194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0080 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0080  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  100 
 
 
213 aa  428  1e-119  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.52758 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3611  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.95 
 
 
216 aa  196  2e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3545  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  48.11 
 
 
214 aa  196  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2136  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.59 
 
 
224 aa  191  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0350382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0033  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.24 
 
 
213 aa  190  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0477  precorrin-8X methylmutase  46.19 
 
 
214 aa  187  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2999  precorrin-8X methylmutase  44.12 
 
 
213 aa  186  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540254  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1553  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.83 
 
 
215 aa  183  2e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.160219  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2613  Precorrin-8X methylmutase  47.4 
 
 
215 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2298  precorrin-8X methylmutase  44.33 
 
 
219 aa  179  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1298  precorrin-8X methylmutase  45.26 
 
 
211 aa  171  6e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  2.2919e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3134  precorrin-8X methylmutase  43.69 
 
 
217 aa  171  6e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.688258 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2081  precorrin-8X methylmutase  45.69 
 
 
218 aa  171  9e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1269  precorrin-8X methylmutase  41.87 
 
 
214 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0352716  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1691  precorrin-8X methylmutase  41.71 
 
 
225 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3739  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.06 
 
 
226 aa  166  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0342  precorrin-8X methylmutase  39.9 
 
 
220 aa  164  8e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2777  precorrin-8X methylmutase  41.23 
 
 
224 aa  161  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.066759 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0070  precorrin-8X methylmutase  42.56 
 
 
239 aa  161  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104216  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1298  Precorrin-8X methylmutase  42.86 
 
 
207 aa  161  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2161  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.76 
 
 
228 aa  161  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.149955 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0308  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44.28 
 
 
207 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0480  precorrin isomerase, CbiC-like  37.91 
 
 
225 aa  156  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1008  Precorrin-8X methylmutase  44.95 
 
 
211 aa  156  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1349  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40 
 
 
222 aa  155  5e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1435  precorrin-8X methylmutase  42.71 
 
 
209 aa  152  3e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1241  precorrin-8X methylmutase  42.71 
 
 
209 aa  152  3e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.189427  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1022  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.95 
 
 
229 aa  152  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.535258  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0475  precorrin-8X methylmutase  41.31 
 
 
225 aa  151  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0440  precorrin-8X methylmutase, precorrin isomerase  41.31 
 
 
225 aa  151  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.46496  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0642  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.91 
 
 
222 aa  149  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0567  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.91 
 
 
222 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0965  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.2 
 
 
213 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.519287  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0621  precorrin-8X methylmutase  41.12 
 
 
210 aa  149  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.517297  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1382  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.69 
 
 
214 aa  149  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1285  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.83 
 
 
211 aa  146  2e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.808372  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1332  precorrin-8X methylmutase  42.06 
 
 
212 aa  145  4e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0538013  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1343  precorrin-8X methylmutase  40.19 
 
 
212 aa  145  5e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212659  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1269  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.78 
 
 
219 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2706  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.39 
 
 
207 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0197172  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.34 
 
 
541 aa  140  2e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1341  precorrin-8X methylmutase  38.14 
 
 
210 aa  137  9e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1504  precorrin-8X methylmutase  40.5 
 
 
200 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5060  precorrin-8X methylmutase  38.24 
 
 
211 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341493 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3654  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.16 
 
 
228 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2555  precorrin-8X methylmutase  38.28 
 
 
207 aa  135  6e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1303  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.73 
 
 
212 aa  135  6e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.82 
 
 
451 aa  132  4e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21130  precorrin-8X methylmutase  38.31 
 
 
219 aa  131  8e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0697  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.91 
 
 
205 aa  131  9e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1720  cobalt-precorrin-8X methylmutase  37.93 
 
 
227 aa  130  1e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1477  precorrin-8X methylmutase  38.89 
 
 
201 aa  129  2e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2355  precorrin-8X methylmutase  39.52 
 
 
249 aa  129  5e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000155393  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0015  precorrin-8X methylmutase  38.14 
 
 
212 aa  128  6e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0027  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  34.34 
 
 
230 aa  127  1e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.615155  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3117  precorrin-8X methylmutase  36.18 
 
 
230 aa  127  1e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1097  precorrin-8X methylmutase  36 
 
 
210 aa  127  2e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  38.15 
 
 
534 aa  125  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3509  precorrin-8X methylmutase  37.19 
 
 
209 aa  125  6e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.540092 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1250  precorrin-8X methylmutase  38.5 
 
 
208 aa  123  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1287  precorrin-8X methylmutase  38.5 
 
 
208 aa  123  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0927  Precorrin-8X methylmutase  38.16 
 
 
204 aa  122  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  2.90763e-08 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3178  precorrin-8X methylmutase  36 
 
 
209 aa  121  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333659  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3376  precorrin-8X methylmutase  37.13 
 
 
221 aa  121  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.218633 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  36.63 
 
 
208 aa  120  1e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  33.17 
 
 
520 aa  120  2e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  35.89 
 
 
468 aa  120  2e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0630  precorrin-8X methylmutase  37.02 
 
 
245 aa  119  2e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.872392  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2320  precorrin-8X methylmutase  36.14 
 
 
209 aa  119  4e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2893  precorrin-8X methylmutase  36.21 
 
 
220 aa  117  1e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1287  precorrin-8X methylmutase  35.86 
 
 
203 aa  116  2e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01573  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0292  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  36.73 
 
 
213 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.599912 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  35.84 
 
 
224 aa  115  4e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.05 
 
 
469 aa  115  4e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2253  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  33.65 
 
 
245 aa  115  4e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  34.86 
 
 
221 aa  114  8e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7175  precorrin-8X methylmutase  33.82 
 
 
210 aa  114  1e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894546  normal  0.0915035 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2817  precorrin-8X methylmutase  32.34 
 
 
210 aa  114  1e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6020  precorrin-8X methylmutase  33.5 
 
 
210 aa  113  2e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00161417  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.02 
 
 
472 aa  113  2e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1573  precorrin-8X methylmutase  38.99 
 
 
208 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.377269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5593  Precorrin-8X methylmutase  36.05 
 
 
208 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1712  Precorrin-8X methylmutase  35.86 
 
 
210 aa  112  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  hitchhiker  0.00790463 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0513  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  33.82 
 
 
226 aa  110  2e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0586805  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1670  precorrin-8X methylmutase  36.92 
 
 
209 aa  110  2e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.793368  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2440  precorrin-8X methylmutase  32.45 
 
 
210 aa  110  2e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341213  normal  0.0714057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1434  Precorrin-8X methylmutase  35.18 
 
 
210 aa  109  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.656935  normal  0.667092 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1888  precorrin-8X methylmutase  35.79 
 
 
209 aa  109  4e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1437  precorrin-8X methylmutase  34.85 
 
 
210 aa  108  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1591  precorrin-8X methylmutase  37.74 
 
 
208 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.257981 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1852  precorrin-8X methylmutase  34.21 
 
 
209 aa  107  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.334862  normal  0.809538 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5691  Precorrin-8X methylmutase  34.57 
 
 
210 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194408  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2639  precorrin isomerase  40.8 
 
 
499 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0523957  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1625  Precorrin-8X methylmutase  35.23 
 
 
221 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4884  precorrin-8X methylmutase  36.32 
 
 
208 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2380  precorrin-8X methylmutase  36.5 
 
 
209 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4618  precorrin-8X methylmutase  35.79 
 
 
208 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4706  precorrin-8X methylmutase  36.32 
 
 
208 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.735221 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3144  precorrin-8X methylmutase  36.88 
 
 
212 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4828  precorrin-8X methylmutase  36.32 
 
 
208 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.504707 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>