43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0097 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0097  hypothetical protein  100 
 
 
74 aa  150  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0436933 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2425  hypothetical protein  71.83 
 
 
92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0466471  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0128  hypothetical protein  57.35 
 
 
105 aa  88.2  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.846367  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2179  hypothetical protein  56.94 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0335  ArsR family transcriptional regulator  50.7 
 
 
90 aa  80.9  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.760075  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1546  hypothetical protein  54.93 
 
 
97 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.181501  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3511  hypothetical protein  55.71 
 
 
97 aa  79.3  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2048  hypothetical protein  61.4 
 
 
68 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.127236  normal  0.734823 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1493  hypothetical protein  52.94 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0311  transcriptional regulator, ArsR family  57.38 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0184  ArsR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
87 aa  77.4  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0369  transcriptional regulator, ArsR family  53.85 
 
 
88 aa  77  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325844  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2901  transcriptional regulator, ArsR family  54.55 
 
 
92 aa  76.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709611  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0395  ArsR family transcriptional regulator  53.97 
 
 
93 aa  75.9  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2439  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  75.5  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5111  hypothetical protein  48.48 
 
 
86 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0184609  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1304  hypothetical protein  51.56 
 
 
93 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3207  hypothetical protein  50 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.545553  normal  0.143226 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2832  transcription regulator, ArsR like protein  50 
 
 
93 aa  69.7  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2906  transcription regulator, ArsR like protein  50 
 
 
92 aa  70.1  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4868  hypothetical protein  47.69 
 
 
88 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3307  hypothetical protein  50 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4534  hypothetical protein  46.15 
 
 
88 aa  67.8  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0549  hypothetical protein  48.48 
 
 
90 aa  67.4  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100425  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3045  hypothetical protein  50 
 
 
106 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2199  transcriptional regulator, MarR family  46.88 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0497  hypothetical protein  49.18 
 
 
81 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0908673  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2055  transcriptional regulator, ArsR family  48.33 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2597  hypothetical protein  44.62 
 
 
76 aa  63.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.993958  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0921  NAD(+) kinase  45.31 
 
 
332 aa  63.2  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3645  hypothetical protein  46.27 
 
 
99 aa  62.8  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2450  hypothetical protein  46.97 
 
 
77 aa  60.5  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3617  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.54 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2209  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
105 aa  57  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.325426 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3279  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
86 aa  55.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  39.68 
 
 
366 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1623  hypothetical protein  39.13 
 
 
131 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0247815 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0973  hypothetical protein  42.19 
 
 
85 aa  51.6  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1077  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
293 aa  51.2  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0527045 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1268  NAD(+) kinase  39.34 
 
 
326 aa  50.4  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0445  conserved hypothetical protein  43.94 
 
 
78 aa  50.1  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1331  ATP-NAD/AcoX kinase  43.75 
 
 
326 aa  46.6  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.441471  normal  0.309814 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1971  ATP-NAD/AcoX kinase  39.34 
 
 
293 aa  47  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0382489  hitchhiker  0.00000000370023 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>