58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0072 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0072  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  100 
 
 
223 aa  454  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0064  hypothetical protein  77.93 
 
 
222 aa  343  9e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal  0.181447 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3648  protein of unknown function DUF71, ATPase  55.5 
 
 
226 aa  222  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.224253  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2428  ATPase  46.61 
 
 
222 aa  216  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4520  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  55 
 
 
224 aa  204  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.397498  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0019  ATP binding protein  45 
 
 
223 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1767  ATPase  41.63 
 
 
244 aa  194  9e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0219688  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2929  putative ATP binding protein  40 
 
 
274 aa  194  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177336  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11968  hypothetical protein  41.43 
 
 
240 aa  181  8e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5795  ATP binding protein  44.08 
 
 
244 aa  176  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0894168 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1360  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  40.44 
 
 
228 aa  172  4e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1853  ATP binding protein  35.59 
 
 
222 aa  152  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002157  ATPase of the PP-loop superfamily  36.07 
 
 
227 aa  137  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  4.29654e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  38.12 
 
 
223 aa  128  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2885  hypothetical protein  35.81 
 
 
223 aa  122  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1771  putative ATP binding protein  30.49 
 
 
219 aa  115  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00331125 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0713  hypothetical protein  29.77 
 
 
232 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0139  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  28.06 
 
 
196 aa  96.7  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1299  hypothetical protein  29.02 
 
 
217 aa  95.9  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1118  hypothetical protein  29.02 
 
 
217 aa  95.9  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.391916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0726  hypothetical protein  27.27 
 
 
227 aa  90.1  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0238  hypothetical protein  26.51 
 
 
250 aa  89.4  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.864712  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1100  hypothetical protein  28.5 
 
 
217 aa  88.2  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_80  PP-loop ATPase  26.51 
 
 
250 aa  87.8  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0285  putative ATP binding protein  27.1 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0110  putative ATP binding protein  27.64 
 
 
248 aa  86.7  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1384  PP-loop ATPase  26.67 
 
 
245 aa  85.9  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0716  putative ATP binding protein  27.27 
 
 
210 aa  85.5  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1335  PP-loop ATPase  26.17 
 
 
242 aa  84.7  9e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_95  PP-loop ATPase  26.17 
 
 
242 aa  84.7  9e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1372  putative ATP binding protein  27.19 
 
 
213 aa  76.6  3e-13  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00257  ATPase  41.38 
 
 
101 aa  75.5  6e-13  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0105  putative ATP binding protein  25.71 
 
 
288 aa  70.1  3e-11  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2709  ATP binding protein  43.9 
 
 
242 aa  62.8  4e-09  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2825  ATP binding protein  39.76 
 
 
241 aa  58.9  6e-08  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0951589  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0801  ATP binding protein  29.22 
 
 
238 aa  58.9  6e-08  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.789554  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1634  putative ATP binding protein  27.49 
 
 
226 aa  57.4  2e-07  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1093  ATP binding protein  32.26 
 
 
221 aa  54.7  1e-06  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000290259  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2610  ATP binding protein  34.78 
 
 
245 aa  54.3  2e-06  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0466  hypothetical protein  22.27 
 
 
231 aa  53.9  2e-06  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43636  predicted protein  24.79 
 
 
652 aa  53.5  2e-06  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2904  hypothetical protein  27.06 
 
 
223 aa  52.4  6e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.449464  hitchhiker  0.000871155 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35058  predicted protein  25.53 
 
 
672 aa  49.7  4e-05  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1245  ATP binding protein  25.47 
 
 
235 aa  48.9  5e-05  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1086  ATP binding protein  34.48 
 
 
218 aa  48.5  8e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00130947  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1073  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  31.61 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0992  putative ATP binding protein  27.67 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.100611 
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  25.21 
 
 
572 aa  47  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1331  putative ATP binding protein  25.37 
 
 
223 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0609  ATP binding protein  25.37 
 
 
223 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1344  putative ATP binding protein  25.37 
 
 
223 aa  46.2  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.324314  normal  0.0449354 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1451  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  32 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.970916 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1530  putative ATP binding protein  25.96 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1353  ATP binding protein  34.15 
 
 
241 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1352  putative ATP binding protein  25.49 
 
 
238 aa  43.5  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.426698  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0529  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  30.65 
 
 
201 aa  43.5  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.111834  normal  0.30018 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2025  putative ATP binding protein  23.94 
 
 
222 aa  43.5  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.307354  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1875  putative ATP binding protein  23.36 
 
 
258 aa  42  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>