106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0071 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0071  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 
162 aa  336  5.9999999999999996e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.290426  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  52.5 
 
 
67 aa  78.6  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.5 
 
 
67 aa  71.6  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2638  thiamine biosynthesis protein ThiS  61.54 
 
 
68 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  45 
 
 
67 aa  67.4  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.25 
 
 
67 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.77 
 
 
66 aa  60.8  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.77 
 
 
66 aa  60.8  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  59.18 
 
 
347 aa  58.2  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.94 
 
 
73 aa  57.4  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.15 
 
 
66 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.56 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.94 
 
 
66 aa  55.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  55.32 
 
 
73 aa  55.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  59.57 
 
 
75 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  59.57 
 
 
75 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  52 
 
 
66 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  44 
 
 
66 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  50 
 
 
92 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  52.83 
 
 
374 aa  53.9  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  50 
 
 
66 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  50 
 
 
66 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 
75 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  50 
 
 
66 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  37.5 
 
 
329 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  39.24 
 
 
326 aa  51.6  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 
66 aa  51.6  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  40 
 
 
98 aa  51.2  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.06 
 
 
75 aa  51.2  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0612  sulfur carrier protein ThiS  37.97 
 
 
67 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  38.82 
 
 
71 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  45.45 
 
 
327 aa  50.8  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  40 
 
 
93 aa  50.8  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.97 
 
 
66 aa  50.8  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.24 
 
 
66 aa  50.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  52 
 
 
331 aa  50.8  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  48 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  49.06 
 
 
70 aa  50.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.27 
 
 
68 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  50 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  39.24 
 
 
66 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.51 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.98 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.88 
 
 
74 aa  49.7  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1150  thiamine biosynthesis protein ThiS  57.5 
 
 
63 aa  49.3  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000104387  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.44 
 
 
66 aa  48.9  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1068  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.32 
 
 
63 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.60648  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0734  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.32 
 
 
63 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  50.94 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.1 
 
 
75 aa  48.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1749  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 
65 aa  48.9  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000555242  normal  0.0141169 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1191  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.67 
 
 
63 aa  48.1  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.94 
 
 
66 aa  48.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2584  hypothetical protein  36.71 
 
 
80 aa  48.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  39.62 
 
 
65 aa  47.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  47.83 
 
 
70 aa  48.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  35 
 
 
67 aa  47.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  49.02 
 
 
66 aa  47.4  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  30.38 
 
 
98 aa  47.4  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.98 
 
 
66 aa  47.4  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.68 
 
 
70 aa  47  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.24 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.25 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.31 
 
 
211 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0247  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.62 
 
 
78 aa  45.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0975224  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1567  ThiS, thiamine-biosynthesis  33.75 
 
 
70 aa  45.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0927969  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0225  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.78 
 
 
66 aa  44.7  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00707568  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1865  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 
67 aa  44.3  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0959115  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6397  sulfur carrier protein ThiS  30.38 
 
 
65 aa  44.3  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0205  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  38.78 
 
 
66 aa  44.3  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000222136  decreased coverage  0.0000121699 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13201  hypothetical protein  41.18 
 
 
70 aa  43.9  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.91 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0073  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.74 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.25 
 
 
66 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1503  ThiS, thiamine-biosynthesis  41.3 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.33 
 
 
66 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.58 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0618  sulfur carrier protein ThiS  40.82 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1416  sulfur carrier protein ThiS  31.65 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1095  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.08 
 
 
68 aa  42.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.364292  normal  0.0606209 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.62 
 
 
67 aa  42.4  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0895  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.4 
 
 
72 aa  42  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.74 
 
 
69 aa  42  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2780  thiamine biosynthesis protein ThiS  57.14 
 
 
78 aa  42  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0685562  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.06 
 
 
68 aa  41.6  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1275  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.18 
 
 
67 aa  41.6  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.106306  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0801  sulfur carrier protein ThiS  36.73 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0697  sulfur carrier protein ThiS  36.73 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0641  sulfur carrier protein ThiS  36.73 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0338  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.75 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0731  sulfur carrier protein ThiS  36.73 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1856  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.73 
 
 
64 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1573  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.73 
 
 
64 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1179  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.04 
 
 
67 aa  41.2  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0885  sulfur carrier protein ThiS  36.73 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164722  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0788  sulfur carrier protein ThiS  36.73 
 
 
67 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4543  sulfur carrier protein ThiS  36.73 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.528402 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0808  sulfur carrier protein ThiS  36.73 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47601e-48 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>