More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0420 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0048  malic enzyme  47.44 
 
 		 761 aa  643    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  46.5 
 
 		 751 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7102  malic enzyme  48.11 
 
 		 763 aa  647    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30073  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0118  malic enzyme  54.61 
 
 		 763 aa  793    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0158  malic enzyme  47.44 
 
 		 764 aa  642    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  46.5 
 
 		 759 aa  638    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6546  malic enzyme  49.13 
 
 		 763 aa  656    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00415909  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3542  malic enzyme  49.93 
 
 		 753 aa  700    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3291  malic enzyme  50.13 
 
 		 754 aa  668    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442539  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0420  malic enzyme  100 
 
 		 750 aa  1529    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0175  malic enzyme  53.86 
 
 		 758 aa  788    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  46.86 
 
 		 754 aa  646    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0029  malic enzyme  49.53 
 
 		 761 aa  644    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328842 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2760  malic enzyme  47.35 
 
 		 753 aa  635    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  48.78 
 
 		 754 aa  701    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2792  malic enzyme  49.39 
 
 		 754 aa  659    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.776027  normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4968  malic enzyme  47.17 
 
 		 762 aa  659    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4030  malic enzyme  48.92 
 
 		 761 aa  653    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1333  malic enzyme  48.86 
 
 		 758 aa  644    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.306693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3020  malic enzyme  50.14 
 
 		 761 aa  672    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0848  malic enzyme  47.13 
 
 		 760 aa  655    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0033  malic enzyme  48.11 
 
 		 761 aa  634  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.43478 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  45.82 
 
 		 752 aa  634  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2877  malic enzyme  47.52 
 
 		 751 aa  632  1e-180  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.857329 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  46.05 
 
 		 759 aa  622  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.692294 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  45.39 
 
 		 759 aa  619  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2609  malic enzyme  45.39 
 
 		 759 aa  619  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3472  malic enzyme  45.98 
 
 		 759 aa  619  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.382642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  45.53 
 
 		 759 aa  620  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2654  malic enzyme  45.96 
 
 		 751 aa  622  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.820528 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1214  malic enzyme  45.39 
 
 		 759 aa  619  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3684  malic enzyme  45.39 
 
 		 759 aa  619  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.392037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  45.39 
 
 		 759 aa  619  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  45.26 
 
 		 759 aa  617  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2731  malic enzyme  45.53 
 
 		 759 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2664  malic enzyme  45.53 
 
 		 759 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02316  hypothetical protein  45.26 
 
 		 759 aa  617  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2838  malic enzyme  45.53 
 
 		 759 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2829  malic enzyme  45.39 
 
 		 759 aa  617  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.946085  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2616  malic enzyme  45.53 
 
 		 759 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2705  malic enzyme  45.39 
 
 		 759 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0765  malic enzyme  45.36 
 
 		 754 aa  607  9.999999999999999e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0423248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  43.99 
 
 		 752 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  44.67 
 
 		 752 aa  602  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  43.99 
 
 		 780 aa  599  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  43.39 
 
 		 776 aa  600  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3292  malic enzyme  43.42 
 
 		 759 aa  600  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0754  malic enzyme  44.17 
 
 		 759 aa  595  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0943824  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0990  malic enzyme  43.74 
 
 		 759 aa  598  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3833  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  44.7 
 
 		 771 aa  597  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.701616  normal  0.763898 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3213  malic enzyme  43.74 
 
 		 759 aa  597  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1888  malic enzyme  43.65 
 
 		 749 aa  593  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2321  malic enzyme  43.51 
 
 		 749 aa  593  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3722  malic enzyme  43.56 
 
 		 766 aa  593  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  42.65 
 
 		 764 aa  593  1e-168  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  43.28 
 
 		 766 aa  590  1e-167  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2289  malic enzyme  44.01 
 
 		 757 aa  587  1e-166  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999733  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1269  malic enzyme  42.99 
 
 		 779 aa  586  1e-166  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.525931  normal  0.614845 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02395  malic enzyme  42.51 
 
 		 769 aa  587  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.766678  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1455  malic enzyme  43.18 
 
 		 779 aa  587  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1277  malic enzyme  43.9 
 
 		 759 aa  586  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1391  malic enzyme  43.9 
 
 		 759 aa  586  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.603057  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2786  malic enzyme  43.77 
 
 		 759 aa  585  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0144029 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3352  malic enzyme  43.18 
 
 		 763 aa  582  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49326  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1017  malic enzyme  44.64 
 
 		 774 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1262  malic enzyme  44.19 
 
 		 752 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00802649  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2328  malic enzyme  41.83 
 
 		 775 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  44.01 
 
 		 752 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3876  malic enzyme  42.91 
 
 		 769 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0984  malic enzyme  44.64 
 
 		 774 aa  575  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0878  malic enzyme  43.24 
 
 		 773 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0295  malic enzyme  42.32 
 
 		 764 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0622  malic enzyme  43.73 
 
 		 777 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0117628  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1993  malic enzyme  44.85 
 
 		 770 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.435616  normal  0.577438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2106  malic enzyme  43.43 
 
 		 765 aa  571  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.161239 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3943  malic enzyme  43.01 
 
 		 758 aa  571  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00128716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2441  malic enzyme  42.93 
 
 		 777 aa  569  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1243  malic enzyme  41.31 
 
 		 769 aa  569  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0248  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  43.07 
 
 		 757 aa  569  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0265  malic enzyme  42.06 
 
 		 764 aa  571  1e-161  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.8165  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2911  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  43.57 
 
 		 755 aa  570  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2206  malic enzyme  44.18 
 
 		 770 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0610727  normal  0.106341 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2767  malic enzyme  44.04 
 
 		 781 aa  567  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0582903  normal  0.182467 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1651  malic enzyme  43.22 
 
 		 763 aa  567  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1209  oxaloacetate-decarboxylating malate dehydrogenase (NADP(+)) phosphate acetyltransferase  42.5 
 
 		 761 aa  567  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000448619 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0465  malic enzyme  43.55 
 
 		 755 aa  566  1e-160  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00312155  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2224  malic enzyme  43.08 
 
 		 759 aa  567  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3674  malic enzyme  43.06 
 
 		 760 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0789225  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2869  malic enzyme  43.39 
 
 		 761 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000177126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  43.2 
 
 		 760 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  42.86 
 
 		 749 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1891  malic enzyme  44.31 
 
 		 768 aa  564  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0220  malic enzyme  42.12 
 
 		 756 aa  561  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.667581  hitchhiker  0.000000000555006 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2603  malic enzyme  43.98 
 
 		 781 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233232  normal  0.639097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0498  malic enzyme  43.41 
 
 		 775 aa  560  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423253  normal  0.484498 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3013  malic enzyme  43.98 
 
 		 781 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  44.39 
 
 		 757 aa  561  1e-158  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2174  malic enzyme  42.78 
 
 		 786 aa  560  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139464  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  41.9 
 
 		 756 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0245  malic enzyme  42.13 
 
 		 756 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000009441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>