195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1225 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1225  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  100 
 
 
221 aa  442  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.547545  normal  0.86502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1718  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  77.56 
 
 
217 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0513  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  71.43 
 
 
226 aa  317  1e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0586805  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1081  precorrin-8X methylmutase  70.05 
 
 
220 aa  315  3e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3214  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  66.18 
 
 
211 aa  278  5e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0630  precorrin-8X methylmutase  55.22 
 
 
245 aa  236  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.872392  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2355  precorrin-8X methylmutase  52.68 
 
 
249 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000155393  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0143  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  55 
 
 
209 aa  216  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3460  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.58 
 
 
238 aa  147  9e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1332  precorrin-8X methylmutase  44.15 
 
 
212 aa  143  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0538013  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1341  precorrin-8X methylmutase  40.1 
 
 
210 aa  142  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0621  precorrin-8X methylmutase  44.68 
 
 
210 aa  142  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.517297  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1004  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  36.87 
 
 
254 aa  141  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1858  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.71 
 
 
281 aa  141  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.240156 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1343  precorrin-8X methylmutase  43.62 
 
 
212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212659  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0015  precorrin-8X methylmutase  39.02 
 
 
212 aa  137  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2136  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.81 
 
 
224 aa  128  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0350382 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0697  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.69 
 
 
205 aa  125  5e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2706  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.05 
 
 
207 aa  124  9e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0197172  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5060  precorrin-8X methylmutase  36.36 
 
 
211 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341493 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1303  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.77 
 
 
212 aa  116  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1477  precorrin-8X methylmutase  35.38 
 
 
201 aa  114  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0480  precorrin isomerase, CbiC-like  37.23 
 
 
225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1504  precorrin-8X methylmutase  35.38 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0119  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38 
 
 
332 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1298  Precorrin-8X methylmutase  33.65 
 
 
207 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456818 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3376  precorrin-8X methylmutase  35.02 
 
 
221 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.218633 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0308  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  32.99 
 
 
207 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1269  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  36.13 
 
 
219 aa  106  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1287  precorrin-8X methylmutase  36.63 
 
 
203 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01573  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3117  precorrin-8X methylmutase  36.82 
 
 
230 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  39.11 
 
 
224 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0642  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.04 
 
 
222 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1097  precorrin-8X methylmutase  39 
 
 
210 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3654  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.72 
 
 
228 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  39.2 
 
 
221 aa  102  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2555  precorrin-8X methylmutase  36.67 
 
 
207 aa  102  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7175  precorrin-8X methylmutase  41.94 
 
 
210 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894546  normal  0.0915035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.28 
 
 
451 aa  101  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0567  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.38 
 
 
222 aa  101  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4416  precorrin-8X methylmutase  39.2 
 
 
208 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3134  precorrin-8X methylmutase  37.71 
 
 
217 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.688258 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0575  Precorrin-8X methylmutase  38.73 
 
 
206 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4876  precorrin-8X methylmutase  42.86 
 
 
208 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5850  precorrin-8X methylmutase  37.79 
 
 
209 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  36.78 
 
 
534 aa  99.8  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1435  precorrin-8X methylmutase  36.57 
 
 
209 aa  99.8  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1241  precorrin-8X methylmutase  36.57 
 
 
209 aa  99.8  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.189427  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0939  Precorrin-8X methylmutase  37.37 
 
 
206 aa  99.4  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2212  precorrin-8X methylmutase  38.95 
 
 
209 aa  99.4  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2999  precorrin-8X methylmutase  41.62 
 
 
213 aa  99  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540254  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1285  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.04 
 
 
211 aa  99  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.808372  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3178  precorrin-8X methylmutase  43.04 
 
 
209 aa  98.6  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333659  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5593  Precorrin-8X methylmutase  41.51 
 
 
208 aa  99  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1382  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.42 
 
 
214 aa  98.2  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0080  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.33 
 
 
213 aa  98.2  9e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.52758 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0027  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  35.19 
 
 
230 aa  98.2  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.615155  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6020  precorrin-8X methylmutase  40.12 
 
 
210 aa  98.2  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00161417  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2613  Precorrin-8X methylmutase  32.67 
 
 
215 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1008  Precorrin-8X methylmutase  34.69 
 
 
211 aa  97.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2817  precorrin-8X methylmutase  40.74 
 
 
210 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4823  precorrin-8X methylmutase  45.77 
 
 
208 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.183427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1520  precorrin-8X methylmutase  39.27 
 
 
219 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1888  precorrin-8X methylmutase  40.84 
 
 
209 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1553  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.42 
 
 
215 aa  96.3  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.160219  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2320  precorrin-8X methylmutase  43.33 
 
 
209 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1591  precorrin-8X methylmutase  45.07 
 
 
208 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.257981 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1646  precorrin-8X methylmutase  45.07 
 
 
208 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.996028  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1193  precorrin-8X methylmutase  45.07 
 
 
208 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0208289  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1673  precorrin-8X methylmutase  45.07 
 
 
208 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0355413  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2534  precorrin-8X methylmutase  41.33 
 
 
209 aa  95.5  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474036  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3509  precorrin-8X methylmutase  39.66 
 
 
209 aa  95.5  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.540092 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1434  Precorrin-8X methylmutase  40.78 
 
 
210 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.656935  normal  0.667092 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1437  precorrin-8X methylmutase  40.78 
 
 
210 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0477  precorrin-8X methylmutase  41.95 
 
 
214 aa  94.7  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0342  precorrin-8X methylmutase  33.18 
 
 
220 aa  94  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2991  precorrin-8X methylmutase  44.44 
 
 
208 aa  94.7  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1573  precorrin-8X methylmutase  45.07 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.377269  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1712  Precorrin-8X methylmutase  40.78 
 
 
210 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  hitchhiker  0.00790463 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1519  precorrin-8X methylmutase  41.14 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.023292 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0965  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  33.5 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.519287  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1691  precorrin-8X methylmutase  34.68 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2081  precorrin-8X methylmutase  34.97 
 
 
218 aa  93.2  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4572  precorrin-8X methylmutase  44.74 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00841  putative precorrin-8X methylmutase CobH  33.33 
 
 
211 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0644174 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6217  precorrin-8X methylmutase  40.57 
 
 
209 aa  92.8  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0665101  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  42.11 
 
 
208 aa  92.4  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1469  precorrin-8X methylmutase  40.57 
 
 
209 aa  92.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2929  precorrin-8X methylmutase  37.79 
 
 
209 aa  92.4  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.451647  hitchhiker  0.00280569 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0340  precorrin-8X methylmutase  41.28 
 
 
209 aa  92  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2399  precorrin-8X methylmutase  44.74 
 
 
208 aa  92  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154427  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1782  Precorrin-8X methylmutase  38.46 
 
 
208 aa  91.7  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0033  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.31 
 
 
213 aa  91.7  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1244  precorrin-8X methylmutase  42.11 
 
 
208 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0926514  normal  0.29626 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1625  Precorrin-8X methylmutase  35.41 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1569  precorrin-8X methylmutase  47.18 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0892973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2380  precorrin-8X methylmutase  41.28 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2298  precorrin-8X methylmutase  37.35 
 
 
219 aa  90.5  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3144  precorrin-8X methylmutase  41.36 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17721  putative precorrin-8X methylmutase CobH  36.26 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>