36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2060 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2060  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  447  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.572806  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  35.75 
 
 		 1124 aa  123  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  38.18 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1616  hypothetical protein  42.65 
 
 		 238 aa  52  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0297  hypothetical protein  44.23 
 
 		 299 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.541993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0357  methyltransferase type 11  31.63 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3038  methyltransferase type 11  35.16 
 
 		 643 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236938  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4962  Methyltransferase type 11  38.33 
 
 		 222 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  47.17 
 
 		 711 aa  48.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3846  methyltransferase type 11  41.07 
 
 		 351 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403066  normal  0.436715 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1151  hypothetical protein  27.34 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  44.9 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  33.73 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0297  hypothetical protein  38.46 
 
 		 299 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  43.4 
 
 		 710 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  42.86 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2761  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 278 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  hitchhiker  0.00634675 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0334  methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1591  hypothetical protein  38 
 
 		 379 aa  45.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  44.9 
 
 		 239 aa  45.1  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  40.82 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  46.3 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  43.4 
 
 		 293 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 281 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0365  methyltransferase type 11  33.71 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2472  methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 367 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3382  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 312 aa  42.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  44.9 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 197 aa  42.4  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0435  methyltransferase type 11  33.78 
 
 		 241 aa  42  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252383  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2088  hypothetical protein  35.14 
 
 		 198 aa  41.6  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  38.78 
 
 		 241 aa  42  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  33.78 
 
 		 249 aa  42  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4520  methyltransferase domain protein  35.56 
 
 		 783 aa  41.6  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  38.78 
 
 		 237 aa  41.6  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 239 aa  41.6  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>