126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3406 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3406  protein of unknown function DUF204  100 
 
 		 190 aa  364  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000037692  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02440  predicted membrane protein  61.75 
 
 		 188 aa  216  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.307428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2102  protein of unknown function DUF204  60.53 
 
 		 187 aa  187  8e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1273  protein of unknown function DUF204  56.65 
 
 		 192 aa  183  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4533  hypothetical protein  62.11 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0109117 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1420  hypothetical protein  51.6 
 
 		 198 aa  166  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000356412  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1637  hypothetical protein  48.4 
 
 		 190 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000104558  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2300  protein of unknown function DUF204  52.97 
 
 		 186 aa  161  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168239  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1192  hypothetical protein  45.25 
 
 		 194 aa  153  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1412  protein of unknown function DUF204  44.51 
 
 		 189 aa  149  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000313106  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2187  protein of unknown function DUF204  46.03 
 
 		 189 aa  148  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480429 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3656  protein of unknown function DUF204  43.85 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00251893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2453  protein of unknown function DUF204  43.85 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0162  hypothetical protein  44.05 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0202  hypothetical protein  44.05 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0247  hypothetical protein  46.43 
 
 		 186 aa  137  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0503  hypothetical protein  46.88 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0516  hypothetical protein  46.88 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0180  hypothetical protein  44.39 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_952  hypothetical protein  43.23 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000542228  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1799  protein of unknown function DUF204  47.03 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.971603 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0221  hypothetical protein  45.51 
 
 		 185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0168  hypothetical protein  42.47 
 
 		 192 aa  132  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1134  hypothetical protein  41.05 
 
 		 193 aa  130  9e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000076644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3146  hypothetical protein  43.02 
 
 		 181 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.120632  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0455  hypothetical protein  42.16 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.703448 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2070  hypothetical protein  44.71 
 
 		 188 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000608383  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1974  membrane protein YebN  42.08 
 
 		 188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal  0.466937 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1978  membrane protein YebN  42.08 
 
 		 188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1297  membrane protein YebN  42.08 
 
 		 188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00128571  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1481  membrane protein YebN  42.08 
 
 		 188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.908225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02753  membrane protein YebN  40.62 
 
 		 232 aa  128  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2035  membrane protein YebN  41.53 
 
 		 188 aa  127  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.452254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0963  hypothetical protein  41.05 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000044765  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2039  hypothetical protein  48.09 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1654  membrane protein  40.22 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2322  protein of unknown function DUF204  45.5 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01791  conserved inner membrane protein  40.98 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000275472  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1822  protein of unknown function DUF204  40.98 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132525  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3755  hypothetical protein  40.11 
 
 		 190 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190288  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1911  hypothetical protein  40.98 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166044  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2050  hypothetical protein  40.98 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1811  hypothetical protein  40.98 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035153  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1366  hypothetical protein  40.98 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000222622  normal  0.0184788 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2088  hypothetical protein  40.98 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111578  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01779  hypothetical protein  40.98 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360524  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2553  hypothetical protein  40.98 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000161529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2215  protein of unknown function DUF204  40.31 
 
 		 190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000652284  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02600  predicted membrane protein  45.21 
 
 		 194 aa  125  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000087208  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4096  hypothetical protein  43.01 
 
 		 188 aa  124  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1922  hypothetical protein  39.79 
 
 		 190 aa  124  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0107711  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1979  protein of unknown function DUF204  41.58 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0850567  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2025  protein of unknown function DUF204  39.15 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.331767  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6717  protein of unknown function DUF204  38.95 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0431  hypothetical protein  39.78 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0412  hypothetical protein  40.56 
 
 		 184 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3288  hypothetical protein  43.82 
 
 		 181 aa  121  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00723105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1700  protein of unknown function DUF204  46.1 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000050274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2522  protein of unknown function DUF204  46.1 
 
 		 187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0555852 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2817  hypothetical protein  39.27 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000019593 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4397  hypothetical protein  41.18 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1725  hypothetical protein  40.57 
 
 		 178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.113656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2698  hypothetical protein  41.18 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1531  hypothetical protein  41.67 
 
 		 189 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000880885  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1699  protein of unknown function DUF204  40 
 
 		 193 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.853895  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0559  protein of unknown function DUF204  40.22 
 
 		 179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.179338  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26450  hypothetical protein  37.97 
 
 		 189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0067592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1800  cell division protein  42.78 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.145109  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7389  hypothetical protein  38.8 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03700  predicted membrane protein  37.36 
 
 		 185 aa  111  6e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0724834  normal  0.0195872 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1725  membrane protein  36.26 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1449  protein of unknown function DUF204  38.73 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.290539  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2390  hypothetical protein  38.95 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0400913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3977  protein of unknown function DUF204  37.28 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.765114  normal  0.164698 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21610  predicted membrane protein  35.14 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.890881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0090  membrane protein  37.18 
 
 		 184 aa  104  6e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0210402  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1326  hypothetical protein  38.1 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767112 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0169  hypothetical protein  36.63 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0582561  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2372  hypothetical protein  35.71 
 
 		 189 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000118461  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1655  hypothetical protein  35.71 
 
 		 189 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000365012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2468  hypothetical protein  35.71 
 
 		 189 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00922383  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1232  protein of unknown function DUF204  40.98 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0811336 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0607  hypothetical protein  39.41 
 
 		 185 aa  101  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.686733 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2978  hypothetical protein  39.88 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0770545  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0282  hypothetical protein  42.02 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0273862  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0006  hypothetical protein  33.85 
 
 		 195 aa  95.1  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000857448  hitchhiker  0.000000941545 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0005  hypothetical protein  36.84 
 
 		 197 aa  92.4  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.33307  hitchhiker  0.000135585 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0024  protein of unknown function DUF204  33.33 
 
 		 199 aa  92  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.992365 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1339  hypothetical protein  38.51 
 
 		 182 aa  91.3  8e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1107  protein of unknown function DUF204  32.11 
 
 		 192 aa  87.8  9e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0007  hypothetical protein  34.92 
 
 		 197 aa  84.7  8e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0975512  hitchhiker  0.00984847 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3165  hypothetical protein  34.59 
 
 		 180 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000676254  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1452  hypothetical protein  37.79 
 
 		 194 aa  81.3  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.960759  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1382  hypothetical protein  37.79 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.321925  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1363  hypothetical protein  35.67 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17940  predicted membrane protein  33.51 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4180  protein of unknown function DUF204  29.35 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000492866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4830  protein of unknown function DUF204  32.66 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0117076  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3845  hypothetical protein  30.27 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000297059  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5505  hypothetical protein  31.22 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000039704  unclonable  3.9395e-26 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>