110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0081 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0081  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  100 
 
 
250 aa  508  1e-143  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.53662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4741  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.51 
 
 
347 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0406  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.09 
 
 
248 aa  83.6  3e-15  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4496  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.51 
 
 
329 aa  83.2  4e-15  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6031  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.03 
 
 
288 aa  80.1  3e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321792  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2923  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.17 
 
 
233 aa  79.7  4e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365477  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.29 
 
 
330 aa  77.8  1e-13  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0314282 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3840  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.29 
 
 
333 aa  77.8  1e-13  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1482  cbiX domain protein  24.51 
 
 
251 aa  76.3  4e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1310  cbiX protein  22.89 
 
 
251 aa  75.1  9e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.84622  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  20.5 
 
 
357 aa  74.7  1e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108946  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1309  cbiX protein  22.71 
 
 
251 aa  74.3  2e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1588  cbiX domain protein  23.32 
 
 
251 aa  73.9  2e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00133885  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1289  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.67 
 
 
248 aa  73.9  2e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1518  cbiX domain protein  22.31 
 
 
251 aa  73.6  3e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.91734e-20 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0646  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  19.11 
 
 
297 aa  73.6  3e-12  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00275078  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1550  CbiX domain-containing protein  22.31 
 
 
251 aa  73.2  4e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215105  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1197  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.69 
 
 
365 aa  72.4  6e-12  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3862  cbiX domain protein  23.51 
 
 
250 aa  72  8e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.417558  hitchhiker  7.56549e-06 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07021  hypothetical protein  23.11 
 
 
400 aa  71.2  1e-11  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  20.24 
 
 
534 aa  71.2  1e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7707  predicted protein  24.81 
 
 
134 aa  70.9  2e-11  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.095411  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1446  CbiX domain-containing protein  21.91 
 
 
251 aa  70.5  3e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.340778  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1336  CbiX domain-containing protein  21.91 
 
 
251 aa  70.5  3e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0646  hypothetical protein  23.11 
 
 
379 aa  69.7  4e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0644  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  20.56 
 
 
472 aa  68.9  6e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  20.8 
 
 
275 aa  68.9  8e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1378  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.71 
 
 
418 aa  67.4  2e-10  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149908  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06731  hypothetical protein  22.71 
 
 
401 aa  67  3e-10  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0565  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  19.46 
 
 
471 aa  66.6  3e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07121  hypothetical protein  21.03 
 
 
375 aa  66.2  5e-10  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1350  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.51 
 
 
250 aa  65.9  6e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145066  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1550  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.56 
 
 
277 aa  65.9  6e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.33242e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.77 
 
 
410 aa  64.7  1e-09  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  20.65 
 
 
410 aa  64.7  1e-09  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1987  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.32 
 
 
236 aa  63.9  2e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2641  hypothetical protein  22.38 
 
 
443 aa  64.3  2e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.597647  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1812  hypothetical protein  21.43 
 
 
365 aa  63.2  4e-09  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1096  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.1 
 
 
127 aa  62  9e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0843  hypothetical protein  20.63 
 
 
368 aa  62  9e-09  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2149  cbiX domain protein  24.34 
 
 
236 aa  61.6  1e-08  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0928  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.96 
 
 
125 aa  61.6  1e-08  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.75359e-07 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1149  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  20 
 
 
250 aa  61.2  2e-08  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.427856  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07571  hypothetical protein  21.96 
 
 
349 aa  61.2  2e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.746447  hitchhiker  0.00609734 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0032  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.56 
 
 
127 aa  60.8  2e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3165  cbiX domain protein  26.14 
 
 
236 aa  60.8  2e-08  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0307  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.52 
 
 
121 aa  59.7  5e-08  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0086  hypothetical protein  21.74 
 
 
337 aa  59.3  5e-08  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.639157  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07101  hypothetical protein  22.09 
 
 
337 aa  58.9  7e-08  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129916  normal  0.330282 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.54 
 
 
408 aa  58.9  7e-08  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1967  hypothetical protein  23.68 
 
 
236 aa  58.9  7e-08  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2143  CbiX domain-containing protein  23.68 
 
 
236 aa  58.9  7e-08  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.458667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1994  CbiX domain-containing protein  23.68 
 
 
236 aa  58.9  7e-08  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2699  uroporphyrin-III C-methyltransferase  19.12 
 
 
550 aa  58.9  8e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2804  hitchhiker  0.000140912 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2290  cbiX domain protein  23.03 
 
 
236 aa  58.2  1e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12211  hypothetical protein  22.31 
 
 
359 aa  58.2  1e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3612  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.4 
 
 
127 aa  58.2  1e-07  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2903  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.17 
 
 
132 aa  58.2  1e-07  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3000  cbiX protein  24 
 
 
127 aa  57.4  2e-07  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1946  hypothetical protein  23.03 
 
 
236 aa  57.8  2e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3546  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.6 
 
 
127 aa  57.8  2e-07  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2174  cbiX domain protein  23.68 
 
 
236 aa  57.4  2e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  19.52 
 
 
553 aa  57.8  2e-07  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459561  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0476  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.62 
 
 
140 aa  57  3e-07  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1271  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  20.33 
 
 
465 aa  56.2  4e-07  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1857  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.09 
 
 
159 aa  56.6  4e-07  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2707  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.5 
 
 
127 aa  55.5  9e-07  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.079743  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0439  sirohydrochlorin cobaltochelatase  20.31 
 
 
298 aa  53.5  3e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30181  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0474  sirohydrochlorin cobaltochelatase  20.31 
 
 
298 aa  53.5  3e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1268  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.09 
 
 
127 aa  53.9  3e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0489933  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1760  hypothetical protein  22.08 
 
 
514 aa  52  8e-06  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1350  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.67 
 
 
274 aa  52  9e-06  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1023  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  20.99 
 
 
309 aa  52  1e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2162  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  19.76 
 
 
321 aa  51.2  2e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.15406 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2563  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  19.08 
 
 
304 aa  50.8  2e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523631  normal  0.848204 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49508  predicted protein  27.43 
 
 
317 aa  50.8  2e-05  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0529  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.8 
 
 
157 aa  50.4  3e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.584257  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1086  sirohydrochlorin cobaltochelatase  26.36 
 
 
135 aa  50.1  3e-05  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1832  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.36 
 
 
116 aa  50.1  3e-05  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.42293  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2299  CbiX protein  21.05 
 
 
283 aa  50.1  3e-05  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.66626  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6101  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.78 
 
 
153 aa  49.7  4e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32194  normal  0.0194652 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.31 
 
 
127 aa  49.3  6e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.87367e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  20.4 
 
 
248 aa  48.9  7e-05  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4473  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  18.65 
 
 
309 aa  48.9  8e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0278734 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0205  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.13 
 
 
247 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1281  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.21 
 
 
120 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.967515  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0518  sirohydrochlorin cobaltochelatase  33.33 
 
 
143 aa  47  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.176481  normal  0.663742 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  19.84 
 
 
520 aa  46.6  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2473  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.93 
 
 
243 aa  46.2  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0617296  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2425  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.93 
 
 
243 aa  46.2  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0985952  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1002  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.57 
 
 
122 aa  46.2  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3165  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.11 
 
 
134 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232194  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0883  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.08 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  1.11412e-08  hitchhiker  2.24272e-09 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0104  sirohydrochlorin cobaltochelatase  28 
 
 
129 aa  45.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2778  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  19 
 
 
298 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.0351721 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0820  CbiX  23.21 
 
 
128 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2287  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.11 
 
 
234 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  19.77 
 
 
291 aa  43.5  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2338  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.11 
 
 
234 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1417  sirohydrochlorin cobaltochelatase  30.14 
 
 
133 aa  43.5  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.158753 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>