More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2939 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2939  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
500 aa  952    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1959  major facilitator transporter  63.5 
 
 
488 aa  558  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.789773  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3679  major facilitator superfamily MFS_1  60.2 
 
 
523 aa  529  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  54.79 
 
 
548 aa  477  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0270  major facilitator transporter  57.99 
 
 
497 aa  472  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2150  major facilitator superfamily MFS_1  56.59 
 
 
480 aa  382  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.308405  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.75 
 
 
491 aa  365  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  40.12 
 
 
496 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  39.6 
 
 
496 aa  339  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.3 
 
 
495 aa  325  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  44.79 
 
 
486 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.48 
 
 
495 aa  318  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 
489 aa  312  9e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.13 
 
 
502 aa  312  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.9 
 
 
476 aa  311  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  36.48 
 
 
478 aa  309  9e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  36.48 
 
 
478 aa  309  9e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7581  putative multidrug transport protein  47.94 
 
 
477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.48 
 
 
478 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.48 
 
 
478 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.85 
 
 
478 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.64 
 
 
479 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.85 
 
 
479 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  39.22 
 
 
448 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.66 
 
 
495 aa  303  4.0000000000000003e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  36.67 
 
 
469 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2605  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.45 
 
 
506 aa  301  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.91 
 
 
480 aa  301  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  39.81 
 
 
490 aa  297  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  39.59 
 
 
487 aa  293  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  39.86 
 
 
500 aa  293  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  40.36 
 
 
497 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  42.65 
 
 
491 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.68 
 
 
489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  42.4 
 
 
491 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  37.89 
 
 
517 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.05 
 
 
511 aa  273  7e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.84 
 
 
569 aa  271  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.07 
 
 
666 aa  267  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  41.67 
 
 
481 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.27 
 
 
431 aa  266  5e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.19 
 
 
504 aa  265  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.53 
 
 
522 aa  259  6e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.37 
 
 
513 aa  259  8e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.31 
 
 
513 aa  259  9e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  35.31 
 
 
513 aa  259  9e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  35.31 
 
 
513 aa  259  9e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.31 
 
 
513 aa  259  9e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.31 
 
 
513 aa  259  9e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.61 
 
 
513 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.37 
 
 
513 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.37 
 
 
513 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.61 
 
 
513 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.89 
 
 
500 aa  257  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.91 
 
 
565 aa  257  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.19 
 
 
523 aa  256  8e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.23 
 
 
539 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.5 
 
 
528 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  34.87 
 
 
511 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  38.35 
 
 
537 aa  252  1e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 
484 aa  252  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1220  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 
450 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.55 
 
 
511 aa  250  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2100  major facilitator superfamily MFS_1  35.05 
 
 
449 aa  250  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  34.12 
 
 
507 aa  250  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.1 
 
 
504 aa  250  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  32.94 
 
 
507 aa  249  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.38 
 
 
511 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.38 
 
 
511 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  38.44 
 
 
1062 aa  248  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  34.38 
 
 
511 aa  247  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.99 
 
 
541 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.38 
 
 
511 aa  246  6e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.38 
 
 
511 aa  246  6e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.97 
 
 
509 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.97 
 
 
509 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.66 
 
 
678 aa  246  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.76 
 
 
504 aa  246  9e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.41 
 
 
528 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2928  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.04 
 
 
511 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000585053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2894  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.79 
 
 
511 aa  244  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0578631  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2351  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.79 
 
 
504 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500074  normal  0.144653 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.22 
 
 
504 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.23 
 
 
538 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.8 
 
 
501 aa  241  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.64 
 
 
697 aa  241  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.85 
 
 
561 aa  241  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  38.37 
 
 
515 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.32 
 
 
509 aa  240  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.23 
 
 
525 aa  239  6.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.79 
 
 
562 aa  239  9e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.06 
 
 
676 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.71 
 
 
504 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  33.81 
 
 
537 aa  237  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  33.81 
 
 
537 aa  237  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.39 
 
 
509 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.72 
 
 
501 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.3 
 
 
535 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  32.72 
 
 
487 aa  235  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.13 
 
 
510 aa  236  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0468025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>