17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2088 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2088  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0435  methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252383  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0365  methyltransferase type 11  27.04 
 
 		 243 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2092  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 291 aa  48.5  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.80059  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 242 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 634 aa  45.8  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.13 
 
 		 345 aa  45.4  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21081  hypothetical protein  30.56 
 
 		 373 aa  44.7  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.781663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 255 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  38.33 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2060  hypothetical protein  35.14 
 
 		 216 aa  41.6  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.572806  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17021  putative sarcosine-dimethylglycine methyltransferase  31.91 
 
 		 282 aa  41.6  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 261 aa  41.2  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  39.34 
 
 		 293 aa  41.2  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>