245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0472 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2522  Phosphoenolpyruvate carboxylase  67.11 
 
 
898 aa  1176  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314131  normal  0.688456 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0472  Phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 
898 aa  1818  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1468  Phosphoenolpyruvate carboxylase  63.44 
 
 
898 aa  1137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4721  Phosphoenolpyruvate carboxylase  83.3 
 
 
896 aa  1511  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4375  Phosphoenolpyruvate carboxylase  82.85 
 
 
896 aa  1509  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0553395  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2311  phosphoenolpyruvate carboxylase  67.44 
 
 
900 aa  1191  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.900921 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2494  Phosphoenolpyruvate carboxylase  83.98 
 
 
897 aa  1501  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.65 
 
 
929 aa  586  1e-166  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.83 
 
 
931 aa  573  1e-162  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.32 
 
 
952 aa  543  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.84 
 
 
933 aa  541  1e-152  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.59 
 
 
906 aa  538  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.86 
 
 
957 aa  518  1e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.34 
 
 
938 aa  518  1e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0994  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.29 
 
 
892 aa  516  1e-145  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43848  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.26 
 
 
1030 aa  512  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1653  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.68 
 
 
892 aa  510  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0256628  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.36 
 
 
1001 aa  507  1e-142  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.05 
 
 
1075 aa  507  1e-142  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.22 
 
 
1002 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.84 
 
 
994 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954175  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.68 
 
 
929 aa  499  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.68 
 
 
929 aa  499  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  1.74255e-10 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04694  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.84 
 
 
896 aa  501  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.510612  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2286  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.84 
 
 
994 aa  502  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2999  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.84 
 
 
994 aa  502  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1075  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.84 
 
 
1024 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1599  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.84 
 
 
994 aa  502  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.737727  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0729  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.84 
 
 
994 aa  502  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.62 
 
 
994 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1228  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.73 
 
 
1085 aa  499  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.774396  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2335  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.97 
 
 
998 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.361608 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5753  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.74 
 
 
1008 aa  494  1e-138  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.61686  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2430  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.85 
 
 
1009 aa  495  1e-138  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76585  normal  0.238617 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.78 
 
 
938 aa  494  1e-138  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.86 
 
 
939 aa  494  1e-138  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0871  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.56 
 
 
1088 aa  494  1e-138  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2469  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.86 
 
 
998 aa  495  1e-138  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792272  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.45 
 
 
985 aa  494  1e-138  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1814  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.74 
 
 
994 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594671  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2426  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.74 
 
 
1009 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.02 
 
 
947 aa  488  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.24 
 
 
1004 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.72 
 
 
926 aa  484  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.71 
 
 
936 aa  486  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.91 
 
 
929 aa  484  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.19 
 
 
937 aa  483  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.16 
 
 
951 aa  479  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.25 
 
 
950 aa  481  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.09332e-07 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  36 
 
 
949 aa  481  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.01 
 
 
920 aa  482  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.59 
 
 
928 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.57 
 
 
1009 aa  477  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.27 
 
 
933 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.11 
 
 
982 aa  471  1e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34 
 
 
946 aa  471  1e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.39 
 
 
929 aa  471  1e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.49 
 
 
970 aa  471  1e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.49 
 
 
949 aa  468  1e-130  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.49 
 
 
949 aa  468  1e-130  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.22 
 
 
928 aa  468  1e-130  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.17 
 
 
933 aa  467  1e-130  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.7 
 
 
929 aa  466  1e-130  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.52 
 
 
918 aa  463  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3806  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.58 
 
 
907 aa  460  1e-128  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.589788  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.02 
 
 
945 aa  460  1e-128  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.27 
 
 
1006 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0138  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.19 
 
 
932 aa  453  1e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.497432 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  35 
 
 
930 aa  455  1e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.15 
 
 
954 aa  454  1e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1661  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.25 
 
 
938 aa  452  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1819  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.37 
 
 
923 aa  451  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218615 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3003  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.93 
 
 
934 aa  451  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371181  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0742  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.36 
 
 
937 aa  446  1e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.05 
 
 
946 aa  448  1e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.05 
 
 
946 aa  448  1e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0628  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.95 
 
 
903 aa  446  1e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.472091  normal  0.156419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.05 
 
 
946 aa  448  1e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3372  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.61 
 
 
954 aa  446  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16897  normal  0.0169506 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0397  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.94 
 
 
915 aa  442  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401912  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2536  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.73 
 
 
921 aa  439  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366441  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2699  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.62 
 
 
915 aa  436  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1714  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.43 
 
 
957 aa  435  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.686661  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30020  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.6 
 
 
900 aa  434  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.7 
 
 
937 aa  432  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0178  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.76 
 
 
940 aa  432  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4129  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.81 
 
 
892 aa  430  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54774  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0883  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.41 
 
 
972 aa  429  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.3209  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.81 
 
 
936 aa  429  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07300  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.66 
 
 
942 aa  427  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0261  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.73 
 
 
882 aa  428  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132478  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0304  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.08 
 
 
931 aa  429  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0828  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.01 
 
 
928 aa  427  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.891362  normal  0.27066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0701  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.16 
 
 
890 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17661  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.3 
 
 
989 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5805  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.34 
 
 
914 aa  425  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.454197 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0841  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.55 
 
 
939 aa  426  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2554  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.49 
 
 
875 aa  424  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0748469  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1138  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.87 
 
 
926 aa  423  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118011  normal  0.338902 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1667  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.86 
 
 
989 aa  425  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>