More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1404 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  100 
 
 		 438 aa  876    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  65.68 
 
 		 438 aa  569  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  58.6 
 
 		 441 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1623  FolC bifunctional protein  58.37 
 
 		 441 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  58.18 
 
 		 441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  58.18 
 
 		 441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4958  FolC bifunctional protein  57.73 
 
 		 441 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.154774 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  54.5 
 
 		 448 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3380  FolC bifunctional protein  57.5 
 
 		 441 aa  450  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  54.17 
 
 		 448 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  55.99 
 
 		 447 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000041019 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  52.62 
 
 		 442 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  53.33 
 
 		 447 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  51.83 
 
 		 442 aa  438  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  52.28 
 
 		 442 aa  436  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0389  FolC bifunctional protein  53.65 
 
 		 447 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0814  FolC bifunctional protein  51.28 
 
 		 430 aa  411  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2106  FolC bifunctional protein  49.77 
 
 		 442 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0277055  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2022  FolC bifunctional protein  49.54 
 
 		 442 aa  401  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000765521  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0662  FolC bifunctional protein  50.91 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0116745  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  50.81 
 
 		 423 aa  391  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3957  FolC bifunctional protein  49.08 
 
 		 442 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3240  FolC bifunctional protein  52.07 
 
 		 447 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0024  folylpolyglutamate synthase  49.32 
 
 		 470 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4284  FolC bifunctional protein  49.08 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.045669  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0140  FolC bifunctional protein  50.57 
 
 		 444 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  52.4 
 
 		 422 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  48.84 
 
 		 421 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  50 
 
 		 437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  45.75 
 
 		 467 aa  351  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1352  folylpolyglutamate synthase  44.03 
 
 		 440 aa  350  3e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  49.89 
 
 		 435 aa  347  3e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0088  FolC bifunctional protein  48.13 
 
 		 397 aa  339  7e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  49.42 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  49.53 
 
 		 412 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2589  FolC bifunctional protein  49.19 
 
 		 424 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  46.15 
 
 		 432 aa  324  2e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0132  folylpolyglutamate synthase  47.91 
 
 		 422 aa  316  7e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  42.24 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  44.93 
 
 		 453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0844  FolC bifunctional protein  47.13 
 
 		 437 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  39.19 
 
 		 429 aa  300  3e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  41.01 
 
 		 435 aa  295  2e-78  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1061  FolC bifunctional protein  41.22 
 
 		 443 aa  271  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1299  FolC bifunctional protein  40.82 
 
 		 435 aa  266  4e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  39.9 
 
 		 442 aa  260  3e-68  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  39.59 
 
 		 426 aa  251  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  35.16 
 
 		 434 aa  210  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  35.86 
 
 		 425 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1239  FolC bifunctional protein  44.44 
 
 		 437 aa  206  9e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168236  normal  0.703163 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  35.13 
 
 		 429 aa  202  7e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  36.36 
 
 		 447 aa  202  8e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  35.44 
 
 		 431 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 		 432 aa  201  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.48 
 
 		 427 aa  200  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  37.03 
 
 		 427 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  37.18 
 
 		 422 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  32.21 
 
 		 457 aa  197  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  35.02 
 
 		 443 aa  194  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  42.9 
 
 		 386 aa  194  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  35.24 
 
 		 424 aa  193  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  38.62 
 
 		 403 aa  193  6e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.89 
 
 		 466 aa  191  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  34.32 
 
 		 428 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  34.84 
 
 		 459 aa  189  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  35.78 
 
 		 431 aa  189  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  34.61 
 
 		 412 aa  188  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  33.72 
 
 		 416 aa  187  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  40.8 
 
 		 448 aa  186  7e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  32.64 
 
 		 425 aa  186  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  37.28 
 
 		 422 aa  186  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  33.49 
 
 		 418 aa  186  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  33.49 
 
 		 418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  32.77 
 
 		 408 aa  185  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  33.41 
 
 		 441 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  33.87 
 
 		 441 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  35.4 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4618  FolC bifunctional protein  36.52 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.653087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  35.67 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  35.63 
 
 		 425 aa  180  4.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  37.04 
 
 		 440 aa  179  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  31.85 
 
 		 435 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2353  FolC bifunctional protein  37.05 
 
 		 430 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167549  normal  0.0264715 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0880  folylpolyglutamate synthase  31.47 
 
 		 443 aa  178  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0202612  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  32.35 
 
 		 420 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  33.41 
 
 		 429 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  34.59 
 
 		 435 aa  176  5e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  34.59 
 
 		 437 aa  176  5e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3764  FolC bifunctional protein  32.55 
 
 		 435 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1968  FolC bifunctional protein  34.29 
 
 		 428 aa  176  9e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.843796 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1653  dihydrofolate synthase  34.86 
 
 		 421 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  30.34 
 
 		 451 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  32.12 
 
 		 434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  33.48 
 
 		 432 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1757  folylpolyglutamate synthetase  35.65 
 
 		 443 aa  173  5e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000520472  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  33.93 
 
 		 421 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  36.82 
 
 		 426 aa  173  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1531  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 		 435 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  35.04 
 
 		 422 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  34.31 
 
 		 440 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>