More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0796 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0796  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 118 aa  234  4e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0942374 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1739  histone family protein DNA-binding protein  78.79 
 
 		 122 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.269584  decreased coverage  0.000883525 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1668  integration host factor, alpha subunit  55.67 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4386  integration host factor subunit alpha  53.4 
 
 		 105 aa  107  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0651  integration host factor, alpha subunit  54 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749057 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3378  integration host factor, alpha subunit  51.52 
 
 		 125 aa  104  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6231  integration host factor, alpha subunit  52.94 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.75949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1147  integration host factor subunit alpha  56.82 
 
 		 111 aa  100  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.205645  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2924  integration host factor, alpha subunit  56.52 
 
 		 105 aa  100  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0242436  hitchhiker  0.000500218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2677  integration host factor subunit alpha  50 
 
 		 108 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00137939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3021  integration host factor subunit alpha  51.52 
 
 		 118 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4630  integration host factor subunit alpha  52.13 
 
 		 119 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00633863  normal  0.0311538 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1587  integration host factor subunit alpha  48.04 
 
 		 110 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.526192  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1408  integration host factor subunit alpha  49.02 
 
 		 106 aa  97.1  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.422535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2651  integration host factor subunit alpha  51.61 
 
 		 123 aa  96.7  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.030982  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2687  integration host factor subunit alpha  51.61 
 
 		 123 aa  96.7  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.48286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3967  histone family protein DNA-binding protein  47.57 
 
 		 106 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0228483 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7074  integration host factor, alpha subunit  50.49 
 
 		 105 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15437  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0778  integration host factor subunit alpha  55.68 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2518  integration host factor subunit alpha  55.68 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2330  histone family protein DNA-binding protein  52.63 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.45414 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0771  integration host factor subunit alpha  55.68 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.801748  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2055  histone family protein DNA-binding protein  52.63 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2016  histone family protein DNA-binding protein  52.63 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1631  integration host factor subunit alpha  53.41 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3742  integration host factor, alpha subunit  46.88 
 
 		 100 aa  94.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal  0.554438 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0830  integration host factor subunit alpha  53.41 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120813  normal  0.0891496 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3294  integration host factor, alpha subunit  50 
 
 		 105 aa  93.6  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.13347 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1287  integration host factor subunit alpha  53.41 
 
 		 112 aa  93.6  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.921659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1721  integration host factor subunit alpha  53.41 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1198  integration host factor subunit alpha  52.27 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1863  integration host factor subunit alpha  54.02 
 
 		 102 aa  92.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00832208  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0376  histone family protein DNA-binding protein  55.91 
 
 		 171 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.611734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0913  integration host factor subunit alpha  51.14 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1969  integration host factor subunit alpha  45.74 
 
 		 113 aa  90.5  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0019696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1909  integration host factor subunit alpha  45.74 
 
 		 113 aa  90.5  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1994  integration host factor subunit alpha  45.74 
 
 		 113 aa  90.5  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0268  integration host factor, alpha subunit  46 
 
 		 104 aa  90.1  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1783  integration host factor subunit alpha  50 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783563  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1269  integration host factor subunit alpha  48.86 
 
 		 100 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.272817 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2611  integration host factor subunit alpha  48.86 
 
 		 100 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1913  integration host factor subunit alpha  48.86 
 
 		 100 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.749601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1522  integration host factor, alpha subunit  49.47 
 
 		 101 aa  88.2  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00263552  normal  0.735039 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1886  integration host factor, alpha subunit  46.67 
 
 		 99 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.067674 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0639  integration host factor subunit alpha  51.14 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4986  histone family protein DNA-binding protein  48.54 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777024  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3557  integration host factor subunit alpha  51.69 
 
 		 100 aa  84  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3019  integration host factor subunit alpha  48.35 
 
 		 101 aa  80.1  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.616425  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3032  integration host factor subunit alpha  48.86 
 
 		 100 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.814183  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1997  integration host factor subunit alpha  47.92 
 
 		 100 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000120885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2237  integration host factor, alpha subunit  44.57 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0376768 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2608  integration host factor, alpha subunit  44.57 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2365  integration host factor subunit alpha  47.13 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1751  integration host factor, alpha subunit  44.9 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0308436 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1013  integration host factor subunit alpha  45.74 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00925023 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2994  integration host factor, alpha subunit  44.94 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2510  integration host factor subunit alpha  42.55 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0433  integration host factor subunit alpha  42.71 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2671  integration host factor subunit alpha  47.25 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.998853 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2493  integration host factor subunit alpha  43.82 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.044668  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02444  integration host factor subunit alpha  42.39 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0239469  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28720  integration host factor subunit alpha  42.55 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000206678  hitchhiker  0.00000000749265 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0846  integration host factor subunit alpha  46.07 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000670658  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2471  integration host factor subunit alpha  42.55 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3219  integration host factor subunit alpha  42.55 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3475  integration host factor subunit alpha  42.55 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981005  hitchhiker  0.00278356 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1146  integration host factor subunit alpha  43.62 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0580836  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0092  integration host factor, alpha subunit  42.71 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1424  integration host factor, alpha subunit  42.22 
 
 		 93 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000184784  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1731  integration host factor subunit alpha  46.07 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.074622  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1973  integration host factor subunit alpha  42.55 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0364622 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1417  integration host factor, alpha subunit  44.09 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.097817  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2150  integration host factor subunit alpha  41.94 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.872084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1982  integration host factor subunit alpha  42.55 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0219997  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1718  integration host factor subunit alpha  41.94 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000312537  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2384  integration host factor, alpha subunit  42.55 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0917658  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2619  integration host factor subunit alpha  41.94 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.285521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2168  integration host factor subunit alpha  42.55 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1937  integration host factor subunit alpha  42.55 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0682795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0493  integration host factor subunit alpha  45.05 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1826  integration host factor subunit alpha  41.94 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2186  integration host factor subunit alpha  41.94 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.874244  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1456  integration host factor, alpha subunit  43.82 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.405955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1792  integration host factor subunit alpha  41.41 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704445  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01681  integration host factor subunit alpha  41.24 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00950044  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1930  integration host factor, alpha subunit  41.24 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000106762  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20480  integration host factor, alpha subunit  42.22 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2047  integration host factor subunit alpha  40.86 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0240665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2430  integration host factor subunit alpha  41.24 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.446554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1894  integration host factor subunit alpha  40.86 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.585308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1919  integration host factor subunit alpha  41.24 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.445655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2224  histone family protein DNA-binding protein  38.89 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000923552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1996  histone family protein DNA-binding protein  38.89 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1931  integration host factor subunit alpha  41.24 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000683366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1957  integration host factor subunit alpha  40.86 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.126843  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01670  hypothetical protein  41.24 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00452626  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1954  integration host factor subunit alpha  41.24 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.57207  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1918  histone family protein DNA-binding protein  48 
 
 		 92 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000225021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1478  integration host factor subunit alpha  41.24 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2622  histone family protein DNA-binding protein  38.89 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>