26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0718 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0718  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  386  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00551171  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1117  hypothetical protein  89.64 
 
 		 193 aa  349  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.5096 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0876  hypothetical protein  62.77 
 
 		 211 aa  229  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142948  hitchhiker  0.000478384 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0862  hypothetical protein  61.5 
 
 		 202 aa  221  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0926  hypothetical protein  62.57 
 
 		 201 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0887  hypothetical protein  62.57 
 
 		 201 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3508  hypothetical protein  34.78 
 
 		 187 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1633  hypothetical protein  33.15 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205753 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1148  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  95.9  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1951  hypothetical protein  33.87 
 
 		 187 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1664  hypothetical protein  34.91 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.616027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2071  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  33.15 
 
 		 188 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1401  hypothetical protein  30.81 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.537695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3054  hypothetical protein  32.74 
 
 		 194 aa  88.6  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1785  hypothetical protein  33.51 
 
 		 192 aa  87.8  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127834  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0881  hypothetical protein  29.12 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.428041  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1409  hypothetical protein  30.27 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0624  hypothetical protein  25.56 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1321  hypothetical protein  25.54 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0892  conserved hypothetical conserved membrane protein  25 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.86862  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0581  hypothetical protein  31.93 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0581  hypothetical protein  31.93 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1020  hypothetical protein  22.78 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2679  hypothetical protein  29.77 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2217  integral membrane protein-like  26.32 
 
 		 174 aa  48.5  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0840  integral membrane protein-like protein  27.84 
 
 		 181 aa  41.2  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>