152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1452 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1452  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 112 aa  225  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00178124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0038  excinuclease ABC subunit C  58.97 
 
 		 97 aa  100  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0136  excinuclease ABC subunit C  56.96 
 
 		 140 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0137  excinuclease ABC subunit C  56.96 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0489368 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0131  excinuclease ABC subunit C  56.96 
 
 		 141 aa  98.2  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0136  excinuclease ABC subunit C  54.32 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4217  excinuclease ABC subunit C  53.16 
 
 		 163 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0140  Excinuclease ABC C subunit domain protein  54.43 
 
 		 166 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0145  hypothetical protein  55.7 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0606  hypothetical protein  46.15 
 
 		 94 aa  89.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.383877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0141  excinuclease ABC subunit C  51.9 
 
 		 92 aa  86.7  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0115  excinuclease ABC subunit C  51.19 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0136  excinuclease ABC subunit C  50.63 
 
 		 167 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0133  excinuclease ABC subunit C  49.38 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0098  excinuclease ABC subunit C  51.9 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807182  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0145  endonuclease  50 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2824  excinuclease ABC subunit C  47.62 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3592  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.67 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394656  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0675  hypothetical protein  48.28 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4370  excinuclease ABC subunit C  46.15 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4762  excinuclease ABC subunit C  41.94 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000128421 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0550  Excinuclease ABC C subunit domain protein  51.28 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0821  GIY-YIG nuclease superfamily protein  41.67 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594813  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03022  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3616  GIY-YIG nuclease superfamily protein  50 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02973  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3625  GIY-YIG nuclease superfamily protein  44.44 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.791399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3347  GIY-YIG nuclease superfamily protein  50 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3638  GIY-YIG nuclease superfamily protein  50 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0543  GIY-YIG nuclease superfamily protein  50 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.792444 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3453  Excinuclease ABC C subunit domain protein  49.37 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.472079  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4475  GIY-YIG nuclease superfamily protein  50 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3451  GIY-YIG nuclease superfamily protein  50 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3457  GIY-YIG nuclease superfamily protein  44.44 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3459  GIY-YIG nuclease superfamily protein  44.44 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3528  GIY-YIG nuclease superfamily protein  44.44 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3565  GIY-YIG nuclease superfamily protein  44.44 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0597  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40.66 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3578  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.91 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4013  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.91 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3712  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.91 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1438  excinuclease ABC subunit C  43.59 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1103  excinuclease ABC subunit C  40.24 
 
 		 87 aa  75.1  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3334  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.84 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.692644  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05350  hypothetical protein  40.48 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0507  excinuclease ABC subunit C  46.15 
 
 		 117 aa  72  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02607  hypothetical URI domain endonuclease  45.78 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2327  excinuclease ABC subunit C  46.25 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.418538  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1731  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.76 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.26715  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000538  excinuclease ABC C subunit  38.82 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.559483  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3600  excinuclease ABC subunit C  38.55 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0544  excinuclease ABC subunit C  38.55 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  40.23 
 
 		 330 aa  67  0.00000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  39.24 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  39.24 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5558  excinuclease ABC subunit C  34.52 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1139  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.56 
 
 		 80 aa  62.8  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1952  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.53 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03940  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.9 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2084  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.47 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000359134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1525  endonuclease  36.59 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2257  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.05 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2636  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.11 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.303825  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0879  endo/excinuclease domain-containing protein  34.48 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3752  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.84 
 
 		 84 aa  62  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1073  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.04 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081744 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2891  excinuclease ABC subunit C  36.71 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.625064  normal  0.178968 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1608  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.18 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.143422  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13970  predicted endonuclease containing a URI domain protein  38.46 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  36.47 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.44 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000181458  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0126  hypothetical protein  37.66 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1257  GIY-YIG nuclease superfamily protein  36.36 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0448  excinuclease ABC subunit C  41.89 
 
 		 79 aa  60.1  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4401  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  33.33 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2851  Excinuclease ABC C subunit domain protein  30.11 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14150  GIY-YIG nuclease superfamily protein  38.75 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.121781  normal  0.153151 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0080  excinuclease ABC subunit C  30.86 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.76446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1435  excinuclease ABC subunit C  37.18 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2278  excinuclease ABC subunit C  33.71 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0732686  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2943  Excinuclease ABC C subunit domain protein  30.11 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2759  excinuclease ABC subunit C  35.44 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00570056  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2126  Excinuclease ABC C subunit domain protein  31.96 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2919  endonuclease  33.33 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3617  putative excinuclease, subunit C  33.73 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2472  excinuclease ABC subunit C  37.33 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3553  GIY-YIG nuclease superfamily protein  35.9 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.158193 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2171  excinuclease ABC subunit C  37.04 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000951078 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5743  excinuclease ABC subunit C  38.75 
 
 		 289 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2420  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.180406 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3608  GIY-YIG nuclease superfamily protein  32.53 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.942188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1804  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2416  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21070  predicted endonuclease containing a URI domain  32.93 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0876  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.644539 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1867  Excinuclease ABC C subunit domain protein  30.86 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000216284  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2326  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3398  hypothetical protein  35 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2461  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0254  excinuclease ABC subunit C  33.68 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>