91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0072 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0072  protein of unknown function DUF881  100 
 
 
242 aa  479  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0033  protein of unknown function DUF881  47.37 
 
 
255 aa  196  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.249833  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0013  hypothetical protein  48.56 
 
 
278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.447564 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0013  hypothetical protein  48.56 
 
 
278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0021  hypothetical protein  48.56 
 
 
278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0814  hypothetical protein  44.13 
 
 
253 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244335  normal  0.77774 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0020  hypothetical protein  45.34 
 
 
272 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.987463 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0015  hypothetical protein  47.08 
 
 
263 aa  186  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0052  hypothetical protein  47.72 
 
 
309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274482  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0026  protein of unknown function DUF881  45.34 
 
 
249 aa  180  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.131728  normal  0.126643 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0057  hypothetical protein  45.61 
 
 
267 aa  179  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.573043 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4438  hypothetical protein  58.06 
 
 
329 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.226653  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00170  hypothetical protein  42.31 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0524836  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0022  protein of unknown function DUF881  50.81 
 
 
243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0042  protein of unknown function DUF881  42.53 
 
 
270 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10012  hypothetical protein  42.86 
 
 
262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27030  hypothetical protein  40.69 
 
 
252 aa  159  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.99659  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0132  hypothetical protein  57.05 
 
 
296 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0808473  normal  0.140959 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0014  protein of unknown function DUF881  42.67 
 
 
257 aa  155  7e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00160  hypothetical protein  47.95 
 
 
250 aa  149  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0167  protein of unknown function DUF881  49.66 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.942049  normal  0.647694 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0021  protein of unknown function DUF881  48.78 
 
 
280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1386  hypothetical protein  48.46 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00318701  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0021  hypothetical protein  34.58 
 
 
273 aa  131  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0028  hypothetical protein  37.5 
 
 
251 aa  124  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0214  hypothetical protein  30.57 
 
 
245 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0781  protein of unknown function DUF881  26.86 
 
 
247 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000128964  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1060  protein of unknown function DUF881  30.68 
 
 
243 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2249  hypothetical protein  34.09 
 
 
244 aa  99  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2283  hypothetical protein  34.19 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0076216  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1431  hypothetical protein  33.15 
 
 
238 aa  95.9  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2006  hypothetical protein  29.7 
 
 
240 aa  93.2  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.124974  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3123  protein of unknown function DUF881  31.14 
 
 
292 aa  89  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0680  hypothetical protein  28.46 
 
 
233 aa  89  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196339  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1558  protein of unknown function DUF881  32.96 
 
 
215 aa  87  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0909499  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1889  protein of unknown function DUF881  37.59 
 
 
306 aa  85.9  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2730  protein of unknown function DUF881  40.69 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242021  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0830  hypothetical protein  27.46 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0105495  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1230  hypothetical protein  36.08 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3100  protein of unknown function DUF881  38.52 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0127395 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1284  protein of unknown function DUF881  31.72 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.954105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0147  protein of unknown function DUF881  29.41 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1305  protein of unknown function DUF881  28.96 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.498875  normal  0.86691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4014  protein of unknown function DUF881  32.84 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.328568  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18230  hypothetical protein  32.62 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509539  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1076  hypothetical protein  25.78 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1557  protein of unknown function DUF881  27.83 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000499262  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2105  protein of unknown function DUF881  33.58 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0569  protein of unknown function DUF881  32.03 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.787113  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1430  hypothetical protein  29 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0373579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1024  protein of unknown function DUF881  25.11 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000489323  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15490  hypothetical protein  35.44 
 
 
315 aa  68.6  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2717  hypothetical protein  26.81 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.270572  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11853  hypothetical protein  34.01 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3406  hypothetical protein  32.67 
 
 
296 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1061  protein of unknown function DUF881  25.38 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1075  hypothetical protein  25.69 
 
 
233 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1894  protein of unknown function DUF881  27.41 
 
 
234 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2892  hypothetical protein  30.6 
 
 
304 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.619599  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2109  hypothetical protein  26.4 
 
 
243 aa  63.5  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0163543  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2848  hypothetical protein  30.6 
 
 
304 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2386  hypothetical protein  32.89 
 
 
309 aa  63.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0681  hypothetical protein  27.84 
 
 
230 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0718153  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2879  hypothetical protein  30.6 
 
 
304 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2524  hypothetical protein  32.43 
 
 
316 aa  62.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1823  hypothetical protein  26.97 
 
 
243 aa  62.4  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00133406  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1285  protein of unknown function DUF881  29.2 
 
 
246 aa  62.4  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1735  protein of unknown function DUF881  36.03 
 
 
290 aa  61.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.980276  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3139  hypothetical protein  29.66 
 
 
297 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5001  hypothetical protein  31.62 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11855  hypothetical protein  28.45 
 
 
292 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12540  hypothetical protein  24.54 
 
 
331 aa  55.5  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2890  hypothetical protein  27.94 
 
 
270 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2846  hypothetical protein  27.94 
 
 
270 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2877  hypothetical protein  27.94 
 
 
270 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15010  hypothetical protein  37.36 
 
 
276 aa  51.2  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.290964  normal  0.849672 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0570  protein of unknown function DUF881  27.27 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4012  protein of unknown function DUF881  33.08 
 
 
255 aa  49.3  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033042  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2715  hypothetical protein  30.33 
 
 
245 aa  48.9  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0632611  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1464  hypothetical protein  26.29 
 
 
300 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.420029  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0148  protein of unknown function DUF881  26.32 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2522  hypothetical protein  33.94 
 
 
309 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0801  hypothetical protein  24.43 
 
 
349 aa  47  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2250  hypothetical protein  26.09 
 
 
242 aa  45.4  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3098  protein of unknown function DUF881  30.7 
 
 
258 aa  45.4  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1737  protein of unknown function DUF881  28.72 
 
 
383 aa  45.4  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.588526  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3404  hypothetical protein  30.99 
 
 
254 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227023  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14990  hypothetical protein  28.49 
 
 
248 aa  43.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200015  normal  0.621189 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1025  protein of unknown function DUF881  30 
 
 
239 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540335  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0799  hypothetical protein  20.51 
 
 
278 aa  42.4  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2384  hypothetical protein  30.28 
 
 
305 aa  42  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>