33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0045 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0409  DNA polymerase II small subunit  66.17 
 
 		 467 aa  650    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.894742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0045  DNA polymerase II small subunit  100 
 
 		 467 aa  959    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0035  DNA polymerase II small subunit  66.31 
 
 		 465 aa  655    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2412  DNA polymerase II small subunit  63.52 
 
 		 474 aa  611  9.999999999999999e-175  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0004  DNA polymerase II small subunit  52.68 
 
 		 471 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1005  DNA polymerase II small subunit  47.79 
 
 		 674 aa  387  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0659  DNA polymerase II small subunit  40.89 
 
 		 487 aa  353  4e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.629258  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0817  DNA-directed DNA polymerase  43.87 
 
 		 527 aa  334  3e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0685678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0004  DNA-directed DNA polymerase  42.86 
 
 		 517 aa  331  2e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0003  DNA polymerase II small subunit  43.32 
 
 		 588 aa  327  3e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.626198 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1933  DNA-directed DNA polymerase  43.69 
 
 		 514 aa  326  5e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1610  DNA polymerase II small subunit  43.86 
 
 		 537 aa  323  4e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0612  DNA-directed DNA polymerase  37.76 
 
 		 466 aa  314  1.9999999999999998e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1212  DNA polymerase II small subunit  40.33 
 
 		 594 aa  311  2e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1166  DNA polymerase II small subunit  40.64 
 
 		 640 aa  292  7e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1005  DNA polymerase II small subunit  39.95 
 
 		 578 aa  288  2e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1676  DNA polymerase II small subunit  39.71 
 
 		 583 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0941  DNA polymerase II small subunit  39.71 
 
 		 584 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0002  DNA polymerase II small subunit  33.74 
 
 		 481 aa  253  5.000000000000001e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4491  metallophosphoesterase  25.2 
 
 		 265 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1083  metallophosphoesterase  24.6 
 
 		 278 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1445  metallophosphoesterase  23.27 
 
 		 266 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0245268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2562  metallophosphoesterase  23.68 
 
 		 280 aa  51.2  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.628499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5563  putative UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.18 
 
 		 270 aa  50.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.419435  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1311  metallophosphoesterase  23.58 
 
 		 265 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0951  metallophosphoesterase  21.99 
 
 		 272 aa  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1621  metallophosphoesterase  22.89 
 
 		 270 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4108  metallophosphoesterase  24.28 
 
 		 269 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.575932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3012  hypothetical protein  22.34 
 
 		 315 aa  46.6  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.905594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1338  metallophosphoesterase  24.18 
 
 		 275 aa  45.8  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.535328  normal  0.257841 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1987  metallophosphoesterase  23.79 
 
 		 280 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.247789  normal  0.642917 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2266  metallophosphoesterase  22.45 
 
 		 300 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1630  metallophosphoesterase  22.49 
 
 		 265 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.410034  normal  0.983141 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>