More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0649 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0649  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  100 
 
 
743 aa  1444    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0201  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  77.08 
 
 
713 aa  599  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  70.74 
 
 
737 aa  597  1e-169  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36570  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  76.86 
 
 
690 aa  598  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.429514  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0427  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  71.04 
 
 
774 aa  592  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0475  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  72.4 
 
 
765 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00148919  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1281  DNA polymerase III subunits gamma and tau  69.77 
 
 
652 aa  578  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0252  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  71.1 
 
 
834 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0123718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4909  DNA polymerase III subunits gamma and tau  72.75 
 
 
616 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4998  DNA polymerase III subunits gamma and tau  72.75 
 
 
616 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5277  DNA polymerase III subunits gamma and tau  72.75 
 
 
618 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028048  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13753  DNA polymerase III subunits gamma and tau  67.37 
 
 
578 aa  570  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0213  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  71.88 
 
 
808 aa  565  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  69.61 
 
 
729 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.698933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  70.28 
 
 
643 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4926  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  69.35 
 
 
715 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  66.75 
 
 
690 aa  560  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0051  DNA polymerase III subunits gamma and tau  71.35 
 
 
692 aa  556  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9315  DNA-directed DNA polymerase  68.67 
 
 
727 aa  557  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  60.92 
 
 
637 aa  556  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.780836  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4819  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  67.96 
 
 
732 aa  547  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14657  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9029  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  67.01 
 
 
863 aa  540  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0555  DNA polymerase III subunits gamma and tau  64.45 
 
 
1078 aa  531  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.533437  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0317  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  69.09 
 
 
678 aa  527  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6564  DNA polymerase III subunits gamma and tau  65.46 
 
 
855 aa  521  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0270  DNA polymerase III subunits gamma and tau  65.45 
 
 
812 aa  515  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25950  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  63.64 
 
 
796 aa  509  1e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0548  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  65.67 
 
 
841 aa  506  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02650  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  47.17 
 
 
1159 aa  494  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28470  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  63.46 
 
 
1122 aa  480  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3125  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  64.49 
 
 
878 aa  481  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0603821  decreased coverage  0.0000225707 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04710  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  64.08 
 
 
872 aa  478  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0466  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  66.75 
 
 
712 aa  475  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.957153  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  61.34 
 
 
872 aa  463  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.69984 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0126  DNA polymerase III, subunit gamma and tau  55.84 
 
 
801 aa  442  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1289  DNA polymerase III subunits gamma and tau  58.76 
 
 
960 aa  432  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  43.84 
 
 
579 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.02 
 
 
579 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.4 
 
 
582 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.22 
 
 
551 aa  301  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  40.87 
 
 
582 aa  300  5e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.43 
 
 
569 aa  300  6e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.21 
 
 
582 aa  296  7e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.19 
 
 
589 aa  295  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.21 
 
 
579 aa  295  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.16 
 
 
562 aa  292  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.81 
 
 
562 aa  291  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.05 
 
 
562 aa  291  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.81 
 
 
562 aa  291  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.81 
 
 
562 aa  291  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6870  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.08 
 
 
649 aa  291  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.351092 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.15 
 
 
562 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.6 
 
 
567 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.48 
 
 
562 aa  290  8e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.48 
 
 
562 aa  289  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.6 
 
 
562 aa  288  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.23 
 
 
562 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.4 
 
 
562 aa  288  4e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.82 
 
 
518 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.69 
 
 
518 aa  284  5.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.14 
 
 
547 aa  283  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.26 
 
 
427 aa  281  4e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.54 
 
 
588 aa  280  7e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.88 
 
 
561 aa  278  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  35.1 
 
 
568 aa  275  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0542  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.61 
 
 
570 aa  275  3e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000531282  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3199  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.43 
 
 
613 aa  271  4e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000104981  normal  0.61313 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0046  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.27 
 
 
522 aa  270  8e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241439  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0242  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.54 
 
 
562 aa  270  8.999999999999999e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000227385  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.1 
 
 
735 aa  270  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.21 
 
 
606 aa  270  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.39 
 
 
550 aa  268  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.19 
 
 
599 aa  267  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1322  DNA-directed DNA polymerase  39.37 
 
 
396 aa  267  5e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.403308  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.91 
 
 
565 aa  266  8e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.91 
 
 
565 aa  266  8e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0050  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.01 
 
 
554 aa  266  8e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022733  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1138  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.29 
 
 
550 aa  266  1e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.94 
 
 
527 aa  265  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.07 
 
 
520 aa  264  4.999999999999999e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.85 
 
 
611 aa  264  6e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0950425  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.86 
 
 
589 aa  263  6e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.17 
 
 
602 aa  263  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.78 
 
 
591 aa  263  1e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.775776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.5 
 
 
559 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  37.56 
 
 
900 aa  261  4e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.58 
 
 
601 aa  261  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.58 
 
 
601 aa  260  6e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1572  DNA polymerase III, tau subunit  43.73 
 
 
572 aa  260  6e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13387  hitchhiker  0.00000463974 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.12 
 
 
540 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0828  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.67 
 
 
554 aa  259  2e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.12 
 
 
632 aa  258  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  38.55 
 
 
559 aa  257  4e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.23 
 
 
447 aa  256  8e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2107  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.17 
 
 
534 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00560473  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3922  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.34 
 
 
575 aa  256  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0150926  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40 
 
 
755 aa  255  2.0000000000000002e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1335  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.17 
 
 
690 aa  254  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0235479  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1613  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.89 
 
 
637 aa  254  5.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000410993  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.66 
 
 
644 aa  253  9.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.566282  normal  0.158563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>