24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0659 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0659  DNA polymerase II small subunit  100 
 
 		 487 aa  1000    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.629258  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1005  DNA polymerase II small subunit  49.02 
 
 		 674 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0035  DNA polymerase II small subunit  42.65 
 
 		 465 aa  381  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0409  DNA polymerase II small subunit  41.75 
 
 		 467 aa  375  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.894742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2412  DNA polymerase II small subunit  40.29 
 
 		 474 aa  377  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0004  DNA polymerase II small subunit  40.52 
 
 		 471 aa  353  4e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0045  DNA polymerase II small subunit  40.89 
 
 		 467 aa  353  4e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0817  DNA-directed DNA polymerase  36.5 
 
 		 527 aa  338  9.999999999999999e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0685678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1212  DNA polymerase II small subunit  39.04 
 
 		 594 aa  330  3e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1166  DNA polymerase II small subunit  42.93 
 
 		 640 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0004  DNA-directed DNA polymerase  35.73 
 
 		 517 aa  325  2e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1005  DNA polymerase II small subunit  43 
 
 		 578 aa  320  5e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1933  DNA-directed DNA polymerase  34.9 
 
 		 514 aa  317  2e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0003  DNA polymerase II small subunit  40.54 
 
 		 588 aa  317  3e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.626198 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1676  DNA polymerase II small subunit  42.49 
 
 		 583 aa  316  6e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0941  DNA polymerase II small subunit  42.24 
 
 		 584 aa  316  6e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1610  DNA polymerase II small subunit  35.12 
 
 		 537 aa  315  9.999999999999999e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0612  DNA-directed DNA polymerase  37.24 
 
 		 466 aa  291  1e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0002  DNA polymerase II small subunit  35.76 
 
 		 481 aa  276  8e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00780  DNA polymerase Delta, small subunit, putative  27.98 
 
 		 510 aa  50.1  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.177257  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1821  metallophosphoesterase  22.13 
 
 		 273 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177356  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3799  metallophosphoesterase  21.56 
 
 		 270 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000165478 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1993  metallophosphoesterase  24.33 
 
 		 322 aa  44.3  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.511822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0951  metallophosphoesterase  22.59 
 
 		 272 aa  43.1  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303704 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>