19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0035 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2412  DNA polymerase II small subunit  63.66 
 
 
474 aa  643    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0409  DNA polymerase II small subunit  66.08 
 
 
467 aa  662    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.894742  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0035  DNA polymerase II small subunit  100 
 
 
465 aa  960    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0045  DNA polymerase II small subunit  66.31 
 
 
467 aa  655    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0004  DNA polymerase II small subunit  52.87 
 
 
471 aa  502  1e-141  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1005  DNA polymerase II small subunit  46.28 
 
 
674 aa  395  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0659  DNA polymerase II small subunit  42.65 
 
 
487 aa  381  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.629258  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0817  DNA-directed DNA polymerase  42.24 
 
 
527 aa  334  2e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0685678  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0004  DNA-directed DNA polymerase  40.97 
 
 
517 aa  323  3e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1933  DNA-directed DNA polymerase  41.37 
 
 
514 aa  323  4e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1610  DNA polymerase II small subunit  39.43 
 
 
537 aa  317  3e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1212  DNA polymerase II small subunit  41.27 
 
 
594 aa  315  9e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0003  DNA polymerase II small subunit  39.32 
 
 
588 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.626198 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1166  DNA polymerase II small subunit  41.04 
 
 
640 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0612  DNA-directed DNA polymerase  36.84 
 
 
466 aa  310  5e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1676  DNA polymerase II small subunit  40.91 
 
 
583 aa  294  2e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1005  DNA polymerase II small subunit  40.91 
 
 
578 aa  294  2e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0941  DNA polymerase II small subunit  40.4 
 
 
584 aa  293  3e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0002  DNA polymerase II small subunit  33.05 
 
 
481 aa  262  8e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>