292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0044 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5467  heat shock protein 90  73.83 
 
 
610 aa  877    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306325  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0044  heat shock protein 90  92.28 
 
 
611 aa  1121    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0044  heat shock protein 90  100 
 
 
611 aa  1221    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0960  heat shock protein 90  71.62 
 
 
626 aa  867    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.515332  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1028  heat shock protein 90  71.62 
 
 
626 aa  872    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162426  normal  0.169491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1155  heat shock protein 90  71.45 
 
 
626 aa  867    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3087  heat shock protein 90  62.13 
 
 
606 aa  727    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0452  heat shock protein 90  67.71 
 
 
629 aa  817    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0072  heat shock protein 90  48.16 
 
 
626 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1326  heat shock protein 90  49.11 
 
 
624 aa  552  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4692  heat shock protein 90  49.18 
 
 
628 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.595162  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4673  heat shock protein 90  48.07 
 
 
631 aa  547  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25549  normal  0.0194601 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2812  heat shock protein 90  46.89 
 
 
637 aa  543  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5302  heat shock protein 90  48.29 
 
 
628 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3632  heat shock protein 90  47.33 
 
 
638 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5351  heat shock protein 90  48.62 
 
 
630 aa  540  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.514382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0826  heat shock protein 90  47.02 
 
 
657 aa  537  1e-151  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.257658 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4272  heat shock protein 90  45.12 
 
 
643 aa  529  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4402  heat shock protein 90  48.04 
 
 
628 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626215  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4929  heat shock protein 90  47.87 
 
 
620 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.621243 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6025  heat shock protein 90  45.41 
 
 
630 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0873  heat shock protein 90  44.43 
 
 
628 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000721641  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1017  heat shock protein 90  44.43 
 
 
628 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000769643  normal  0.045663 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1407  Heat shock protein Hsp90-like protein  41.16 
 
 
623 aa  499  1e-140  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  43.73 
 
 
636 aa  489  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1592  heat shock protein 90  44.16 
 
 
633 aa  488  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1609  heat shock protein 90  40.51 
 
 
630 aa  485  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0614  heat shock protein 90  43.11 
 
 
626 aa  485  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00438217  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1910  heat shock protein 90  44.43 
 
 
650 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.194345 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1771  heat shock protein 90  43.5 
 
 
633 aa  483  1e-135  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000171528  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0851  heat shock protein 90  44.31 
 
 
643 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415809  normal  0.667015 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0416  heat shock protein 90  43.18 
 
 
633 aa  479  1e-134  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000647765  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2506  heat shock protein 90  42.83 
 
 
633 aa  479  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595688  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3587  heat shock protein 90  43.11 
 
 
629 aa  482  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2342  heat shock protein 90  43.46 
 
 
633 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1078  heat shock protein 90  43.13 
 
 
633 aa  476  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0117405  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0920  heat shock protein 90  43.99 
 
 
643 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1277  heat shock protein 90  38.71 
 
 
635 aa  472  1e-132  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.318066  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1718  heat shock protein 90  43.59 
 
 
634 aa  474  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  43.15 
 
 
652 aa  473  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0958  heat shock protein 90  39.61 
 
 
617 aa  473  1e-132  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0466  heat shock protein 90  42.55 
 
 
650 aa  474  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0475  heat shock protein 90  42.55 
 
 
650 aa  473  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0953677 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0860  heat shock protein Hsp90  43.89 
 
 
628 aa  475  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2113  heat shock protein 90  41.52 
 
 
630 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0435  ATP-binding region ATPase domain protein  43.13 
 
 
640 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2002  Heat shock protein Hsp90-like protein  43.24 
 
 
626 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000463529  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3329  heat shock protein 90  42.09 
 
 
634 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2497  heat shock protein 90  41.8 
 
 
632 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.558694  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1216  heat shock protein 90  42.09 
 
 
632 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1175  heat shock protein 90  41.65 
 
 
650 aa  469  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1138  heat shock protein 90  42.97 
 
 
623 aa  470  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.145495  unclonable  0.0000000382364 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43850  heat shock protein 90  41.19 
 
 
634 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3161  heat shock protein 90  43.39 
 
 
625 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0144125 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1375  heat shock protein 90  39.72 
 
 
645 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000122327  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00424  heat shock protein 90  41.64 
 
 
624 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.318011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3137  heat shock protein Hsp90  41.64 
 
 
624 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145833  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2390  heat shock protein 90  41.33 
 
 
650 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0516  heat shock protein 90  41.64 
 
 
624 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117874  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2893  heat shock protein 90  41.61 
 
 
624 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.661781  normal  0.181179 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0550  heat shock protein 90  41.64 
 
 
624 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0208648  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3055  heat shock protein 90  41.61 
 
 
622 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0703  heat shock protein 90  39.52 
 
 
609 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2263  heat shock protein 90  43.6 
 
 
632 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0564  heat shock protein 90  41.64 
 
 
624 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0215188  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2143  heat shock protein 90  39.56 
 
 
644 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000328119  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3195  heat shock protein 90  41.61 
 
 
624 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228822  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0405  heat shock protein 90  41.64 
 
 
624 aa  467  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103102  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3143  heat shock protein 90  41.64 
 
 
624 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00327164  normal  0.0320085 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0932  heat shock protein 90  43.2 
 
 
632 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294237  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0511  heat shock protein 90  41.64 
 
 
624 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00679401  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00429  hypothetical protein  41.64 
 
 
624 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.304335  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4289  heat shock protein 90  41.47 
 
 
668 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1689  heat shock protein 90  41.16 
 
 
634 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.05546  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  41.16 
 
 
634 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0990  heat shock protein 90  43.06 
 
 
640 aa  464  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0890084  normal  0.343937 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1548  heat shock protein 90  42.2 
 
 
630 aa  462  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00180815  normal  0.134338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2208  heat shock protein HtpG  40.93 
 
 
635 aa  465  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3502  heat shock protein 90  41.16 
 
 
634 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.791518  normal  0.824555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3678  heat shock protein 90  40.67 
 
 
634 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2491  heat shock protein 90  41.57 
 
 
634 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2017  heat shock protein 90  40.67 
 
 
637 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5686  heat shock protein 90  43.35 
 
 
632 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1735  heat shock protein 90  42.65 
 
 
632 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1997  heat shock protein 90  40.06 
 
 
619 aa  464  1e-129  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2347  heat shock protein 90  42.65 
 
 
632 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75134  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2368  heat shock protein 90  42.65 
 
 
632 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231362  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4976  heat shock protein 90  41.16 
 
 
678 aa  461  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144438  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1625  heat shock protein 90  40.58 
 
 
634 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3750  heat shock protein 90  41.12 
 
 
634 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0814  heat shock protein 90  42.29 
 
 
632 aa  461  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1158  heat shock protein 90  42.52 
 
 
632 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.789148  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1109  heat shock protein 90  41.1 
 
 
639 aa  462  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01327  heat shock protein 90  41.28 
 
 
634 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2232  heat shock protein 90  40.38 
 
 
639 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000100055  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2383  heat shock protein 90  42.81 
 
 
632 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1372  heat shock protein 90  41.88 
 
 
647 aa  460  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145654  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1054  heat shock protein 90  41.55 
 
 
630 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374422  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2480  heat shock protein 90  40.31 
 
 
640 aa  457  1e-127  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1318  heat shock protein 90  42.36 
 
 
632 aa  458  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>