More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0310 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0310  transposase, IS4  100 
 
 		 210 aa  434  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1095  transposase, IS4  100 
 
 		 210 aa  434  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.282833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2919  transposase, IS4  99.52 
 
 		 210 aa  433  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2822  transposase, IS4  99.21 
 
 		 127 aa  259  1e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  70.42 
 
 		 142 aa  207  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  70.42 
 
 		 142 aa  207  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  67.55 
 
 		 252 aa  186  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  57.35 
 
 		 138 aa  165  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  57.58 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  57.58 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  57.58 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  57.58 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  57.58 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  57.58 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  55.3 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  55.3 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  55.3 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  55.3 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  55.3 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  54.26 
 
 		 131 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0534  ISBm1, transposase orfB  55.97 
 
 		 138 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.162326  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0538  ISBm1, transposase orfB  55.97 
 
 		 138 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  44.37 
 
 		 177 aa  125  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  44.37 
 
 		 177 aa  125  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  44.37 
 
 		 177 aa  125  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  44.37 
 
 		 177 aa  125  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  44.37 
 
 		 177 aa  125  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  45 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  41.57 
 
 		 176 aa  122  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  41.57 
 
 		 176 aa  122  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  38.71 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  38.71 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  38.71 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  38.71 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  40.96 
 
 		 176 aa  122  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  40.96 
 
 		 176 aa  122  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  40.56 
 
 		 252 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  40.56 
 
 		 252 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  40.56 
 
 		 252 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  40.56 
 
 		 252 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  40.56 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  40.56 
 
 		 252 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  40.56 
 
 		 252 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  40.56 
 
 		 252 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  40.56 
 
 		 252 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  38.18 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  38.18 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01953  ISSod6, transposase  39.86 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0375505  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  42.55 
 
 		 164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  35.76 
 
 		 260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  42.68 
 
 		 259 aa  114  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  41.84 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  41.84 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  41.84 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  41.84 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2661  putative transposase  45.9 
 
 		 121 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.225009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2809  putative transposase  45.9 
 
 		 121 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1589  hypothetical protein  45.9 
 
 		 121 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.419285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0006  putative transposase  45.9 
 
 		 121 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4349  putative transposase  45.9 
 
 		 121 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  43.38 
 
 		 135 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  37.22 
 
 		 253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  40.97 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0563  hypothetical protein  39.86 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  37.22 
 
 		 253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  37.22 
 
 		 253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0596  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3451  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.1001 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  37.22 
 
 		 253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  38.89 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  41.5 
 
 		 171 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2092  transposase, IS4 family protein  38.19 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2976  transposase, IS4 family protein  38.19 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7095  transposase  49.49 
 
 		 102 aa  108  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3333  transposase, IS4 family protein  38.19 
 
 		 186 aa  108  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  41.13 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  40.82 
 
 		 171 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  40.82 
 
 		 171 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1127  ISBm1, transposase orfB  48.98 
 
 		 102 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  36.88 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  37.72 
 
 		 260 aa  104  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  37.72 
 
 		 260 aa  104  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  36.67 
 
 		 336 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  38.35 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02616  hypothetical protein  35.71 
 
 		 249 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  38.78 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00557  transposase  35.71 
 
 		 249 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3789  hypothetical protein  36.43 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00289  transposase  35.71 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3795  hypothetical protein  36.43 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3322  hypothetical protein  36.43 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0338257  normal  0.289383 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3493  hypothetical protein  36.43 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887255  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0877  transposase, IS4 family protein  36.43 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0937  transposase, IS4 family protein  36.43 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119126  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1327  transposase, IS4 family protein  36.43 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1805  transposase, IS4 family protein  36.43 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1815  transposase, IS4 family protein  36.43 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1820  transposase, IS4 family protein  36.43 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0796894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01770  hypothetical protein  35.71 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2823  transposase, IS4 family protein  36.43 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>