27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0137 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0137  hypothetical protein  100 
 
 
427 aa  863    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0278483 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2075  protein of unknown function DUF917  27.88 
 
 
405 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.416017 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5611  hypothetical protein  27.2 
 
 
405 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2260  hypothetical protein  25.99 
 
 
409 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294656  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1967  hypothetical protein  29.2 
 
 
369 aa  76.3  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3582  protein of unknown function DUF917  28.57 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0428  hypothetical protein  24.48 
 
 
362 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.232081 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1543  hypothetical protein  23.73 
 
 
371 aa  64.3  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0429  hypothetical protein  23.74 
 
 
367 aa  63.9  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329691  normal  0.645536 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1824  hypothetical protein  27.24 
 
 
367 aa  62.4  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0864  protein of unknown function DUF917  25.09 
 
 
366 aa  62  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125947  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4084  hypothetical protein  22.55 
 
 
381 aa  59.7  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3135  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22870  hypothetical protein  26.86 
 
 
368 aa  59.3  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.594068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2417  hypothetical protein  23.49 
 
 
367 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1994  protein of unknown function DUF917  23.51 
 
 
369 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1849  hypothetical protein  22.22 
 
 
361 aa  54.7  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2201  protein of unknown function DUF917  24.51 
 
 
372 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0395  hypothetical protein  26.32 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1347  hypothetical protein  20.23 
 
 
370 aa  48.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2140  protein of unknown function DUF917  22.19 
 
 
362 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4113  hypothetical protein  22.86 
 
 
360 aa  47  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4195  hypothetical protein  21.9 
 
 
374 aa  46.6  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0569866  normal  0.0852747 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3065  protein of unknown function DUF917  22.42 
 
 
369 aa  46.6  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1546  hypothetical protein  23.38 
 
 
366 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1726  hypothetical protein  20.54 
 
 
369 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3585  protein of unknown function DUF917  23.38 
 
 
365 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0098  hypothetical protein  22.63 
 
 
358 aa  44.3  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>