19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0003 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1933  DNA-directed DNA polymerase  62.76 
 
 		 514 aa  730    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0004  DNA-directed DNA polymerase  64.46 
 
 		 517 aa  752    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0817  DNA-directed DNA polymerase  63.16 
 
 		 527 aa  742    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0685678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0003  DNA polymerase II small subunit  100 
 
 		 588 aa  1194    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.626198 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1610  DNA polymerase II small subunit  59.13 
 
 		 537 aa  684    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1005  DNA polymerase II small subunit  44.08 
 
 		 674 aa  382  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2412  DNA polymerase II small subunit  43.75 
 
 		 474 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0409  DNA polymerase II small subunit  41.35 
 
 		 467 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.894742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1212  DNA polymerase II small subunit  40.46 
 
 		 594 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0045  DNA polymerase II small subunit  43.32 
 
 		 467 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1005  DNA polymerase II small subunit  41.37 
 
 		 578 aa  320  6e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0659  DNA polymerase II small subunit  40.54 
 
 		 487 aa  317  3e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.629258  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0941  DNA polymerase II small subunit  41.12 
 
 		 584 aa  317  3e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1166  DNA polymerase II small subunit  39.24 
 
 		 640 aa  316  7e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0035  DNA polymerase II small subunit  39.32 
 
 		 465 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1676  DNA polymerase II small subunit  40.86 
 
 		 583 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0004  DNA polymerase II small subunit  42.13 
 
 		 471 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0612  DNA-directed DNA polymerase  38.11 
 
 		 466 aa  302  9e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0002  DNA polymerase II small subunit  35.47 
 
 		 481 aa  259  1e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>