195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0513 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0513  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  100 
 
 		 226 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0586805  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1081  precorrin-8X methylmutase  66.82 
 
 		 220 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1225  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  71.43 
 
 		 221 aa  295  4e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.547545  normal  0.86502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1718  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  70.24 
 
 		 217 aa  292  4e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3214  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  64.76 
 
 		 211 aa  270  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0630  precorrin-8X methylmutase  58.74 
 
 		 245 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.872392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0143  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  58.71 
 
 		 209 aa  231  7.000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2355  precorrin-8X methylmutase  52.4 
 
 		 249 aa  221  8e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000155393  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3460  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44.54 
 
 		 238 aa  163  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1858  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.93 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.240156 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1004  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.99 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1332  precorrin-8X methylmutase  42.79 
 
 		 212 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0538013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0015  precorrin-8X methylmutase  41.55 
 
 		 212 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0621  precorrin-8X methylmutase  42.79 
 
 		 210 aa  141  9e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.517297  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1343  precorrin-8X methylmutase  41.83 
 
 		 212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212659  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1341  precorrin-8X methylmutase  39.71 
 
 		 210 aa  138  7e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2136  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.43 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0350382 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5060  precorrin-8X methylmutase  34.16 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341493 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1303  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.3 
 
 		 212 aa  122  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2706  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44.65 
 
 		 207 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0197172  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1477  precorrin-8X methylmutase  34.5 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2613  Precorrin-8X methylmutase  38.89 
 
 		 215 aa  111  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1504  precorrin-8X methylmutase  35.38 
 
 		 200 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0080  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  33.82 
 
 		 213 aa  110  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.52758 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0697  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.92 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0119  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  36.87 
 
 		 332 aa  108  8.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0308  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  33.17 
 
 		 207 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1097  precorrin-8X methylmutase  40.1 
 
 		 210 aa  108  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  43.56 
 
 		 534 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0480  precorrin isomerase, CbiC-like  37.72 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1287  precorrin-8X methylmutase  36.05 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1269  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.61 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3376  precorrin-8X methylmutase  38.85 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.218633 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3654  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.37 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1435  precorrin-8X methylmutase  38.33 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1241  precorrin-8X methylmutase  38.33 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.189427  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0027  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.33 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.615155  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1553  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  36.32 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.160219  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0567  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.2 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2212  precorrin-8X methylmutase  38.83 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1008  Precorrin-8X methylmutase  36.96 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0642  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.62 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5850  precorrin-8X methylmutase  37.06 
 
 		 209 aa  101  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2555  precorrin-8X methylmutase  37.43 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1298  Precorrin-8X methylmutase  33.91 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  36.71 
 
 		 221 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.01 
 
 		 520 aa  97.8  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7175  precorrin-8X methylmutase  36.87 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894546  normal  0.0915035 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.36 
 
 		 541 aa  97.1  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4876  precorrin-8X methylmutase  42.2 
 
 		 208 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4416  precorrin-8X methylmutase  42.77 
 
 		 208 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0605  precorrin-8X methylmutase  40.98 
 
 		 208 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.414575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3745  precorrin-8X methylmutase  32.69 
 
 		 208 aa  97.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.106474 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2081  precorrin-8X methylmutase  34.27 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3117  precorrin-8X methylmutase  36.59 
 
 		 230 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1646  precorrin-8X methylmutase  46.48 
 
 		 208 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.996028  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1193  precorrin-8X methylmutase  46.48 
 
 		 208 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0208289  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1673  precorrin-8X methylmutase  46.48 
 
 		 208 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0355413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0939  Precorrin-8X methylmutase  38.42 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1244  precorrin-8X methylmutase  39.78 
 
 		 208 aa  95.1  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0926514  normal  0.29626 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1691  precorrin-8X methylmutase  36.32 
 
 		 225 aa  95.1  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1591  precorrin-8X methylmutase  45.77 
 
 		 208 aa  95.1  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1573  precorrin-8X methylmutase  45.77 
 
 		 208 aa  95.1  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.377269  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  35.43 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4823  precorrin-8X methylmutase  45.77 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0152  Precorrin-8X methylmutase  39.89 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.5 
 
 		 451 aa  93.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1888  precorrin-8X methylmutase  40.84 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2999  precorrin-8X methylmutase  43.35 
 
 		 213 aa  92.4  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540254  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2929  precorrin-8X methylmutase  34.67 
 
 		 209 aa  92.8  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.451647  hitchhiker  0.00280569 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3134  precorrin-8X methylmutase  34.44 
 
 		 217 aa  92.8  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688258 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2991  precorrin-8X methylmutase  39.71 
 
 		 208 aa  92.4  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1285  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  34.92 
 
 		 211 aa  92.4  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.808372  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6020  precorrin-8X methylmutase  35.86 
 
 		 210 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00161417  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  37.44 
 
 		 208 aa  92  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1625  Precorrin-8X methylmutase  41.24 
 
 		 221 aa  92  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2380  precorrin-8X methylmutase  40.33 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3178  precorrin-8X methylmutase  42.04 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1670  precorrin-8X methylmutase  41.01 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.793368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0575  Precorrin-8X methylmutase  36.9 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00841  putative precorrin-8X methylmutase CobH  31 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0644174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1437  precorrin-8X methylmutase  38.92 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2777  precorrin-8X methylmutase  39.67 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.066759 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3144  precorrin-8X methylmutase  39.78 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4572  precorrin-8X methylmutase  46.21 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3146  precorrin-8X methylmutase  41.86 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1382  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.46 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6217  precorrin-8X methylmutase  37.13 
 
 		 209 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0665101  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1434  Precorrin-8X methylmutase  39.9 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.656935  normal  0.667092 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0965  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.5 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.519287  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1469  precorrin-8X methylmutase  37.13 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0033  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.53 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0477  precorrin-8X methylmutase  39.23 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4511  precorrin-8X methylmutase  36.17 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288087 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1250  precorrin-8X methylmutase  36.36 
 
 		 208 aa  89.7  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1287  precorrin-8X methylmutase  36.36 
 
 		 208 aa  89  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2320  precorrin-8X methylmutase  40 
 
 		 209 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2534  precorrin-8X methylmutase  35.64 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1712  Precorrin-8X methylmutase  38.92 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  hitchhiker  0.00790463 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0172  precorrin-8X methylmutase  41.72 
 
 		 512 aa  89.4  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00890226  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>