62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0302 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0302  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  336  5.9999999999999996e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029098  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4383  putative bile acid 7-alpha dehydratase  55.41 
 
 
154 aa  166  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10315  hypothetical protein  59.03 
 
 
163 aa  160  8.000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.793118 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0386  hypothetical protein  52.32 
 
 
168 aa  153  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0407  hypothetical protein  52.9 
 
 
152 aa  150  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.934587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0398  hypothetical protein  52.9 
 
 
152 aa  150  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0309  hypothetical protein  49.67 
 
 
152 aa  148  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0432  hypothetical protein  52.55 
 
 
159 aa  146  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2755  hypothetical protein  47.26 
 
 
160 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1506  hypothetical protein  38.41 
 
 
170 aa  90.5  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640405  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3745  hypothetical protein  34.59 
 
 
187 aa  70.9  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.875835  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3322  hypothetical protein  28 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0579422  hitchhiker  0.000746889 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  36.81 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  35.9 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  31.47 
 
 
142 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2186  hypothetical protein  36.76 
 
 
163 aa  62  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0503259  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7188  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  60.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168742  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5153  hypothetical protein  35.29 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5242  hypothetical protein  35.29 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.766001  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5534  hypothetical protein  35.29 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  30.51 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  30.97 
 
 
140 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  30.97 
 
 
140 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  30.97 
 
 
140 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  34.13 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  29.66 
 
 
135 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4177  hypothetical protein  32.12 
 
 
164 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  28.89 
 
 
146 aa  53.9  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  29.66 
 
 
135 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  29.66 
 
 
135 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0361  hypothetical protein  28.1 
 
 
163 aa  53.9  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  31.58 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  30.16 
 
 
133 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  32.5 
 
 
141 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  28.46 
 
 
147 aa  52  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3815  hypothetical protein  26.24 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3645  hypothetical protein  29.93 
 
 
167 aa  51.2  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52617  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  32.52 
 
 
139 aa  51.2  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1507  hypothetical protein  28.95 
 
 
166 aa  50.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265161  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  29.1 
 
 
160 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  27.87 
 
 
137 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2896  hypothetical protein  28.99 
 
 
175 aa  48.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  31.71 
 
 
145 aa  48.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  29.51 
 
 
156 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13509  hypothetical protein  31.97 
 
 
168 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  28.35 
 
 
143 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1557  hypothetical protein  28.23 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0375  putative bile acid 7-alpha dehydratase  25.17 
 
 
171 aa  44.3  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  31.78 
 
 
145 aa  44.3  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  28.87 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3201  hypothetical protein  26.32 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  27.82 
 
 
141 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  27.82 
 
 
141 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  27.82 
 
 
136 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3527  hypothetical protein  27.08 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  29.37 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  29.55 
 
 
153 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0517  hypothetical protein  26.81 
 
 
177 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3809  hypothetical protein  27.48 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0339  hypothetical protein  33.71 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.201274  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3526  hypothetical protein  28.46 
 
 
178 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>