21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1212 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0941  DNA polymerase II small subunit  73.3 
 
 		 584 aa  876    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1005  DNA polymerase II small subunit  72.88 
 
 		 578 aa  894    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1166  DNA polymerase II small subunit  57.1 
 
 		 640 aa  724    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1212  DNA polymerase II small subunit  100 
 
 		 594 aa  1204    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1676  DNA polymerase II small subunit  72.59 
 
 		 583 aa  866    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1005  DNA polymerase II small subunit  43.72 
 
 		 674 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0817  DNA-directed DNA polymerase  44.27 
 
 		 527 aa  349  9e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0685678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1610  DNA polymerase II small subunit  42.03 
 
 		 537 aa  336  7.999999999999999e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0004  DNA-directed DNA polymerase  41.22 
 
 		 517 aa  331  2e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0659  DNA polymerase II small subunit  39.04 
 
 		 487 aa  330  4e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.629258  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0003  DNA polymerase II small subunit  40.46 
 
 		 588 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.626198 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2412  DNA polymerase II small subunit  40.35 
 
 		 474 aa  324  3e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1933  DNA-directed DNA polymerase  41.22 
 
 		 514 aa  324  4e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0035  DNA polymerase II small subunit  41.27 
 
 		 465 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0409  DNA polymerase II small subunit  40.64 
 
 		 467 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.894742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0045  DNA polymerase II small subunit  40.33 
 
 		 467 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0004  DNA polymerase II small subunit  40.16 
 
 		 471 aa  282  1e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0612  DNA-directed DNA polymerase  36.76 
 
 		 466 aa  261  2e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0002  DNA polymerase II small subunit  34.61 
 
 		 481 aa  257  5e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1081  hypothetical protein  25.14 
 
 		 309 aa  46.2  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.31705 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1040  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.43 
 
 		 312 aa  45.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.269036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>