000991217 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54810  hypothetical protein  34.71 
 
 
347 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000274874  hitchhiker  6.2392400000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4791  hypothetical protein  34.71 
 
 
354 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1779  hypothetical protein  36.44 
 
 
344 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3099  hypothetical protein  34.95 
 
 
349 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0832  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.07 
 
 
257 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.524335  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4300  hypothetical protein  39.22 
 
 
519 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2782  hypothetical protein  46.15 
 
 
503 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519133  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0722  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.53 
 
 
144 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.728522  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1978  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.04 
 
 
223 aa  58.5  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0685  hypothetical protein  37.36 
 
 
293 aa  57  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.645291  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3408  hypothetical protein  37.25 
 
 
496 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116345  normal  0.112401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2723  hypothetical protein  40.66 
 
 
455 aa  55.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2818  hypothetical protein  43.59 
 
 
536 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3965  hypothetical protein  43.59 
 
 
520 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1284  hypothetical protein  34.88 
 
 
418 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257674  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2942  hypothetical protein  35 
 
 
575 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3881  hypothetical protein  34.95 
 
 
568 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.285346 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  32.74 
 
 
408 aa  53.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3219  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.41 
 
 
204 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0479  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.1 
 
 
323 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.035674 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.66 
 
 
257 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1376  hypothetical protein  35.16 
 
 
419 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0905  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.77 
 
 
187 aa  51.6  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1263  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.89 
 
 
235 aa  52  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0947  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.78 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.68 
 
 
289 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1503  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.86 
 
 
250 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0820  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.87 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0420468 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.39 
 
 
177 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0647  hypothetical protein  26.02 
 
 
180 aa  50.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3448  hypothetical protein  36.17 
 
 
537 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0518  peptidoglycan binding domain-containing protein  31 
 
 
309 aa  49.7  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2501  hypothetical protein  30.77 
 
 
588 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.732185 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2124  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.51 
 
 
216 aa  48.9  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402934  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3627  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.84 
 
 
309 aa  48.9  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000535955  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1584  hypothetical protein  35.11 
 
 
493 aa  48.9  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.871855  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3070  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.91 
 
 
230 aa  48.9  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428129  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.48 
 
 
170 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.475831  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2106  hypothetical protein  33.01 
 
 
503 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1744  hypothetical protein  30.84 
 
 
411 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2694  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.57 
 
 
315 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0633  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.09 
 
 
253 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1510  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.91 
 
 
307 aa  48.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360333  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.32 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.550857  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2344  hypothetical protein  29.91 
 
 
520 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576103  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5175  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.86 
 
 
475 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1729  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.03 
 
 
205 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.698671 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3019  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.5 
 
 
266 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258239  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4931  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.46 
 
 
272 aa  46.6  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.57 
 
 
171 aa  46.2  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2100  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.06 
 
 
427 aa  46.2  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0449665  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0385  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.53 
 
 
292 aa  46.2  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0310092  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0525  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.7 
 
 
155 aa  45.8  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0177  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.36 
 
 
341 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3988  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.45 
 
 
409 aa  45.8  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0819  hypothetical protein  25.17 
 
 
253 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5369  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.25 
 
 
318 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.846692  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4081  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.45 
 
 
409 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3138  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.6 
 
 
402 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5680  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.25 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5330  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.25 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104787  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21900  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.93 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.45 
 
 
762 aa  45.4  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1784  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.74 
 
 
236 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.909249  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.15 
 
 
261 aa  44.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.376264 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0573  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.42 
 
 
441 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1319  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.83 
 
 
142 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.504822  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2111  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.34 
 
 
215 aa  44.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.405702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.78 
 
 
376 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21380  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.41 
 
 
181 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0664  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.63 
 
 
253 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0656  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.63 
 
 
253 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.04 
 
 
194 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.395262  normal  0.946705 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2824  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.36 
 
 
318 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.838169  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0913  hypothetical protein  24.49 
 
 
253 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4392  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.04 
 
 
194 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>