More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2616 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2616  50S ribosomal protein L2  100 
 
 		 275 aa  555  1e-157  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0160883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  81.45 
 
 		 275 aa  453  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1864  50S ribosomal protein L2  77.01 
 
 		 277 aa  414  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0213539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  64 
 
 		 275 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  64.23 
 
 		 277 aa  355  3.9999999999999996e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0246  50S ribosomal protein L2  65.45 
 
 		 276 aa  353  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0249  50S ribosomal protein L2  65.45 
 
 		 276 aa  353  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  64.6 
 
 		 275 aa  352  4e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3706  50S ribosomal protein L2  64.36 
 
 		 277 aa  351  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  65.09 
 
 		 276 aa  349  3e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  62.91 
 
 		 276 aa  348  6e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  62.77 
 
 		 280 aa  347  9e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  62.91 
 
 		 279 aa  345  4e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  65.69 
 
 		 276 aa  345  5e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  65.69 
 
 		 276 aa  345  5e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0956  50S ribosomal protein L2  68.25 
 
 		 274 aa  343  1e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00125176  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  61.31 
 
 		 276 aa  343  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  62.77 
 
 		 275 aa  342  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1135  50S ribosomal protein L2  64.6 
 
 		 275 aa  342  4e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000903374  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  63.04 
 
 		 276 aa  342  5e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  62.68 
 
 		 276 aa  341  5.999999999999999e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  62.41 
 
 		 275 aa  341  9e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 		 275 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  62.5 
 
 		 287 aa  338  8e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  63.04 
 
 		 275 aa  338  8e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  61.23 
 
 		 276 aa  337  9e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  60.87 
 
 		 276 aa  337  9e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  61.68 
 
 		 274 aa  337  9.999999999999999e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 		 276 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 		 276 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  63.04 
 
 		 276 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  62.32 
 
 		 276 aa  335  2.9999999999999997e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 277 aa  335  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 277 aa  335  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  61.59 
 
 		 276 aa  335  5e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  62.04 
 
 		 274 aa  334  1e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  61.23 
 
 		 276 aa  333  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  61.23 
 
 		 276 aa  333  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  61.23 
 
 		 276 aa  333  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  61.23 
 
 		 276 aa  333  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  61.23 
 
 		 276 aa  333  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  60 
 
 		 277 aa  333  2e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  61.23 
 
 		 276 aa  333  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  61.23 
 
 		 276 aa  333  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0373  50S ribosomal protein L2  57.97 
 
 		 287 aa  332  3e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  61.4 
 
 		 287 aa  332  3e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  61.99 
 
 		 279 aa  332  4e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  60.79 
 
 		 279 aa  332  5e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  62.18 
 
 		 275 aa  332  5e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1126  50S ribosomal protein L2  58.7 
 
 		 287 aa  332  6e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20001  50S ribosomal protein L2  58.7 
 
 		 287 aa  332  6e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.738026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  60.51 
 
 		 287 aa  331  8e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1958  50S ribosomal protein L2  58.33 
 
 		 287 aa  330  1e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23051  50S ribosomal protein L2  59.19 
 
 		 287 aa  329  4e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  57.82 
 
 		 275 aa  327  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  59.93 
 
 		 276 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16751  50S ribosomal protein L2  58.82 
 
 		 287 aa  326  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  61.09 
 
 		 275 aa  326  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  60.51 
 
 		 275 aa  325  3e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17461  50S ribosomal protein L2  59.19 
 
 		 287 aa  324  7e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17371  50S ribosomal protein L2  59.19 
 
 		 287 aa  324  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1647  50S ribosomal protein L2  59.19 
 
 		 287 aa  324  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  61.09 
 
 		 273 aa  322  3e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  60.14 
 
 		 277 aa  322  4e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  60.14 
 
 		 277 aa  322  4e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  60.51 
 
 		 277 aa  322  6e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17621  50S ribosomal protein L2  59.26 
 
 		 287 aa  322  6e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  61.69 
 
 		 274 aa  320  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0845  ribosomal protein L2  62.04 
 
 		 276 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2229  50S ribosomal protein L2  58.67 
 
 		 287 aa  319  3e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.425308 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0352  50S ribosomal protein L2  58.12 
 
 		 277 aa  319  3.9999999999999996e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000147687  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0590  50S ribosomal protein L2  61.09 
 
 		 278 aa  318  6e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.886345 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1762  50S ribosomal protein L2  62.04 
 
 		 276 aa  317  1e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00807764  normal  0.409688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0691  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 278 aa  316  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  58.39 
 
 		 274 aa  316  2e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3140  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 278 aa  316  3e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.524365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1295  50S ribosomal protein L2  58.82 
 
 		 287 aa  315  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000231184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  58.12 
 
 		 278 aa  315  4e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  62.04 
 
 		 274 aa  315  6e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1029  50S ribosomal protein L2  56.32 
 
 		 277 aa  314  9.999999999999999e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000494173  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2061  50S ribosomal protein L2  61.15 
 
 		 279 aa  314  9.999999999999999e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000364134  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  59.78 
 
 		 277 aa  313  9.999999999999999e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  58.33 
 
 		 278 aa  313  1.9999999999999998e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  3.4720999999999997e-28 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1282  ribosomal protein L2  59.06 
 
 		 275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0565  50S ribosomal protein L2  60.58 
 
 		 277 aa  312  2.9999999999999996e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  57.09 
 
 		 283 aa  312  3.9999999999999997e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0663  50S ribosomal protein L2  63.21 
 
 		 282 aa  311  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000112808  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1914  50S ribosomal protein L2  59.78 
 
 		 282 aa  311  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  60 
 
 		 277 aa  311  9e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4312  50S ribosomal protein L2  62.04 
 
 		 279 aa  311  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2656  ribosomal protein L2  60 
 
 		 278 aa  310  1e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29710  LSU ribosomal protein L2P  60 
 
 		 279 aa  310  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0037  50S ribosomal protein L2  57.25 
 
 		 276 aa  310  1e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00257974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0936  50S ribosomal protein L2  60.22 
 
 		 274 aa  310  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000014248  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  61.31 
 
 		 276 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0630  ribosomal protein L2  60.36 
 
 		 278 aa  310  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  58.39 
 
 		 276 aa  310  2e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3902  50S ribosomal protein L2  62.18 
 
 		 278 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0258  ribosomal protein L2  56.57 
 
 		 276 aa  309  2.9999999999999997e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1043  50S ribosomal protein L2  60.73 
 
 		 278 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>