More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1261 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 		 160 aa  325  1.0000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.46 
 
 		 158 aa  181  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0071  NADPH-dependent FMN reductase  47.13 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109479  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  44.64 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1106  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.2 
 
 		 156 aa  144  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.796872  normal  0.0316992 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1205  flavodoxin family protein  42.41 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3607  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.51 
 
 		 156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0330  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.57 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  37.37 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  37.37 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  37.37 
 
 		 199 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  37.88 
 
 		 199 aa  118  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  38.38 
 
 		 200 aa  117  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3216  flavoprotein WrbA  37.06 
 
 		 199 aa  117  9e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  36.36 
 
 		 199 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3669  TrpR binding protein WrbA  38.07 
 
 		 199 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196893 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  36.18 
 
 		 200 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0979  TrpR binding protein WrbA  38.07 
 
 		 199 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0057  flavoprotein WrbA  35.86 
 
 		 200 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0784  TrpR binding protein WrbA  37.06 
 
 		 199 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4332  flavoprotein WrbA  37.06 
 
 		 199 aa  111  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  35.86 
 
 		 199 aa  111  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1650  TrpR binding protein WrbA  36.04 
 
 		 199 aa  110  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4352  TrpR binding protein WrbA  37.56 
 
 		 199 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  35 
 
 		 201 aa  110  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5355  flavoprotein WrbA  33.16 
 
 		 199 aa  110  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272087  normal  0.149509 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0978  TrpR binding protein WrbA  36.04 
 
 		 199 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.642178  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4506  TrpR binding protein WrbA  35.53 
 
 		 199 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860905  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1594  TrpR binding protein WrbA  35.86 
 
 		 198 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03195  hypothetical protein  34.24 
 
 		 190 aa  107  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4229  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.65 
 
 		 198 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234243  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  34.34 
 
 		 199 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4096  TrpR binding protein WrbA  34.52 
 
 		 199 aa  107  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.832118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1246  flavoprotein WrbA  37.17 
 
 		 201 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000168945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1206  flavoprotein WrbA  37.17 
 
 		 201 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2990  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.27 
 
 		 198 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  hitchhiker  0.0079617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1644  trp repressor binding protein  37.17 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4073  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.17 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  34.67 
 
 		 200 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  34.85 
 
 		 200 aa  104  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002786  Trp repressor-binding protein  33.7 
 
 		 189 aa  104  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.67 
 
 		 202 aa  103  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2810  TrpR binding protein WrbA  34.85 
 
 		 199 aa  103  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  32.02 
 
 		 204 aa  103  9e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  33.66 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  34.34 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  37.24 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02144  Flavodoxin/nitric oxide synthase  33.16 
 
 		 200 aa  102  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0314978  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4560  Trp repressor binding protein WrbA  37.7 
 
 		 198 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309608  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51990  Trp repressor binding protein WrbA  37.17 
 
 		 198 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164992 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  32.83 
 
 		 200 aa  101  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  32.83 
 
 		 200 aa  101  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4089  flavoprotein WrbA  32.16 
 
 		 199 aa  100  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  32.51 
 
 		 204 aa  100  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3183  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.13 
 
 		 205 aa  100  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.202353  decreased coverage  0.0000326844 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  34.17 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1686  trp repressor binding protein  34.03 
 
 		 201 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3703  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.55 
 
 		 201 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5226  TrpR binding protein WrbA  35.88 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  33.17 
 
 		 200 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  33.17 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  33.67 
 
 		 200 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  33.17 
 
 		 200 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  33.84 
 
 		 200 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1973  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.65 
 
 		 205 aa  98.2  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  33.17 
 
 		 200 aa  98.2  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  31.98 
 
 		 201 aa  96.7  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0705  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.36 
 
 		 220 aa  96.3  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1474  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0913  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.38 
 
 		 203 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5986  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):flavodoxin/nitric oxide synthase  34.52 
 
 		 208 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0631  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.97 
 
 		 212 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2247  flavoprotein WrbA  34.36 
 
 		 205 aa  95.5  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2136  TrpR binding protein WrbA  31.47 
 
 		 199 aa  95.5  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1683  flavoprotein WrbA  32.63 
 
 		 207 aa  95.1  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.308348  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2485  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.29 
 
 		 198 aa  95.1  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2568  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.71 
 
 		 202 aa  94.4  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  34.74 
 
 		 206 aa  94  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1014  TrpR binding protein WrbA  30.96 
 
 		 199 aa  94  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.86 
 
 		 200 aa  93.6  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.938759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  32.66 
 
 		 203 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1049  TrpR binding protein WrbA  30.96 
 
 		 199 aa  93.2  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0643  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  36.97 
 
 		 172 aa  93.6  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1932  TrpR binding protein WrbA  36.55 
 
 		 199 aa  93.6  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.66734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  38.81 
 
 		 195 aa  92.8  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0899  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  32.81 
 
 		 199 aa  92.8  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000786086 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1746  Trp repressor-binding protein  32.07 
 
 		 186 aa  92.8  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  31.5 
 
 		 203 aa  92  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  31.68 
 
 		 204 aa  92  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0715  flavoprotein WrbA  33.5 
 
 		 197 aa  91.7  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.358899 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0896  flavoprotein WrbA  31.77 
 
 		 197 aa  91.3  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1766  NAD(P)H:quinone oxidoreductase, type IV  33.33 
 
 		 197 aa  90.9  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0768  flavoprotein WrbA  34.22 
 
 		 208 aa  91.3  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4564  TrpR binding protein WrbA  32 
 
 		 208 aa  91.3  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0408  trp repressor binding protein  33.33 
 
 		 197 aa  90.9  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0700  hypothetical protein  33.86 
 
 		 199 aa  90.5  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.02 
 
 		 190 aa  90.5  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.02 
 
 		 190 aa  90.5  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0682  hypothetical protein  33.86 
 
 		 199 aa  90.1  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0737  flavoprotein WrbA  32.31 
 
 		 197 aa  90.1  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.438501  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0566  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  36.24 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>