66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7024 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  54.21 
 
 
3286 aa  2776    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  72.91 
 
 
3521 aa  2195    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  62.64 
 
 
3238 aa  2343    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  75.52 
 
 
2900 aa  4339    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  74.45 
 
 
2899 aa  4241    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6221  hypothetical protein  74.86 
 
 
729 aa  1053    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  82.3 
 
 
2140 aa  3585    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 
3006 aa  6070    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  39.87 
 
 
1100 aa  513  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  39.89 
 
 
1101 aa  493  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  38.52 
 
 
1051 aa  494  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  40.03 
 
 
1092 aa  490  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  39.91 
 
 
1133 aa  488  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  36.41 
 
 
1219 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  36.83 
 
 
1221 aa  444  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  35.67 
 
 
1543 aa  444  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  36.06 
 
 
1341 aa  439  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3382  Phage-related protein tail component-like protein  37.52 
 
 
1103 aa  436  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000619193 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  35.75 
 
 
1816 aa  437  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  34.35 
 
 
1061 aa  415  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  34.82 
 
 
1188 aa  413  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  34.03 
 
 
1067 aa  412  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  35.46 
 
 
1116 aa  390  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  35.32 
 
 
1116 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  35.27 
 
 
1120 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  35.56 
 
 
1137 aa  384  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  34.91 
 
 
1120 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  32.87 
 
 
1057 aa  382  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  35.01 
 
 
1132 aa  380  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  34.13 
 
 
1194 aa  381  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  34.82 
 
 
1132 aa  380  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  35.01 
 
 
1159 aa  380  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  35.01 
 
 
1132 aa  380  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  35.23 
 
 
1159 aa  379  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  33.38 
 
 
2007 aa  381  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  35.29 
 
 
1158 aa  375  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  35.29 
 
 
1158 aa  375  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  35.47 
 
 
1157 aa  372  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  35.06 
 
 
1157 aa  363  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3248  hypothetical protein  61.04 
 
 
425 aa  362  5e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  34.47 
 
 
1159 aa  360  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  34.47 
 
 
1159 aa  359  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  34.43 
 
 
1157 aa  358  1e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  32.56 
 
 
1059 aa  353  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  38.28 
 
 
522 aa  332  9e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  36.01 
 
 
1012 aa  316  3.9999999999999997e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  34.68 
 
 
881 aa  216  5.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3247  hypothetical protein  49.15 
 
 
287 aa  214  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  36.25 
 
 
951 aa  193  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  31.98 
 
 
837 aa  151  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3498  Phage-related protein tail component-like protein  25.06 
 
 
960 aa  147  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1994  phage tail fiber protein  30.03 
 
 
1564 aa  135  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.38979  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  25.82 
 
 
2196 aa  128  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1639  Phage-related protein tail component-like protein  23.48 
 
 
918 aa  80.1  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1315  Hedgehog/intein hint domain protein  40 
 
 
1115 aa  75.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  23.13 
 
 
1644 aa  67.8  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293426 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3558  hypothetical protein  28.92 
 
 
1172 aa  64.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2685  Phage-related protein tail component-like protein  31.67 
 
 
1171 aa  60.8  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3534  hypothetical protein  31.18 
 
 
1438 aa  59.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1850  hypothetical protein  24.92 
 
 
417 aa  55.5  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1851  hypothetical protein  26.86 
 
 
270 aa  53.1  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459823  normal  0.905068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2669  hypothetical protein  30.63 
 
 
214 aa  52  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1270  hypothetical protein  40 
 
 
762 aa  50.1  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3893  hypothetical protein  40 
 
 
762 aa  50.1  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3499  hypothetical protein  27.35 
 
 
833 aa  48.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4217  hypothetical protein  29.17 
 
 
284 aa  48.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>