86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0132 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0132  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  565  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0808473  normal  0.140959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4438  hypothetical protein  50.38 
 
 
329 aa  207  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.226653  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0015  hypothetical protein  45.38 
 
 
263 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0026  protein of unknown function DUF881  45.45 
 
 
249 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.131728  normal  0.126643 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0072  protein of unknown function DUF881  47.37 
 
 
242 aa  172  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0022  protein of unknown function DUF881  48.28 
 
 
243 aa  165  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0052  hypothetical protein  60.53 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274482  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0057  hypothetical protein  62.68 
 
 
267 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.573043 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00160  hypothetical protein  43.2 
 
 
250 aa  155  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0033  protein of unknown function DUF881  41.94 
 
 
255 aa  153  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.249833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0042  protein of unknown function DUF881  52.17 
 
 
270 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0814  hypothetical protein  41.56 
 
 
253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244335  normal  0.77774 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27030  hypothetical protein  40.93 
 
 
252 aa  151  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.99659  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0013  hypothetical protein  47.19 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0021  hypothetical protein  47.19 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0013  hypothetical protein  47.19 
 
 
278 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.447564 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1386  hypothetical protein  38.37 
 
 
266 aa  144  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00318701  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00170  hypothetical protein  49.07 
 
 
234 aa  143  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0524836  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0021  protein of unknown function DUF881  40.68 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0020  hypothetical protein  41.67 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.987463 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10012  hypothetical protein  41.56 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0167  protein of unknown function DUF881  46.67 
 
 
253 aa  140  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.942049  normal  0.647694 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0014  protein of unknown function DUF881  40.25 
 
 
257 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0028  hypothetical protein  45.52 
 
 
251 aa  130  3e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2283  hypothetical protein  34.65 
 
 
249 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0076216  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0781  protein of unknown function DUF881  33.93 
 
 
247 aa  105  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000128964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0214  hypothetical protein  29.06 
 
 
245 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0021  hypothetical protein  35.1 
 
 
273 aa  99  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2006  hypothetical protein  27.78 
 
 
240 aa  95.5  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.124974  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0830  hypothetical protein  34.97 
 
 
239 aa  94  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0105495  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1060  protein of unknown function DUF881  27.24 
 
 
243 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1230  hypothetical protein  33.83 
 
 
301 aa  87  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2524  hypothetical protein  34.01 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2249  hypothetical protein  36.05 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1558  protein of unknown function DUF881  29.65 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0909499  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15490  hypothetical protein  32.64 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1061  protein of unknown function DUF881  27.31 
 
 
234 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1430  hypothetical protein  32.66 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0373579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0680  hypothetical protein  28.65 
 
 
233 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196339  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2730  protein of unknown function DUF881  39.39 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242021  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2386  hypothetical protein  32.99 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0569  protein of unknown function DUF881  22.98 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.787113  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3100  protein of unknown function DUF881  37.1 
 
 
290 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0127395 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1431  hypothetical protein  33.33 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18230  hypothetical protein  30.26 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509539  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1284  protein of unknown function DUF881  29.03 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.954105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0147  protein of unknown function DUF881  25.99 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1305  protein of unknown function DUF881  32.76 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.498875  normal  0.86691 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1894  protein of unknown function DUF881  34.65 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1557  protein of unknown function DUF881  31.61 
 
 
234 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000499262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3123  protein of unknown function DUF881  35.58 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1024  protein of unknown function DUF881  30.77 
 
 
235 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000489323  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3406  hypothetical protein  38 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2109  hypothetical protein  22.96 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0163543  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1889  protein of unknown function DUF881  37.39 
 
 
306 aa  67  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2105  protein of unknown function DUF881  31.05 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11853  hypothetical protein  34 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1076  hypothetical protein  30.46 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2848  hypothetical protein  34 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1823  hypothetical protein  22.92 
 
 
243 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00133406  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2717  hypothetical protein  30.89 
 
 
286 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.270572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2892  hypothetical protein  34 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.619599  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2879  hypothetical protein  34 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3139  hypothetical protein  34 
 
 
297 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0681  hypothetical protein  27.16 
 
 
230 aa  62.4  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0718153  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4014  protein of unknown function DUF881  26.63 
 
 
299 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.328568  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12540  hypothetical protein  31 
 
 
331 aa  60.1  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1735  protein of unknown function DUF881  38.32 
 
 
290 aa  59.3  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.980276  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2250  hypothetical protein  26.56 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1075  hypothetical protein  25.14 
 
 
233 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0801  hypothetical protein  26.8 
 
 
349 aa  53.5  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5001  hypothetical protein  40.98 
 
 
297 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2111  hypothetical protein  25.27 
 
 
238 aa  53.1  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1464  hypothetical protein  29.63 
 
 
300 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.420029  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0476  hypothetical protein  28.26 
 
 
325 aa  48.9  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.75906  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1825  hypothetical protein  23.91 
 
 
238 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0612463  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15010  hypothetical protein  40.74 
 
 
276 aa  48.9  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.290964  normal  0.849672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11855  hypothetical protein  38.33 
 
 
292 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0148  protein of unknown function DUF881  26.83 
 
 
230 aa  46.6  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1285  protein of unknown function DUF881  29.63 
 
 
246 aa  45.8  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2282  hypothetical protein  34.04 
 
 
235 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0713183  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1737  protein of unknown function DUF881  27.14 
 
 
383 aa  44.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.588526  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2877  hypothetical protein  32.35 
 
 
270 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2890  hypothetical protein  32.35 
 
 
270 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2846  hypothetical protein  32.35 
 
 
270 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1887  protein of unknown function DUF881  36.67 
 
 
388 aa  42.4  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.201634 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>