More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4958 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4958  FolC bifunctional protein  100 
 
 
441 aa  871  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.154774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  96.6 
 
 
441 aa  833  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3380  FolC bifunctional protein  85.03 
 
 
441 aa  706  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  84.58 
 
 
441 aa  730  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1623  FolC bifunctional protein  83.9 
 
 
441 aa  710  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  96.83 
 
 
441 aa  834  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  58.29 
 
 
448 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  58.41 
 
 
438 aa  483  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  56.19 
 
 
442 aa  471  1e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  56.22 
 
 
442 aa  471  1e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  57.6 
 
 
448 aa  465  1e-130  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  57.14 
 
 
442 aa  459  1e-128  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  55.48 
 
 
447 aa  460  1e-128  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  58.45 
 
 
447 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  4.1019e-06 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  55.56 
 
 
438 aa  444  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0389  FolC bifunctional protein  57.64 
 
 
447 aa  440  1e-122  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251585  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0814  FolC bifunctional protein  53.36 
 
 
430 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2022  FolC bifunctional protein  52.4 
 
 
442 aa  422  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000765521  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2106  FolC bifunctional protein  52.63 
 
 
442 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0277055  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  54.38 
 
 
421 aa  422  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0662  FolC bifunctional protein  54.42 
 
 
440 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0116745  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3240  FolC bifunctional protein  55.5 
 
 
447 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0024  folylpolyglutamate synthase  52.6 
 
 
470 aa  415  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3957  FolC bifunctional protein  52.53 
 
 
442 aa  401  1e-110  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755042  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4284  FolC bifunctional protein  53.46 
 
 
442 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.045669  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  52.74 
 
 
423 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  53.65 
 
 
422 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0140  FolC bifunctional protein  52.05 
 
 
444 aa  395  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0132  folylpolyglutamate synthase  55.07 
 
 
422 aa  364  2e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  51.29 
 
 
412 aa  362  5e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  51.49 
 
 
424 aa  362  9e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  50.34 
 
 
437 aa  358  2e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2589  FolC bifunctional protein  51.49 
 
 
424 aa  355  6e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500866  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  51.68 
 
 
435 aa  352  5e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1352  folylpolyglutamate synthase  43.39 
 
 
440 aa  351  1e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  45.5 
 
 
467 aa  346  5e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  49.77 
 
 
432 aa  342  8e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0088  FolC bifunctional protein  47.61 
 
 
397 aa  321  1e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  45.06 
 
 
453 aa  312  7e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0844  FolC bifunctional protein  48.39 
 
 
437 aa  306  5e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  39.05 
 
 
429 aa  296  4e-79  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  40.05 
 
 
434 aa  295  9e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  40.62 
 
 
435 aa  295  1e-78  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1061  FolC bifunctional protein  40.99 
 
 
443 aa  266  6e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  41.04 
 
 
426 aa  248  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  37.5 
 
 
442 aa  245  1e-63  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1299  FolC bifunctional protein  39.53 
 
 
435 aa  243  4e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  36.34 
 
 
427 aa  216  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  34.86 
 
 
425 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  34.17 
 
 
457 aa  210  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.37038e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1077  FolC bifunctional protein (tetrahydrofolate synthase) (folylpolyglutamate synthase)  34.79 
 
 
426 aa  204  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  38.33 
 
 
424 aa  202  1e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  34.24 
 
 
428 aa  201  2e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1239  FolC bifunctional protein  37.82 
 
 
437 aa  200  4e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168236  normal  0.703163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  37.47 
 
 
424 aa  200  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  34.66 
 
 
443 aa  199  9e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  31.46 
 
 
418 aa  199  1e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  31.22 
 
 
418 aa  198  2e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  32.87 
 
 
432 aa  197  2e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  34.49 
 
 
412 aa  196  5e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  36.13 
 
 
422 aa  196  7e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  34.34 
 
 
447 aa  194  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  35.81 
 
 
431 aa  193  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  33.1 
 
 
429 aa  192  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  34.98 
 
 
422 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  36.51 
 
 
448 aa  191  3e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  36.94 
 
 
422 aa  191  3e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  31.93 
 
 
420 aa  189  6e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  41.74 
 
 
386 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3331  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  36.15 
 
 
420 aa  188  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0040495  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  32.71 
 
 
424 aa  189  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  36.32 
 
 
434 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  34.56 
 
 
459 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  34.89 
 
 
423 aa  185  1e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  32.53 
 
 
424 aa  185  1e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  32.78 
 
 
437 aa  184  2e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  35.85 
 
 
427 aa  184  2e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  32.94 
 
 
435 aa  184  2e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  33.49 
 
 
416 aa  184  2e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3814  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  35.78 
 
 
434 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  34.95 
 
 
424 aa  184  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  36.53 
 
 
422 aa  184  4e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  37.18 
 
 
442 aa  183  5e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  31.53 
 
 
438 aa  183  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  35.2 
 
 
423 aa  182  8e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  35.2 
 
 
423 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2797  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  33.96 
 
 
422 aa  182  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03098  folylpolyglutamate synthase  33.96 
 
 
406 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1653  dihydrofolate synthase  33.03 
 
 
421 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133997  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.02 
 
 
421 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  35.75 
 
 
432 aa  181  3e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  38.26 
 
 
440 aa  181  3e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  34.93 
 
 
423 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  38.34 
 
 
403 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  34.93 
 
 
423 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1618  FolC bifunctional protein  38.4 
 
 
421 aa  180  5e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0841806  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 
436 aa  180  5e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  36.06 
 
 
421 aa  179  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  36.06 
 
 
425 aa  179  9e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.02 
 
 
431 aa  177  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>