More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_R0027 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_R0027  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  1.74629e-06  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0046  tRNA-Gly  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000127996  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0003  tRNA-Gly  93.42 
 
 
76 bp  111  2e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0003  tRNA-Gly  93.42 
 
 
76 bp  111  2e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0003  tRNA-Gly  93.42 
 
 
76 bp  111  2e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0050  tRNA-Gly  94.12 
 
 
76 bp  103  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  1.58922e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0058  tRNA-Gly  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0049  tRNA-Gly  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000536409  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  92.21 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.369409  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0025  tRNA-Gly  92.21 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0017  tRNA-Gly  92.21 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  3.11098e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1718  tRNA-Gly  92.21 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  3.51586e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0066  tRNA-Gly  92.21 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00320497 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1467  tRNA-Gly  92.21 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  4.29546e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0006  tRNA-Gly  92.21 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.285278  hitchhiker  6.41182e-05 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  92.75 
 
 
76 bp  97.6  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  92.21 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0015  tRNA-Gly  92.21 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.55316e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0009  tRNA-Gly  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  7.23102e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0009  tRNA-Gly  92.21 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0539709  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1327  tRNA-Gly  92.21 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0266697  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0039  tRNA-Gly  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.936837  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0053  tRNA-Gly  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0024  tRNA-Gly  90.67 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  3.90894e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0438  tRNA-Gly  91.89 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  6.44893e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2192  tRNA-Gly  90.91 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  5.63667e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0003  tRNA-Gly  91.3 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  1.60282e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0034  tRNA-Gly  90.41 
 
 
73 bp  89.7  9e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0046  tRNA-Gly  90.91 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0761072  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2232  tRNA-Gly  90.91 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  9.40116e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1674  tRNA-Gly  90.91 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  6.49019e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0012  tRNA-Gly  90.91 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0572972  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0022  tRNA-Gly  90.41 
 
 
73 bp  89.7  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0368562  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0022  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0021  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.713807  normal  0.0150575 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0036  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596569  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0028  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0083  tRNA-Gly  92.65 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00487262  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0028  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763177  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0026  tRNA-Gly  93.1 
 
 
76 bp  83.8  5e-15  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.223483  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0019  tRNA-Gly  89.86 
 
 
76 bp  81.8  2e-14  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0017  tRNA-Gly  89.47 
 
 
75 bp  79.8  8e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0047  tRNA-Gly  89.47 
 
 
75 bp  79.8  8e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0323697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0043  tRNA-Gly  89.47 
 
 
75 bp  79.8  8e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0026  tRNA-Gly  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0019  tRNA-Gly  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00502278  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0043  tRNA-Gly  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27027  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0051  tRNA-Gly  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0500664 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  89.47 
 
 
75 bp  79.8  8e-14  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.308145  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0017  tRNA-Gly  89.47 
 
 
75 bp  79.8  8e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt36  tRNA-Gly  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt36  tRNA-Gly  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0040  tRNA-Gly  89.47 
 
 
75 bp  79.8  8e-14  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0056  tRNA-Gly  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0035  tRNA-Gly  89.47 
 
 
75 bp  79.8  8e-14  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.44039e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0028  tRNA-Gly  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0002  tRNA-Gly  91.53 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0001  tRNA-Gly  91.53 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67209  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0048  tRNA-Gly  88.41 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0106217  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0032  tRNA-Gly  89.23 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520916  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0007  tRNA-Gly  88.31 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.98503e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0030  tRNA-Gly  89.23 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.554651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0027  tRNA-Gly  89.23 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.012963  normal  0.0666996 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0004  tRNA-Gly  88.41 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0039  tRNA-OTHER  93.88 
 
 
71 bp  73.8  5e-12  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.022052  normal  0.0225653 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0048  tRNA-Gly  88.41 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  8.63907e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0011  tRNA-Gly  88.31 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  4.46743e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0039  tRNA-Gly  88.41 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265352  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0061  tRNA-Gly  88.31 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0008  tRNA-Gly  88.41 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0034  tRNA-Gly  91.07 
 
 
73 bp  71.9  2e-11  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0051  tRNA-Gly  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0037  tRNA-Gly  91.07 
 
 
73 bp  71.9  2e-11  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0039  tRNA-Gly  91.07 
 
 
73 bp  71.9  2e-11  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.433295  normal  0.207379 
 
 
-
 
NC_002950  PGt18  tRNA-Gly  92.31 
 
 
73 bp  71.9  2e-11  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0033  tRNA-Gly  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.228268  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0018  tRNA-Gly  91.07 
 
 
73 bp  71.9  2e-11  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.746026  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0040  tRNA-Gly  88.16 
 
 
75 bp  71.9  2e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.346214  normal  0.248839 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0041  tRNA-Gly  88.16 
 
 
75 bp  71.9  2e-11  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  6.13233e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0070  tRNA-Gly  88.16 
 
 
75 bp  71.9  2e-11  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00981637  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0043  tRNA-Gly  88.16 
 
 
75 bp  71.9  2e-11  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  8.54209e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0005  tRNA-Ala  90.91 
 
 
76 bp  69.9  8e-11  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  7.81338e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0003  tRNA-Ala  90.91 
 
 
76 bp  69.9  8e-11  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00134196  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0015  tRNA-Gly  89.83 
 
 
75 bp  69.9  8e-11  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  1.58444e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0010  tRNA-Ala  90.91 
 
 
76 bp  69.9  8e-11  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0767985  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-5  tRNA-Ser  93.62 
 
 
67 bp  69.9  8e-11  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0005  tRNA-Ala  90.91 
 
 
73 bp  69.9  8e-11  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0005  tRNA-Ala  90.91 
 
 
76 bp  69.9  8e-11  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000213903  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0060  tRNA-Gly  87.14 
 
 
76 bp  67.9  3e-10  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  6.35466e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0020  tRNA-Gly  87.14 
 
 
76 bp  67.9  3e-10  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0370755  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0015  tRNA-Gly  87.01 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  5.19668e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt52  tRNA-Gly  86.96 
 
 
76 bp  65.9  1e-09  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.894326 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0015  tRNA-Gly  87.01 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0021  tRNA-Gly  86.96 
 
 
76 bp  65.9  1e-09  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  2.0571e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0021  tRNA-Gly  86.96 
 
 
76 bp  65.9  1e-09  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  9.04393e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0806  hypothetical protein  93.33 
 
 
108 bp  65.9  1e-09  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000935428 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0030  tRNA-Gly  86.96 
 
 
76 bp  65.9  1e-09  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121021  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0025  tRNA-Gly  87.01 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42192  normal  0.527647 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0040  tRNA-Gly  87.01 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0019  tRNA-Gly  85.53 
 
 
76 bp  63.9  5e-09  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000726864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>