More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1111 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1111  cyclic nucleotide-binding  100 
 
 
729 aa  1469    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.804267  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0056  cyclic nucleotide-binding  32.77 
 
 
739 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1175  sulphate transporter  30.41 
 
 
730 aa  300  9e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0317024  normal  0.332491 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5025  cyclic nucleotide-binding  29.77 
 
 
749 aa  289  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0554599  normal  0.33022 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2926  hypothetical protein  27.29 
 
 
721 aa  270  8.999999999999999e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3069  hypothetical protein  27.32 
 
 
721 aa  266  8e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0030  sulfate transporter  26.89 
 
 
734 aa  247  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127752  normal  0.27039 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0366  putative sulfate transporter  26.33 
 
 
727 aa  209  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.972082  normal  0.273026 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0635  putative sulfate permease with cyclic nucleotide-binding domain  24.97 
 
 
733 aa  182  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0466798  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03665  sulfate transporter family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12440)  23.88 
 
 
1053 aa  173  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85698  sulfate transporter Sulfate/bicarbonate/oxalate exchanger SAT-1 and related transporters (SLC26 family)  24.96 
 
 
963 aa  167  5.9999999999999996e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.525688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1342  cyclic nucleotide-binding  27.71 
 
 
731 aa  155  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00680  vacuole protein, putative  23.36 
 
 
1177 aa  148  3e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0220987  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42556  predicted protein  22.02 
 
 
964 aa  138  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162025  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3904  cyclic nucleotide-binding:Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  23.19 
 
 
736 aa  137  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50333  predicted protein  25.69 
 
 
619 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  23.08 
 
 
747 aa  99  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1474  sulphate transporter  24.14 
 
 
560 aa  89.7  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.525598  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2465  sulphate transporter  23.69 
 
 
546 aa  89.4  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320203  decreased coverage  0.00514746 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50075  predicted protein  19.5 
 
 
955 aa  89  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  25.38 
 
 
563 aa  87  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0119  sulfate permease family protein  23.12 
 
 
548 aa  86.3  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42555  predicted protein  23.6 
 
 
1159 aa  86.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.240204  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  22.22 
 
 
568 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0754  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  24.14 
 
 
573 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1867  sulphate transporter  23.43 
 
 
557 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  23.6 
 
 
587 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3908  sulphate transporter  22.49 
 
 
557 aa  80.1  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1831  putative sulfate transporter  24.9 
 
 
560 aa  79.7  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.505905  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  24.79 
 
 
606 aa  80.1  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1119  sulphate transporter  22.11 
 
 
546 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.977726 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  24.34 
 
 
558 aa  79  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  22.83 
 
 
558 aa  77  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1136  sulfate transporter  22.68 
 
 
572 aa  77  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5693  sulphate transporter  23.96 
 
 
548 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.108223 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4401  sulphate transporter  21.64 
 
 
549 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  34.85 
 
 
226 aa  76.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4315  sulphate transporter  21.64 
 
 
549 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1459  SulP family sulfate permease  21.65 
 
 
551 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.032999  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22210  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  26.36 
 
 
601 aa  75.1  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2603  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  24.42 
 
 
570 aa  75.1  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  23.37 
 
 
552 aa  74.7  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0743  sulphate transporter  24.78 
 
 
594 aa  74.7  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  21.43 
 
 
568 aa  74.3  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002556  sulfate permease family protein  21.6 
 
 
556 aa  74.3  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790014  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0840  sulfate transporter  22.8 
 
 
559 aa  73.9  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4695  sulphate transporter  21.64 
 
 
549 aa  73.9  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.582462  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  21.29 
 
 
570 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1553  sulphate anion transporter  23.69 
 
 
553 aa  72.4  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364529  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  24.43 
 
 
550 aa  72.4  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1992  sulphate transporter  24.25 
 
 
559 aa  72  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.998362 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  23.74 
 
 
730 aa  71.6  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.36 
 
 
226 aa  71.6  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2371  sulphate transporter  22.83 
 
 
604 aa  70.9  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.364425 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  21.53 
 
 
567 aa  70.9  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03456  hypothetical protein  20.58 
 
 
562 aa  70.9  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1983  sulphate transporter  23.56 
 
 
509 aa  70.5  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0343473 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  21.59 
 
 
567 aa  69.7  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2050  sulphate transporter  21.91 
 
 
571 aa  69.7  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.135317 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1731  SulP family sulfate permease  21.44 
 
 
551 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.281721  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2506  sulfate permease  24.4 
 
 
581 aa  68.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037188  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3029  sulphate transporter  24.23 
 
 
549 aa  68.9  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  20.48 
 
 
568 aa  68.6  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1078  sulfate transporter  22.5 
 
 
552 aa  67.8  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408762  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  22.02 
 
 
556 aa  67  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1108  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.8 
 
 
1075 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000733786  normal  0.267995 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.85 
 
 
220 aa  67.4  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  26.94 
 
 
563 aa  66.6  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0062  sulfate permease family protein  22.76 
 
 
553 aa  66.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000218031  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02105  permease protein of sulfate transporter  22.57 
 
 
550 aa  65.9  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.862998  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1754  sulfate permease family protein  20.89 
 
 
536 aa  65.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0323665  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0615  sulphate transporter  24.89 
 
 
540 aa  65.5  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  23.62 
 
 
581 aa  65.1  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2305  sulphate transporter  22.76 
 
 
549 aa  65.1  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1643  sulphate transporter  23.26 
 
 
583 aa  64.7  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  24.95 
 
 
586 aa  64.7  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0223  sulphate transporter  24.03 
 
 
553 aa  64.7  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0891  putative sulfate transporter  23.4 
 
 
565 aa  63.9  0.000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0504  putative sulfate transporter  23.75 
 
 
558 aa  63.9  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.602665  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.91 
 
 
225 aa  63.9  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  30.91 
 
 
225 aa  63.9  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0549  sulphate transporter  21.81 
 
 
483 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  22.94 
 
 
552 aa  63.9  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  33.64 
 
 
225 aa  63.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4228  sulphate transporter  24.6 
 
 
536 aa  62.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.91 
 
 
225 aa  63.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.43 
 
 
242 aa  62.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
225 aa  62.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  21.97 
 
 
579 aa  62.4  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  24.15 
 
 
624 aa  62.4  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  21.76 
 
 
583 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0741  sulphate transporter  26.61 
 
 
586 aa  62  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4982  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  23.81 
 
 
552 aa  62  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0985  putative sulfate transporter  21.57 
 
 
549 aa  62  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1906  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  23.44 
 
 
562 aa  61.2  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1617  sulfate permease family protein  24.95 
 
 
521 aa  61.2  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0125947  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1105  sulphate transporter  21.83 
 
 
541 aa  61.2  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  28.7 
 
 
228 aa  61.2  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02853  low affinity sulfate transporter  23.12 
 
 
545 aa  61.2  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  21.84 
 
 
560 aa  60.8  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>