More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0785 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0785  FeS assembly ATPase SufC  100 
 
 
251 aa  511  1e-144  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00319351  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0474  FeS assembly ATPase SufC  71.6 
 
 
256 aa  384  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.754758  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1007  FeS assembly ATPase SufC  73.06 
 
 
247 aa  378  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.515464 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0859  FeS assembly ATPase SufC  64.11 
 
 
253 aa  332  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00902291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0843  FeS assembly ATPase SufC  64.11 
 
 
253 aa  332  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  63.31 
 
 
253 aa  329  2e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3579  FeS assembly ATPase SufC  61.51 
 
 
261 aa  323  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5120  ABC transporter, ATP-binding protein  61.11 
 
 
261 aa  322  4e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5123  FeS assembly ATPase SufC  61.11 
 
 
261 aa  322  4e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4851  ABC transporter ATP-binding protein  61.11 
 
 
261 aa  321  7e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4692  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  61.11 
 
 
261 aa  321  7e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5217  ABC transporter ATP-binding protein  61.11 
 
 
261 aa  321  7e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4707  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  60.71 
 
 
261 aa  319  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5088  FeS assembly ATPase SufC  60.71 
 
 
261 aa  319  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5125  FeS assembly ATPase SufC  60.71 
 
 
261 aa  319  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0115  FeS assembly ATPase SufC  60.71 
 
 
261 aa  319  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4805  FeS assembly ATPase SufC  60.71 
 
 
261 aa  318  7e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.874646  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0891  FeS assembly ATPase SufC  60.64 
 
 
265 aa  313  9.999999999999999e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1974  ABC-type transport system for Fe-S cluster assembly, ATPase component  61.48 
 
 
256 aa  314  9.999999999999999e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  60.8 
 
 
259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0218  ABC transporter ATP-binding protein  61.48 
 
 
256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  60 
 
 
259 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  61.48 
 
 
256 aa  312  3.9999999999999997e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4168  FeS assembly ATPase SufC  60.24 
 
 
252 aa  311  4.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141156  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  60.74 
 
 
250 aa  311  5.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0960  FeS assembly ATPase SufC  60.63 
 
 
259 aa  308  6.999999999999999e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.531756  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  59.11 
 
 
257 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0487  FeS assembly ATPase SufC  58.78 
 
 
252 aa  302  4.0000000000000003e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.364835 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0986  FeS assembly ATPase SufC  59.92 
 
 
261 aa  298  6e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  59.76 
 
 
254 aa  297  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4730  FeS assembly ATPase SufC  58.94 
 
 
256 aa  292  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  55.06 
 
 
250 aa  291  6e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  54.66 
 
 
250 aa  291  7e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1114  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  56.79 
 
 
256 aa  291  9e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.539485  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  55.1 
 
 
253 aa  288  4e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  56.22 
 
 
250 aa  289  4e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  54.84 
 
 
262 aa  288  5.0000000000000004e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2038  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  56.15 
 
 
266 aa  288  7e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  55.74 
 
 
253 aa  287  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0538  FeS assembly ATPase SufC  59.43 
 
 
250 aa  286  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703052  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2271  FeS assembly ATPase SufC  57.68 
 
 
247 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193787  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3966  FeS assembly ATPase SufC  56.2 
 
 
251 aa  285  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0797  FeS assembly ATPase SufC  55.02 
 
 
261 aa  285  5.999999999999999e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.554265  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3444  FeS assembly ATPase SufC  55.2 
 
 
260 aa  285  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  hitchhiker  0.0000000668282 
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  55.69 
 
 
250 aa  284  1.0000000000000001e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  55.92 
 
 
251 aa  282  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  55.51 
 
 
248 aa  282  4.0000000000000003e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0999  FeS assembly ATPase SufC  56.63 
 
 
256 aa  281  9e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0817  ABC transporter ATP-binding protein  56.33 
 
 
280 aa  281  9e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4468  FeS assembly ATPase SufC  57.68 
 
 
249 aa  281  9e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0427  FeS assembly ATPase SufC  56.57 
 
 
256 aa  281  9e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0416  FeS assembly ATPase SufC  56.57 
 
 
256 aa  281  9e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  54.69 
 
 
249 aa  281  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0728  FeS assembly ATPase SufC  56.33 
 
 
280 aa  281  1e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1467  FeS assembly ATPase SufC  57.43 
 
 
251 aa  279  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0406739  normal  0.0473468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5847  FeS assembly ATPase SufC  58.09 
 
 
250 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0102923  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1861  FeS assembly ATPase SufC  54.92 
 
 
263 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0413  FeS assembly ATPase SufC  52.9 
 
 
263 aa  279  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5930  ABC transporter associated with Fe-S cluster assembly, ATP binding protein  55.1 
 
 
253 aa  279  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01978  FeS assembly ATPase SufC  55.82 
 
 
254 aa  279  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.486472  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1435  FeS assembly ATPase SufC  53.69 
 
 
263 aa  278  5e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.157604  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0708  FeS assembly ATPase SufC  54.62 
 
 
260 aa  278  8e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0726  FeS assembly ATPase SufC  57.66 
 
 
249 aa  278  8e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.860961  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1780  FeS assembly ATPase SufC  56.61 
 
 
251 aa  277  9e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1663  FeS assembly ATPase SufC  55.28 
 
 
249 aa  277  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.193199  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0241  hypothetical protein  54.62 
 
 
249 aa  277  1e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2227  FeS assembly ATPase SufC  56.28 
 
 
255 aa  277  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000208508  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1969  FeS assembly ATPase SufC  57.09 
 
 
249 aa  277  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01361  ABC transporter, ATP binding component  53.28 
 
 
263 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.16399  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  52.61 
 
 
255 aa  276  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2743  FeS assembly ATPase SufC  54.84 
 
 
252 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.858995  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1898  FeS assembly ATPase SufC  55.33 
 
 
261 aa  276  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1507  FeS assembly ATPase SufC  54.07 
 
 
264 aa  276  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274467  normal  0.26759 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1674  FeS assembly ATPase SufC  55.16 
 
 
252 aa  276  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.305783  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1236  FeS assembly ATPase SufC  54.69 
 
 
246 aa  276  3e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2254  FeS assembly ATPase SufC  55.1 
 
 
251 aa  275  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  54.44 
 
 
250 aa  275  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  54.29 
 
 
252 aa  275  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1984  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  56 
 
 
253 aa  275  5e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192658  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2960  FeS assembly ATPase SufC  56 
 
 
253 aa  275  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5151  FeS assembly ATPase SufC  56.85 
 
 
257 aa  275  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0932  ABC transporter, ATP-binding protein  55.1 
 
 
251 aa  275  6e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0926  FeS assembly ATPase SufC  55.1 
 
 
280 aa  275  6e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262969  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0991  FeS assembly ATPase SufC  54.37 
 
 
254 aa  274  8e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2489  FeS assembly ATPase SufC  55.69 
 
 
258 aa  274  8e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2327  FeS assembly ATPase SufC  54.07 
 
 
249 aa  274  8e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.486674  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0304  FeS assembly ATPase SufC  53.85 
 
 
260 aa  274  8e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.553044  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3310  FeS assembly ATPase SufC  54.92 
 
 
257 aa  274  9e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0266816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1898  FeS assembly ATPase SufC  57.02 
 
 
262 aa  274  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111846 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0085  FeS assembly ATPase SufC  55.92 
 
 
253 aa  273  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0405  FeS assembly ATPase SufC  54.62 
 
 
262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.300963  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  52.85 
 
 
261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4270  FeS assembly ATPase SufC  54.69 
 
 
256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2105  FeS assembly ATPase SufC  56.61 
 
 
251 aa  272  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.147981 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0697  FeS assembly ATPase SufC  54.51 
 
 
262 aa  272  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.85326  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2839  FeS assembly ATPase SufC  54.03 
 
 
251 aa  272  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5108  FeS assembly ATPase SufC  55.6 
 
 
250 aa  272  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2337  FeS assembly ATPase SufC  55.51 
 
 
252 aa  272  4.0000000000000004e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  53.6 
 
 
250 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3354  FeS assembly ATPase SufC  51.63 
 
 
254 aa  272  5.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.267766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>