More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1794 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1794  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 		 240 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0456  6-phosphogluconolactonase  58.65 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.52308  normal  0.121254 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4827  6-phosphogluconolactonase  48.39 
 
 		 243 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5294  6-phosphogluconolactonase  48.39 
 
 		 243 aa  186  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5372  6-phosphogluconolactonase  49.76 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.364101 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2644  6-phosphogluconolactonase  49.77 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2354  6-phosphogluconolactonase  43.59 
 
 		 245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  45.19 
 
 		 429 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3272  6-phosphogluconolactonase  48.4 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3477  6-phosphogluconolactonase  49.12 
 
 		 248 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3673  6-phosphogluconolactonase  48.07 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1273  6-phosphogluconolactonase  45.04 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169583  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2308  6-phosphogluconolactonase  50 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0267675 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1889  6-phosphogluconolactonase  48.67 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2814  6-phosphogluconolactonase  45.26 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4158  6-phosphogluconolactonase  47.98 
 
 		 246 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105451  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6709  6-phosphogluconolactonase  47.91 
 
 		 239 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7448  6-phosphogluconolactonase  47.89 
 
 		 240 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.526789  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5038  6-phosphogluconolactonase  37.97 
 
 		 239 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25902 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0529  6-phosphogluconolactonase  45.85 
 
 		 262 aa  158  7e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.77766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1481  6-phosphogluconolactonase  39.75 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.448023  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1348  6-phosphogluconolactonase  42.29 
 
 		 242 aa  155  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1455  6-phosphogluconolactonase  39.66 
 
 		 236 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5183  6-phosphogluconolactonase  37.34 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.908662  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2618  6-phosphogluconolactonase  43.27 
 
 		 241 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2709  6-phosphogluconolactonase  40 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143593  hitchhiker  0.00000000228855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1482  6-phosphogluconolactonase  38.02 
 
 		 241 aa  148  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000109648  normal  0.405401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0535  6-phosphogluconolactonase  35.5 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797573  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1522  6-phosphogluconolactonase  38.4 
 
 		 240 aa  145  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4215  6-phosphogluconolactonase  39.24 
 
 		 240 aa  145  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0227099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4801  6-phosphogluconolactonase  38.83 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.035982  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2698  6-phosphogluconolactonase  42.57 
 
 		 241 aa  142  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2507  6-phosphogluconolactonase  47.87 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2420  6-phosphogluconolactonase  47.87 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1905  6-phosphogluconolactonase  36.36 
 
 		 277 aa  137  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2251  6-phosphogluconolactonase  43.96 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000880456  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3023  6-phosphogluconolactonase  38.26 
 
 		 240 aa  135  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3477  6-phosphogluconolactonase  38.59 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2488  6-phosphogluconolactonase  40.49 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16881  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  39.09 
 
 		 236 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1257  6-phosphogluconolactonase  39.26 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1225  6-phosphogluconolactonase  39.33 
 
 		 245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.277313  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2007  6-phosphogluconolactonase  41.95 
 
 		 261 aa  129  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.750142  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2720  6-phosphogluconolactonase  41.04 
 
 		 252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0053  6-phosphogluconolactonase  42.25 
 
 		 242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09911  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  37.26 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0857733  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2103  6-phosphogluconolactonase  33.6 
 
 		 264 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.22743  normal  0.146892 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1278  6-phosphogluconolactonase  35.02 
 
 		 246 aa  125  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1134  6-phosphogluconolactonase  34.65 
 
 		 232 aa  125  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.488707  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0412  6-phosphogluconolactonase  40.98 
 
 		 245 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2075  6-phosphogluconolactonase  37.18 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00285  6-phosphogluconolactonase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02980)  35.41 
 
 		 265 aa  122  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.757461 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1976  6-phosphogluconolactonase  40 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.731811 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04030  6-phosphogluconolactonase, putative  36.56 
 
 		 373 aa  121  8e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0686  6-phosphogluconolactonase  34.04 
 
 		 240 aa  120  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08091  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  35.54 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.212861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1324  6-phosphogluconolactonase  39.9 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.307725  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2208  6-phosphogluconolactonase  40.93 
 
 		 447 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000925433  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1440  6-phosphogluconolactonase  42.72 
 
 		 243 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.217732  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1628  6-phosphogluconolactonase  39.22 
 
 		 237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179566  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2149  6-phosphogluconolactonase  32.46 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15930  6-phosphogluconolactonase  35.75 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03390  6-phosphogluconolactonase, putative  39.44 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379587  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0340  6-phosphogluconolactonase  36.67 
 
 		 238 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000175267  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1674  6-phosphogluconolactonase  37.04 
 
 		 241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1652  6-phosphogluconolactonase  33.82 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3094  6-phosphogluconolactonase  38.94 
 
 		 256 aa  115  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257113  normal  0.068745 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4692  6-phosphogluconolactonase  39.61 
 
 		 233 aa  115  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0919  6-phosphogluconolactonase  36.41 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1063  6-phosphogluconolactonase  36.41 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.301741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02428  hypothetical protein  35.35 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1131  6-phosphogluconolactonase  38.68 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2753  6-phosphogluconolactonase  32.68 
 
 		 244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0923  6-phosphogluconolactonase, glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase  40.1 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6018  6-phosphogluconolactonase  34.23 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.688301 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003324  6-phosphogluconolactonase eukaryotic type  36.82 
 
 		 238 aa  113  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3178  6-phosphogluconolactonase  38.22 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2536  6-phosphogluconolactonase  34.82 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0945  6-phosphogluconolactonase  34.62 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36519  normal  0.244402 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0177  6-phosphogluconolactonase  34.71 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1645  6-phosphogluconolactonase  39.15 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0205292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1260  6-phosphogluconolactonase  34.78 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0812543  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2978  6-phosphogluconolactonase  37.73 
 
 		 248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0183  6-phosphogluconolactonase  36.89 
 
 		 274 aa  108  5e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11473  6-phosphogluconolactonase  41.86 
 
 		 247 aa  108  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.821995 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08121  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  32.38 
 
 		 244 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1938  6-phosphogluconolactonase  37.23 
 
 		 494 aa  108  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08311  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  32.78 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.29816  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2417  6-phosphogluconolactonase  38.1 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.245714 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08331  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  31.56 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.831569  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0779  6-phosphogluconolactonase  32.52 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0458  6-phosphogluconolactonase  34.25 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2121  6-phosphogluconolactonase  35.71 
 
 		 228 aa  105  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1122  6-phosphogluconolactonase  37.17 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00568285 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2282  6-phosphogluconolactonase  34.39 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.340949  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2242  6-phosphogluconolactonase  35.81 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337212 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82104  6-phosphogluconolactonase-like protein  31.86 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.650309  normal  0.457187 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1833  6-phosphogluconolactonase  38.12 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5191  6-phosphogluconolactonase  38.37 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.646883  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1586  6-phosphogluconolactonase  33.79 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>