More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4225 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4225  ABC transporter related  100 
 
 
384 aa  736    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00831393 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7234  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  61.63 
 
 
384 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1781  ABC transporter related  61.19 
 
 
397 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2365  ABC transporter related  62.68 
 
 
365 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0817479  hitchhiker  0.00312127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0236  ABC transporter-like  61.11 
 
 
374 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127209  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0350  ABC transporter  57.62 
 
 
376 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100794  normal  0.782008 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31520  ABC transporter, ATP-binding component  61.92 
 
 
385 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5188  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  59.36 
 
 
343 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34270  putative ATP-binding component of ABC transporter  60.97 
 
 
369 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0220  ABC transporter ATP-binding protein  58.64 
 
 
369 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.333916  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0235  ABC transporter related  58.64 
 
 
369 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2912  ABC transporter ATP-binding protein  60.4 
 
 
366 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0244  ABC transporter related  58.24 
 
 
369 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177795  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4992  ABC transporter related  57.18 
 
 
369 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0311  ABC metal ion transporter, ATPase subunit  57.3 
 
 
398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0853  ABC methionine transporter, ATPase subunit  55.23 
 
 
386 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00389788  hitchhiker  0.00726443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2681  ABC transporter related  54.47 
 
 
372 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4539  ABC transporter related  55.44 
 
 
386 aa  354  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342354  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3029  ABC transporter related  54.57 
 
 
394 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193089  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5337  ABC transporter related  54.57 
 
 
394 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874002  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3393  ABC transporter related  61.52 
 
 
391 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4931  ABC transporter related  57.02 
 
 
392 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247063  normal  0.893842 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4687  ABC transporter related  56.58 
 
 
391 aa  349  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00669309  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5216  ABC transporter related  60.38 
 
 
391 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329969 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1867  ABC transporter, ATP-binding protein  58.93 
 
 
380 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0621935  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0448  methionine ABC transporter ATP-binding protein  58.93 
 
 
404 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0546  methionine ABC transporter ATP-binding protein  58.57 
 
 
405 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1439  ABC transporter, ATP-binding protein  58.26 
 
 
361 aa  332  8e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0858  methionine ABC transporter ATP-binding protein  58.31 
 
 
404 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2174  methionine ABC transporter ATP-binding protein  58.31 
 
 
404 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5613  ABC transporter related  54.25 
 
 
388 aa  325  6e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.309158  normal  0.370742 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  48.98 
 
 
344 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1145  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.87 
 
 
377 aa  319  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  51.47 
 
 
352 aa  316  4e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0902  ABC transporter, ATP-binding protein  51.18 
 
 
352 aa  314  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.07 
 
 
355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1395  ABC transporter related  50.88 
 
 
337 aa  309  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5160  ABC transporter related  55.01 
 
 
388 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  48.77 
 
 
340 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0563  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.84 
 
 
356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3485  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.83 
 
 
335 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  48.02 
 
 
339 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0129  ABC D-methionine uptake transporter, ATPase subunit  55.18 
 
 
353 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539804  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3856  DL-methionine transporter subunit  66.12 
 
 
274 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  47.42 
 
 
339 aa  299  6e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2457  ABC transporter related  48.5 
 
 
368 aa  299  6e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3582  ABC transporter-related protein  50 
 
 
341 aa  298  9e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0126168  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0920  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51 
 
 
350 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  47.11 
 
 
339 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1766  ABC transporter related  54.57 
 
 
353 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129001  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  46.81 
 
 
339 aa  297  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4491  ABC transporter related  53.87 
 
 
387 aa  297  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  47.11 
 
 
339 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  47.11 
 
 
339 aa  297  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  47.11 
 
 
339 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  46.81 
 
 
339 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  47.42 
 
 
339 aa  298  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  47.11 
 
 
339 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  46.24 
 
 
344 aa  297  3e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.85 
 
 
335 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4809  ABC transporter related  47.73 
 
 
341 aa  296  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00917748  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1610  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.76 
 
 
368 aa  295  8e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4696  ABC transporter, ATP-binding protein  47.13 
 
 
341 aa  294  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000324387  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4331  NLPA lipoprotein  53.47 
 
 
353 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0798419  normal  0.109457 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5092  ABC transporter, ATP-binding protein  47.13 
 
 
341 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5129  ABC transporter, ATP-binding protein  46.83 
 
 
397 aa  293  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4855  ABC transporter ATP-binding protein  46.83 
 
 
341 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5222  ABC transporter ATP-binding protein  46.83 
 
 
341 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0353533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5127  ABC transporter, ATP-binding protein  46.83 
 
 
341 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  51.97 
 
 
340 aa  294  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5125  ABC transporter, ATP-binding protein  46.83 
 
 
341 aa  293  3e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000057454  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4503  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.76 
 
 
335 aa  293  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5262  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  48.93 
 
 
335 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4711  ABC transporter, ATP-binding protein  46.83 
 
 
341 aa  293  4e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00233149  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0790  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.86 
 
 
349 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264335  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  46.2 
 
 
339 aa  293  4e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3225  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.13 
 
 
382 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384288  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1447  ABC transporter related  62.3 
 
 
342 aa  292  6e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513841  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0861  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.86 
 
 
349 aa  292  8e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232562  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  58.42 
 
 
354 aa  292  8e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03093  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.47 
 
 
335 aa  291  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2100  ABC transporter related  48.84 
 
 
347 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0429  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.66 
 
 
344 aa  291  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4306  ABC transporter related  50 
 
 
377 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0111  ABC transporter, ATP-binding protein  46.53 
 
 
341 aa  290  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000413393  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0838  ABC transporter related  47.15 
 
 
341 aa  291  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00107302  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0854  ABC transporter related  47.15 
 
 
341 aa  291  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000171814  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  50.96 
 
 
342 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  49.85 
 
 
351 aa  290  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6304  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.15 
 
 
335 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1397  ABC transporter-related protein  47.58 
 
 
341 aa  289  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2785  ABC transporter related  49.86 
 
 
359 aa  289  7e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.06 
 
 
343 aa  288  8e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0129  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.8 
 
 
335 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.131021 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.86 
 
 
344 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.48 
 
 
343 aa  287  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.48 
 
 
343 aa  287  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.48 
 
 
343 aa  287  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.48 
 
 
343 aa  287  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.48 
 
 
343 aa  287  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>