More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2948 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3299  CoA-binding domain protein  49.22 
 
 
976 aa  795    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2128  hypothetical protein  49.72 
 
 
907 aa  775    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505771  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3564  CoA-binding domain protein  51.01 
 
 
902 aa  752    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695831  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1622  CoA-binding domain protein  45.04 
 
 
894 aa  687    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000156668 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1469  CoA-binding domain protein  50.17 
 
 
902 aa  789    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2237  CoA-binding domain protein  44.34 
 
 
950 aa  697    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0315579  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  50.29 
 
 
926 aa  791    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1628  CoA-binding domain protein  57.54 
 
 
821 aa  723    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1929  GCN5-related protein N-acetyltransferase  45.3 
 
 
907 aa  650    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.191743 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1548  CoA-binding domain protein  51.25 
 
 
899 aa  782    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25767  normal  0.134976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7067  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  50.45 
 
 
881 aa  773    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3787  GCN5-related N-acetyltransferase  46.99 
 
 
893 aa  695    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.152255  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15880  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  42.78 
 
 
831 aa  637    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00274098  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1628  GCN5-related N-acetyltransferase  45.23 
 
 
901 aa  704    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1833  CoA-binding domain protein  44.89 
 
 
903 aa  706    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415665  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2384  CoA-binding domain-containing protein  50.51 
 
 
887 aa  795    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.272058 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2948  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 
899 aa  1788    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.574552  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16050  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  44.13 
 
 
934 aa  634  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.243356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  46.92 
 
 
868 aa  628  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277001  normal  0.28701 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1416  GCN5-related N-acetyltransferase  40.43 
 
 
909 aa  613  9.999999999999999e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.953678  normal  0.831405 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13180  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  41.71 
 
 
909 aa  610  1e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.135541  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1932  GCN5-related N-acetyltransferase  42.34 
 
 
907 aa  597  1e-169  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.56977  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  39.44 
 
 
883 aa  589  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1694  GCN5-related N-acetyltransferase  43.82 
 
 
926 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133796  normal  0.55865 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1423  CoA-binding domain-containing protein  46.25 
 
 
909 aa  580  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.382585  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3502  GCN5-related N-acetyltransferase  43.14 
 
 
872 aa  580  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667038  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14440  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  40.56 
 
 
908 aa  570  1e-161  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.268462  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1240  GCN5-related N-acetyltransferase  41.81 
 
 
920 aa  572  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0677298  hitchhiker  0.00305841 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  41.38 
 
 
911 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  38.46 
 
 
904 aa  477  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1998  CoA-binding domain-containing protein  38.24 
 
 
977 aa  470  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0769955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  37.57 
 
 
926 aa  464  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1311  hypothetical protein  35.25 
 
 
886 aa  444  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1004  GCN5-related N-acetyltransferase  36.63 
 
 
883 aa  446  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0615  GCN5-related N-acetyltransferase  39.8 
 
 
775 aa  434  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.47112  normal  0.466486 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1200  GCN5-related N-acetyltransferase  39.97 
 
 
867 aa  431  1e-119  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2950  CoA-binding  39.19 
 
 
707 aa  422  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.266129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  35.09 
 
 
898 aa  413  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2486  GCN5-related N-acetyltransferase  38.38 
 
 
771 aa  403  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1913  CoA-binding domain protein  32.96 
 
 
852 aa  402  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0505  CoA-binding domain protein  34.55 
 
 
887 aa  399  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  35.46 
 
 
698 aa  384  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  35.41 
 
 
698 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.29 
 
 
696 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  32.81 
 
 
697 aa  373  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.62 
 
 
699 aa  359  9.999999999999999e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  33.1 
 
 
696 aa  352  1e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  31.44 
 
 
915 aa  347  4e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  32.25 
 
 
706 aa  345  2.9999999999999997e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  34.37 
 
 
700 aa  343  7e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  30.07 
 
 
701 aa  340  5.9999999999999996e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  31.12 
 
 
711 aa  336  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0886  CoA-binding domain protein  40.5 
 
 
637 aa  335  2e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.330543  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  30.11 
 
 
712 aa  334  5e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  31.2 
 
 
911 aa  333  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.61 
 
 
929 aa  330  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  32.34 
 
 
698 aa  328  3e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  30.24 
 
 
697 aa  327  5e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
918 aa  327  8.000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  30.07 
 
 
921 aa  325  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  27.43 
 
 
698 aa  324  4e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  31.5 
 
 
912 aa  324  5e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  30.69 
 
 
707 aa  324  6e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  30.53 
 
 
695 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  32.32 
 
 
704 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.91 
 
 
699 aa  313  1e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  30.64 
 
 
920 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  31.15 
 
 
893 aa  307  5.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1776  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
898 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.634734 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.92 
 
 
711 aa  304  4.0000000000000003e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  31.37 
 
 
669 aa  300  6e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  33.56 
 
 
903 aa  297  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  27.82 
 
 
905 aa  292  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  30.74 
 
 
704 aa  290  1e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  30.08 
 
 
904 aa  290  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  29.57 
 
 
702 aa  290  1e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  29.55 
 
 
702 aa  288  2e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2428  CoA-binding domain protein  29.25 
 
 
697 aa  289  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.816008  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  28.49 
 
 
895 aa  288  4e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  29.47 
 
 
703 aa  288  5e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  29.55 
 
 
897 aa  287  5e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  30.62 
 
 
898 aa  285  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249053  normal  0.200769 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  29.42 
 
 
913 aa  283  9e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  32.16 
 
 
727 aa  283  9e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  29.62 
 
 
911 aa  282  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 
893 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  28.88 
 
 
900 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  30.47 
 
 
728 aa  275  3e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  28.71 
 
 
892 aa  274  5.000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  29.86 
 
 
903 aa  273  8.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  27.43 
 
 
706 aa  273  1e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.56 
 
 
892 aa  273  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  31.75 
 
 
897 aa  267  5.999999999999999e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3654  GCN5-related N-acetyltransferase  31.38 
 
 
795 aa  265  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.035064  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
889 aa  265  3e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  27.58 
 
 
714 aa  265  3e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1928  CoA-binding domain-containing protein  28.28 
 
 
900 aa  259  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.517585  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  31.37 
 
 
699 aa  254  4.0000000000000004e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 
899 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2324  GCN5-related N-acetyltransferase  28.35 
 
 
898 aa  251  3e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>